PrimerArray® Embryonic Stem Cells

ヒトES細胞株の品質評価

ヒトES細胞株KhES-1およびKhES-3のEarly passage（Early）、Late passage（Late）、Differentiated（Diff）の3段階の培養細胞サンプルから調製したRNAを用いて、幹細胞関連発現遺伝子の発現変動を解析した。

【解析結果から】
ヒトES細胞2株において、遺伝子発現のパターンはEarly vs. Lateでは変動が少なく、vs. Diffで大きく変動した。KhES-1、KhES-3の株間でも遺伝子発現に若干の相違が認められた。また、Early vs. Diffにおいて、マイクロアレイ解析データからPrimerArray搭載遺伝子を抽出し、その発現変動量をPrimerArrayとマイクロアレイで比較したところ、両者に高い相関が認められた。本製品を用いた多能性幹細胞株に特異的な遺伝子発現の確認は、ES細胞株の品質評価指標のひとつとして利用できると考えられる。

ES細胞株間の比較解析（PH016）
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遺伝子発現パターンの解析（PrimerArray）
遺伝子発現パターンの解析		 遺伝子発現パターンの解析（マイクロアレイ）
遺伝子発現パターンの解析
PrimerArrayとマイクロアレイの相関
マイクロアレイの相関
鋳型各ES細胞由来total RNA
逆転写反応PrimeScript RT Master Mix (Perfect Real Time）
（製品コード RR036A）
qPCRTB Green Premix Ex Taq II (Tli RNaseH Plus)
（製品コード RR820A）
qPCRの鋳型逆転写反応液　各0.4 μl（total RNA 20 ng相当）
プライマー本製品（製品コード PH016）
qPCR装置Thermal Cycler Dice Real Time System II
（製品コード TP900）
解析ツールPrimerArray Analysis Tool for Embryonic Stem Cells

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