微生物変異株解析、高等生物のSNPやゲノム構造変化の解析

ゲノム変異解析

■お問い合わせ窓口(A)

TEL:077-565-6999


[サンプル送付先]
タカラバイオ株式会社 CDMセンター 遺伝子工学研究/検査 受託受付担当 宛て
〒525-0058 滋賀県草津市野路東七丁目4番38号
TEL:077-567-9262
ご注意:伝票の品名に受託名をご記載ください。 お問い合わせフォームは こちら

特長

  • 次世代シーケンサーによる網羅的ゲノム変異解析
  • 参照配列に対する変異箇所(置換、欠失、挿入など)を迅速に検出
  • 検出した変異のアノテーション情報の付加もサポート

概要

次世代シーケンサーを用いて、ゲノム上にあるSNPや変異塩基、挿入・欠失領域、その他ゲノム配列の構造変化をとらえることが可能です。疾患原因遺伝子の探索や機能解析、微生物有用株の作製などに必要な変異情報を取得します。
■チラシをご覧ください。
ゲノム変異解析サービス
短納期NGS解析受託
大量の配列を取得できるHiSeq/MiSeqによる高速シーケンス(NGS)解析では、微生物から高等生物レベルのゲノムDNA変異候補領域を効率良く取得できます。

  • 変異解析
    ゲノムDNAを提供いただき、ペアエンド解析を行います。参照配列に対し、アセンブルを行った配列をマッピング、または取得した配列をマッピングして変異箇所(置換、欠失、挿入など)の解析を行いリスト化いたします。
    変異位置情報、カバー領域情報やマッピング情報などを納品いたします。

    ・SNPレポート例
    SNPレポート例

    ・マッピング情報
    ラボのPC環境で閲覧や編集が可能なビューワをご用意します。マッピング状況や、変異箇所を視覚的にご覧いただくことができます。
    IGV(Integrative Genomic Browser)
    IGV(Integrative Genomic Browser)

  • アノテーション情報の付加
    検出した変異候補に対して、RefSeqやdbSNPの情報を参照してアノテーション情報の付加を行うことも可能です。
    ヒト全ゲノムシーケンス解析についてはこちらをご覧ください。

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • 変異候補の抽出結果、マッピング結果等

ご注文方法

  • 依頼書作成とFAX連絡
    • 高速シーケンス(NGS)解析依頼書をダウンロードいただき、必要事項をご記入ください。
    • 依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    • サンプル送付の前に、記入済み依頼書をFAXでご送付ください。
  • サンプル送付
    • 解析サンプルならびに依頼書を上記サンプル送付先へご送付ください。
    • サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、-20℃の冷凍便で平日午前着指定でご送付ください。
      また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。

以下のフォーマットにご記入のうえ、依頼書記載のFAX番号へご送付ください。

受入サンプル

  • 参照配列情報
  • ゲノムDNA
以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

サンプル量 濃度 純度
OD260/OD280 OD260/OD230
ゲノムDNA 500 ng以上 20 ng/μl以上 1.6以上

DNAは滅菌水もしくはReduced EDTA TE buffer:10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA pH8.0に溶解してください。
電気泳動(1%ゲル)にて10~20 kbに明確なバンドが検出され、低分子の混入及び分解がないことをご確認ください。
PCR freeライブラリーをご希望の場合は、別途お問い合わせください。
上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。

ご留意事項

供与核酸の品質によっては、再提供をお願いすることがあります。
ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

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注意事項
  • 本受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。

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