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Q&A

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SMARTer® ThruPLEX®/SMARTer® PicoPLEX® Kit 共通Q&A

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Q1 ThruPLEX/PicoPLEX Kitの保存温度は?
A1  -20℃で保存してください。
Q2 ThruPLEX/PicoPLEX Kitの有効期限は?
A2  適切な保存条件下で、製品到着後1年です。
Q3 増幅反応に高フィデリティー酵素が使用されているか?
A3  はい。ThruPLEX/PicoPLEX Kitには正確性、増幅効率が高く、バイアスの少ないDNAポリメラーゼが使用されています。
Q4 ThruPLEX/PicoPLEX Kitはどんなサーマルサイクラーが使用できるか?
A4  50 μlの反応液量に対応できるサーマルサイクラーを使用する必要があります。ご自身のPCR機器のマニュアルをご確認ください。
Q5 ThruPLEX/PicoPLEXライブラリーを作製するために、キット以外にどのような試薬が必要か?
A5  ライブラリー作製後、Agencourt AMPure XP beads(Beckman Coulter社、Code No.A63880)を使用してサンプルを精製する必要があります。必要な試薬、備品は各キットのユーザーマニュアルをご確認ください。
Q6 ThruPLEX/PicoPLEX Kitの試薬は、全てボルテックスによって混合できるか?
A6  いいえ。使用前にバッファーとNuclease Free Waterはボルテックスし、軽くスピンダウンしてください。酵素はピペッティングによって穏やかに混合後、軽くスピンダウンしてください。インデックスプレートは使用前に軽くスピンダウンしてください。
Q7 ThruPLEX/PicoPLEX Kitはメチル化解析に使用できるか?
A7  いいえ。メチル化解析には使用できません。メチル化解析にはEpiXplore Meth-Seq DNA Enrichment Kitをご使用ください。
Q8 ThruPLEX/PicoPLEX Kitで作製したライブラリーはマイクロアレイまたはPCR分析に使用できるか?
A8  はい。
Q9 リアルタイムPCRにおすすめの蛍光色素は?
A9  EvaGreen蛍光色素(Biotium社、Code No.31000、EvaGreen Dye、20×水溶液)は高感度で、ThruPLEX/PicoPLEX Kitの増幅反応への影響が少ないため適しています。
Q10 PCR増幅を行わずにライブラリー調製可能か?
A10  いいえ。ThruPLEX/PicoPLEX Kitによるライブラリー作製にはPCR増幅が必要です。増幅ステップの詳細は各キットのユーザーマニュアルをご確認ください。
Q11 増幅後のThruPLEX/PicoPLEX Kitのライブラリーは追加増幅までどれくらい保存できるか?
A11  未精製の増幅ライブラリーは精製または追加増幅を行うまで、-20℃、7日間まで保存できます。詳細は各キットのユーザーマニュアルをご確認ください。
Q12 ThruPLEX/PicoPLEX Kitはシングルインデックスまたはデュアルインデックスを使用するか?
A12  各種インデックスがあります。下記のシングルインデックス、デュアルインデックスを選択してください。
SMARTer DNA HT Dual Index Kits
SMARTer DNA HT Dual Index Kitは、SMARTer ThruPLEXおよびSMARTer PicoPLEX Kitで使用するために設計されたイルミナ社シーケンサーでのマルチプレックスシーケンシング用のライブラリーを構築するためのインデックスキットである。 本キットには、イルミナ社Nextera XT Index Kit v2のインデックス配列を持つインデックスPCRプライマーが含まれており、最大384個のサンプルのマルチプレックス解析が可能なdual indexを提供する。インデックスPCRプライマーは、異なるインデックスプレートに分注された製品が4種類提供され、それぞれ最大のdual indexの組み合わせの4分の1ずつを含んでいる。(製品コード R400660~R400663)。またSMARTer DNA HT Dual Index Kit - 24N(製品コード R400664)は異なるdual indexコンビネーションを含む24本のチューブのセットである。各dual indexチューブ(24N)には、最大2回の使用に十分な容量が含まれる。dual indexプレート(96N Set A~D)の各ウェルには、1回の使用に十分な量が含まれる。
SMARTer DNA Unique Dual Index Kits
SMARTer DNA Unique Dual Index Kitは、SMARTer ThruPLEXおよびSMARTer PicoPLEX Kitで使用するために設計されたイルミナ社シーケンサーでのマルチプレックスシーケンシング用のライブラリーを構築するためのインデックスキットである。これらのキットには“IDT for Illumina UD”ユニークデュアルインデックス配列を持つインデックスPCRプライマーが含まれており、最大96個のサンプルのマルチプレックス解析が可能なdual indexを提供する。インデックスPCRプライマーは24本のチューブに予め分注されたセットが4種類提供され、それぞれ最大のdual indexの組み合わせの4分の1ずつを含んでいる。(製品コード R400665~R400668)。各dual indexチューブ(24U Set A~D)には、最大2回の使用に十分な容量が含まれる。
SMARTer DNA Single Index Kits
SMARTer DNA Single Index Kitは、SMARTer ThruPLEX KitおよびSMARTer PicoPLEX Kitで使用するために設計されたイルミナ社シーケンサーでのマルチプレックスシーケンシング用のライブラリーを構築するためのインデックスキットである。本キットには、イルミナ社TruSeq Single Index Kitのインデックス配列を持つインデックスPCRプライマーが含まれており、最大24個のサンプルのマルチプレックス解析が可能なsingle indexを提供する。インデックスPCRプライマーは12本のチューブに予め分注されたセットが2種類提供され、それぞれ最大のsingle indexの組み合わせの2分の1ずつを含んでいる(製品コード R400695、R400697)。各single indexチューブ(12S Set A、12S Set B)には、最大8回の使用に十分な容量が含まれる。
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