• 豊富なアレイ解析実績にもとづいた、確実・安心の受託サービスをご提供
• 組織や細胞からのRNA抽出、解析後のデータマイニングなどトータルにサポート
• 広いダイナミックレンジと高い再現性により、低発現遺伝子の変動も逃さずキャッチ
• 微量RNAからの解析にも対応

アジレント社認定のサービスプロバイダーとして、各種アレイを用いた網羅的な遺伝子発現解析を行います。遺伝子工学に熟練した技術者と充実した設備により、精度の高い受託サービスを提供いたします。
ご要望に応じて、微量total RNA（500 pg以上、濃度100 pg/μl以上）からの解析、解析後のデータマイニングを行います。
また、KEGGサービスプロバイダーとして納品データにKEGGパスウェイリンクを付加しています。

• 遺伝子発現解析用マイクロアレイ
  ヒト、マウス、ラットでは、アジレント社のSurePrint技術によりさらに高密度化を実現したSurePrint G3 Gene Expression 8x60Kアレイを受託解析にご利用いただけます。ヒトおよびマウスについては、新しいプローブコンテンツの搭載によりコーディング領域のカバー率が大幅に向上しただけでなく、linc RNA（large intervening non-coding RNA）などのnon-coding RNAに対するプローブも搭載されています。
  解析目的に応じて下記アレイリストより最適なプラットフォームをご利用ください。
  
  

  生物種	製品名	コンテンツ	参照データベース
  ヒト	SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K v3	26,083 Entrez gene RNAs, 30,606 lncRNAs	RefSeq Build 66 / Ensemble Release 76 / Unigene Build 236 / GenBank (Aug 2014) など
  マウス	SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K v2	27,122 Entrez gene RNAs, 4,578 lncRNAs	RefSeq Build 66 / Ensembl Release 76 / Unigene Build 236 / GenBank (Aug 2014) など
  	SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8x60K	24,321 Entrez gene RNAs, 4,576 lncRNAs	RefSeq Build 37 / Ensembl Release 55 / Unigene Build 176 / GenBank (Apr 2009) など
  ラット	SurePrint G3 Rat Gene Expression 8x60K v2	30,584 Entrez gene RNAs	RefSeq Build 66 /  Ensembl Release 76 / Unigene Build  236 / GenBank (Aug 2014) など
  	SurePrint G3 Rat Gene Expression 8x60K	19,742 Entrez gene RNAs	RefSeq Build 36.2 / Ensembl Release 55 / Unigene Build 177 / GenBank (Jan 2009) など

  
  
  モデル生物

  生物種	製品名	生物種	製品名	生物種	製品名
  シロイヌナズナ	Arabidopsis (V4)	ダイズ	Soybean	イネ	Rice
  大麦	Barley	小麦	Wheat	トウモロコシ	Corn（Maize）
  トマト	Tomato	セイヨウアブラナ	Brassica	綿（ワタ）	Cotton
  タバコ	Tobacco	タルウマゴヤシ	Medicago	犬	Canine (V2)
  豚	Porcine (V2)	馬	Horse	羊	Sheep
  ニワトリ	Chicken (V2)	牛	Bovine (V2)	ウサギ	Rabbit
  アカゲザル	Rhesus Monkey (V2)	ゼブラフィッシュ	Zebrafish (V3)	サケ	Salmon
  蚊	Mosquito	ショウジョウバエ	Drosophila (V2)	線虫	C. elegans (V2)
  アフリカツメガエル	Xenopus (V2)	酵母	Yeast (V2)	イネいもち病菌	Magnaporthe (V2)
  大腸菌	E. coli

  各アレイのバージョンなどは変更となる場合があります。アレイ詳細についてはアジレント社ホームページをご覧ください。
  旧アレイでの解析をご希望の場合は、別途お問い合わせください。


• Agilent Array特長
  少量サンプルからの解析：「Low Input Quick Amp Labeling Kit（LIQA）」により、少ないtotal RNA（数10 ng）からの解析が可能です。
  高品質アレイ：SurePrintテクノロジーで印刷された60 merの高品質カスタムオリゴアレイです。また、スポットは常に均一であるため高い精度のデータを算出します。
  5ケタのダイナミックレンジ：プローブ設計、ハイブリ条件を最適化することで、5ケタのダイナミックレンジのデータが算出されます。これによりノイズに埋もれていた低発現遺伝子の網羅的解析が可能になります。
  

■チラシをご覧ください。

アレイ発現解析受託サービス

遺伝子発現解析受託サービス

total RNAをご送付いただき、比較する組み合わせをご指定ください。1色法の解析で、ラベル化cRNAの作製、ハイブリダイゼーション、スキャニングなどの一連の作業を行い、シグナルデータおよび比較解析データをお返しいたします。解析にはアジレント社が推奨する試薬・ソフトウェアを使用し、標準化を行った数値化データ（スケーリングデータ）も納品いたします。
ヒト、マウス、ラット（SurePrint G3 Gene Expression 8x60Kアレイ）では、タカラバイオ独自のオリジナルビューワAquaでデータをお返しします。操作性が向上し、PCのOSによらず、Macintoshでもスムーズにデータを閲覧頂けます。 また通常納品物に、有意差検定ツール(t-test)などをお付けしています。

※	組織・細胞からのRNA抽出やデータマイニングなどのオプション作業も充実しております。
※	ヒト、マウスおよびラット各アレイでは、フォーマットや使用試薬などが異なるデータを比較することができません。データの比較が必要な場合は、同一アレイで解析されることを推奨します。
※	生物種によってはKEGGパスウェイリンクを付加できないものもあります。

【オプションサービス】
（サンプル調製）

• 組織や細胞からのRNA抽出／DNase I 処理／サンプル再精製（純度が低いRNAの精製）
• 微量total RNA（500 pg以上、濃度100 pg/μl以上）からの増幅

（解析）

• データマイニング
• Perfect Real Timeサポートシステム
• DNAチップ（マイクロアレイ）作製

※現在大変混みあっており、通常納期での対応が難しい状況です。納期はお問い合わせください。

1色法での解析の場合

・オンライン注文では、事務手続き、作業内容を簡便化することによって低価格対応しております。オンライン注文に関してはこちらからアクセスしてください。
・11検体以上は別途お問い合わせください。
・各種オプションサービス（RNA抽出、データマイニングなど）が可能です。別途お問い合わせください。

• 作業報告書
  • ご依頼内容、RNA品質検定結果、解析結果の概要をまとめた作業報告書です。
• 解析補足資料（PDFファイル）
  • RNA品質基準、解析プロトコール、データ算出方法などを詳細に記載した、解析内容をご理解いただくための参考資料です。
• Rawデータ
  • 数値化ソフトウェア「Agilent Feature Extraction」を用いて得られた、サンプル間の正規化前の解析結果です。
• RNA QCレポート、ハイブリダイゼーション QCレポート
  • RNAの品質検定レポート、ハイブリダイゼーションの品質確認レポートです。
• 解析データおよびオリジナルビューワ「Aqua」
  • Adobe AIR上で動く弊社オリジナルビューワ「Aqua」での結果閲覧や各種ツールにて解析をして頂けます。パソコンのOSによらずお使い頂けます。Excelよりも操作性が向上し、膨大なデータをスピーディーに閲覧頂けます。解析結果データはSQLite3形式で記述されています。
  • 解析データと遺伝子情報が一つのファイルにまとまっており、データを効率よく確認できます。またアジレント・テクノロジー株式会社より提供された遺伝子情報に加え、KEGG Pathway IDを付加・リンクしており、簡単にパスウェイの情報を入手できます。
  
  
  （1）シグナルデータ
  1アレイごとにシグナル値を補正したスケーリングデータをまとめたファイルです。 各検体間での転写産物のシグナル強度の比較などにご利用ください。
  
  
  （2）発現比率データ
  シグナルデータを用いて検体間の発現比率を算出したファイルです。
  
  
  （3）変動遺伝子データ
  発現比率ファイルから変動（2倍以上、1/2倍以下）が確認された遺伝子を解析の一例としてまとめたファイルです。抽出条件により「変動遺伝子１」、「変動遺伝子2」のシートを準備しています。
  
  
• クラスター分析ツール（階層クラスタリング）
  • 解析サンプルを選択いただき、ボタン１つでピアソン相関によるクラスタリング解析を行い、系統樹を作成することができます。 階層的クラスタリングを行うことで、サンプル間に存在するグループ構造を視覚的に理解しやすくなります。 計算方法は群平均法の他に、ウォード法、最近隣法、最遠隣法、McQuitty法、メディアン法、重心法などご選択頂けます。 ご依頼内容、RNA品質検定結果、解析結果の概要をまとめた作業報告書です。
    
    
    
• 有意差検定ツール（Student T-test）
  • 繰り返し実験や群間の有意差検定を簡単な操作で何度でもご自由に行うことができます。 control群とtest群を指定すると群平均シグナル値、群間の変動倍率、p-value、q-valueを算出します。 また、1検体同士の比較解析にも対応していますので、ご依頼時に指定いただいたペアと異なる比較もご自由に行っていただけます。 解析データはエクスポートして、Excelで扱うことも可能です。
    
    
    
• Supplementalデータ
  • csvファイル
    解析データのシグナルデータ、発現比率データ、変動遺伝子データの各内容を.csv形式でExportしたファイルです。
  
  

オンライン注文とFAX注文の2種類からお選びください。

• オンライン注文：
  ※オンライン注文でご依頼いただいた場合は、比較解析は含まれません。
  有意差検定ツールを用いてお客様ご自身で解析いただきます。
  
  WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
  
  ご注文方法の概略については、こちらをご参照ください。
  「オンラインのご注文方法について」
  
  ※オンライン注文ページは Internet Explorer11.0のバージョンのブラウザで動作確認をしております。それ以前のブラウザでは正しく機能しないことがありますのでご注意ください。 また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。


• FAX注文：
  • Agilent Array発現解析依頼書をダウンロードいただき、必要事項をご記入ください。
  • 依頼書記載のサンプル名称と、送付検体に記載されている名称は統一してください。
  • サンプル送付の前に、記入済み依頼書を依頼書に記載のFAXまで送付ください。
    
    
    • Agilent Array発現解析依頼書（PDF）
    • Agilent Array発現解析依頼書（Excel）
    • データマイニング解析依頼書（PDF）
    • データマイニング解析依頼書（Excel）
    • 臨床検体又は供与細胞に関する情報提供用紙（Excel） ※臨床検体・細胞を送付いただく場合は、受託サービスをお申込みいただく前に、「臨床検体又は供与細胞に関する情報提供用紙」にご記入の上、弊社へお送りください。 弊社にてご提供いただいた情報を元にお取り扱いの可否を判断して折り返しご連絡いたします。 弊社「臨床検体のお取り扱いについて」の詳細はこちらをご参照ください。

サンプル送付

• 解析サンプルならびに依頼書（オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物）を上記サンプル送付先へご送付ください。
• サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、凍結状態を維持するために充分量のドライアイスを同梱し、冷凍便、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。

※サンプルのご準備、発送にあたり下記手引きに詳細を記載しています。

• total RNAなど
  以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

  	サンプル量＊2	濃度	純度＊3
  			OD260/OD280	OD260/OD230	28S/18S
  total RNA＊1	500 ng以上	50～300 ng/μl	1.6以上		1.8以上
  組織・細胞（オプション）	別途ご相談＊4

  ＊1	すでにpolyA＋ RNAの状態でサンプルをご用意されている場合は、別途ご相談ください。
  ＊2	精製が必要なtotal RNAの場合、以下のRNA量をご用意ください。 エタノール沈殿：2 μg以上　　　　DNasa I 処理：10 μg以上
  ＊3	電気泳動にてrRNAの明瞭なバンドが検出され、分解していないことをあらかじめご確認ください。
  ＊4	送付サンプルの採取方法によっては良質なRNAが抽出できない場合がございます。

  
  

  ・	RNAサンプルはRNase free水に溶解し、1.5 mlチューブでご提供ください。TEや界面活性剤、DEPCを使用すると、反応を阻害する場合がありますので、溶解の際には絶対に使用しないでください。
  ・	RNAサンプル調製時にエタノール沈殿を実施する場合は、共沈剤としてグリコーゲンを添加しないでください。 血液検体由来RNAを調製される際は、抗凝固剤にヘパリンを使用しないでください。
  ・	上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。

・	送付サンプルに起因するシグナル検出不能の場合は、責任を負いかねますのであらかじめご了承ください。
・	ご送付いただいたRNAサンプルはアジレント2200 TapeStationなどを用いて検定を行います。この時点で量・純度が次の作業に十分でない場合はご連絡し、対応方法についてご相談いたします。
・	1色法による解析の比較解析については、検体数N個の場合、Nパターンの比較解析は基本料金に含まれます。さらに比較解析をご依頼の場合は別途オプションとして別途料金を申し受けます。 なお、オンライン注文でご依頼いただいた場合は、比較解析は含まれません。有意差検定ツールを用いてお客様ご自身で解析いただきます。
・	ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。 詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
・	お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

タカラバイオはアジレント・テクノロジー社認定のサービスプロバイダーです。

タカラバイオはKEGGの正規サービスプロバイダーです。