LNA microRNA 定量PCRのための品質検定用パネル

microRNA QC PCR Panel

  • RNA Spike-in Kitと組み合わせて、サンプル調製、cDNA合成、リアルタイムPCRを評価
  • 豊富な経験に基づいたパネルデザイン-数万件もの蓄積データに基づいて慎重に選択された生物学的マーカーを搭載
  • ユニークな溶血インジケーター-miRNAバイオマーカーを用いて血清サンプル、血漿サンプルの溶血を評価
  • 短時間で経済的-標的miRNAの検出を行う前にサンプルの評価ができ、貴重な時間や研究費を節約可能
  • 広範囲の生物種に対応-ヒト、マウス、ラット、サル、イヌのサンプルで使用可能
  • 簡単、便利-96ウェル、384ウェルプレートタイプが用意されており、機種に応じた製品を選択可能
メーカー
略称
製品コード TaKaRa
Code
製品名 容量 価格(税別) 特記事項 説明書
データシート
ベクター情報
参考
資料
EXQ YAHS-999YF-2 E23887 microRNA QC PCR Panel, 96well (V4.RO)
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1 Set
(16検体分)
¥75,000
旧製品コード 203887
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EXQ YAHS-999YC-2 E23888 microRNA QC PCR Panel, 96well (V4.AF)
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1 Set
(16検体分)
¥75,000
旧製品コード 203888
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EXQ YAHS-999YA-2 E23889 microRNA QC PCR Panel, 96well (V4.MI)
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1 Set
(16検体分)
¥75,000
旧製品コード 203889
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EXQ 203890 E23890 microRNA QC PCR Panel, 96well (V4.ST)
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1 Set
(16検体分)
終売 終売日:2017/10
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EXQ YAHS-999YG-1 E23891 microRNA QC PCR Panel, 384well (V4.R)
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1 Set
(32検体分)
¥120,000
旧製品コード 203891
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EXQ YAHS-999YE-1 E23892 microRNA QC PCR Panel, 384well (V4.M)
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1 Set
(32検体分)
¥120,000
旧製品コード 203892
受注停止
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製品説明

microRNA QC PCR Panelは、定量PCRに使用するRNAサンプルの品質を検定するためのコントロールパネルです。実際の解析にサンプルを使用する前にRNA品質を確認することにより、サンプル中のヌクレアーゼ、PCR阻害物質の存在や血液由来サンプルの溶血の有無などをチェックすることができ、定量PCRに適したサンプルのみを解析に使用することができます。96 well、384 wellの異なるプレートフォーマットを用いた複数の製品が用意されており、リアルタイムPCR装置の機種に応じた製品を選択することができます。

microRNA定量PCR解析は、microRNA発現プロファイリングのために一般的に用いられる手段で、迅速、高感度、正確性など多くの利点があります。しかし、結果の信頼性は使用するRNAの品質に依存しています。RNAの分解はPCR効率を低下させ、酵素反応阻害物質はcDNA合成反応やPCR反応に悪影響を与えますが、体液サンプルなどから抽出されたRNAの品質を確認することが困難な場合がありました。microRNA QC PCR Panelは、ユニークな方法でRNAサンプルの品質とPCR効率を包括的にチェックすることができます。本製品にはmicroRNAとRNA Spike-inをターゲットとしたLNA PCR Primer Setが含まれており、本製品を外部標準となるRNA Spike-in Kitと組み合わせて使用することにより、RNAの収率や溶血による混入物の有無などを確認できます。また、RNA Spike-inは、cDNA合成とPCR増幅効率の確認にも使用できます。

microRNA QC PCR Panelはヒト、マウス、ラット、サル、イヌのサンプルで使用できます。また、組織、培養細胞、体液など様々なサンプルから抽出されたRNAの品質検定に使用できます。

本製品には、RNAサンプルの品質確認用、反応効率確認用などのSpike-in検出用プライマー6種類とmicroRNA検出用プライマー6種類が含まれています。microRNAは、多くの組織で発現しているもの(miR-103、miR-191)、腎臓(miR-30c)、脳(miR-124)、血液(miR-451a、miR-23a-3p)で発現しているものが選択されています。血液で発現している2種類のmicroRNAは溶血コントロールとして使用することができます。
なお、本製品は、Universal cDNA Synthesis Kit IIExiLENT SYBR Green master mix, Universal RTに至適化して設計されています。
cDNA合成反応および定量PCR反応には必ずExiqon社の試薬を使用してください。
表1. 搭載プライマーでの検出
アッセイ

検出ターゲット

性質

microRNA assay

miR-103

ほとんどの組織で見られるバイオマーカー

microRNA assay

miR-191

ほとんどの組織で見られるバイオマーカー

microRNA assay

miR-451a

血清/血漿での溶血マーカー

microRNA assay

miR-23a-3p

血清/血漿での溶血マーカー

RT assay

UniSp6*1

cDNA合成のモニター

Spike-in assay

UniSp2*2

RNA品質のコントロール

Spike-in assay

UniSp4*2

RNA品質のコントロール

Spike-in assay

UniSp5*2

RNA品質のコントロール

RT assay

cel-39-5p*2

cDNA合成のモニター

microRNA assay

miR-30c

腎臓で見られるバイオマーカー

microRNA assay

miR-124

脳脊髄液で見られるバイオマーカー

Interplate calibrator/PCR control

UniSp3*3

PCR 効率コントロール

*1Universal cDNA Synthesis Kitに含まれるRNA Spike-in
*2RNA Spike-in Kitに含まれるRNA Spike-in
*3本製品の該当ウェルにプライマーセットとともにDNA templateが搭載されている。
各プレートのレイアウトはExiqon社Webサイトでご確認ください。
QC PCRパネルのレイアウト例
図1. QC PCRパネルのレイアウト例
96 wellフォーマットは1枚当たりに8検体分のプライマーセットを搭載している。製品は2枚組で16検体分(384 wellフォーマットは1枚組で32検体分)。

製品のバージョンアップについて

新製品のV4パネルが発売されました。変更点については下記をご確認ください。

microRNA QC PCR Panel
  旧製品(V3) 新製品(V4)
製品コード 203844, 203845, 203846, 203847, 203848, 203849 203887, 203888, 203889, 203890, 203891, 203892
対応miRBase ver. 19.0 ver. 20.0
変更点:1種類の既存のprimer setの設計を更新。UniSp5およびUniSp6 PCR primer setの設計を更新。
旧製品の販売は終了しました。

適応機種

96-well instrument coverage

AF-type

Applied Biosystems 7500 Fast, 7900 Fast, 7900HT Fast Real-Time PCR system
Applied Biosystems StepOnePlus Real-Time PCR system
Applied Biosystems ViiA 7 (FAST)
Applied Biosystems Quantstudio w. 96 well FAST block

RO-type

Roche LightCycler 480 Real-Time PCR system

MI-type

Applied Biosystems 7000, 7300, 7500, 7700 Real-Time PCR system
Applied Biosystems ViiA 7 (96-well Block)
Applied Biosystems Quantstudio w. 96 well std. block
BioRad iCycler, iQ4, iQ5, MyiQ, Chromo4
Eppendorf Mastercycler ep Realplex
Stratagene Mx4000 (after 2003)

ST-type

Stratagene Mx3000P, Mx3005P


384-well instrument coverage

M-type

Applied Biosystems 7900HT and ViiA 7 Real-Time PCR system
Bio-Rad CFX 384 Real-Time PCR system

R-type

Roche LightCycler 480 Real-Time PCR system

使用例


図1. ヒト血清、血漿、尿、大腸がん(FFPE)、マウス脳(新鮮凍結切片)サンプルでの使用例
microRNA QC PCR Panelに搭載しているプライマーセットは、多くのサンプルで発現しているmicroRNAを検出対象としている。


図2. 血漿サンプルの溶血評価
血漿の34サンプルについてmiR-23a-3pとmiR-451aの発現レベルを調べた。ヒト血清/血漿サンプル中でΔCq(miR-23a-3p - miR-451a)が5以下の場合は溶血のないサンプル、7以上の場合は溶血の影響を受けている危険性の高いサンプルとみなすことができる。高レベルで溶血が起こると、赤血球細胞由来のmiRNAが血漿/血清miRNAプロファイリングに影響を与えるため、サンプルの溶血の有無を調べることは重要である。

PCRパネルレイアウトファイル

PCRパネル製品に搭載されているLNA miRNA PCR primer setの詳細は、こちらのExiqon社Webサイトに掲載されているレイアウトファイルにてご確認ください。

内容

microRNA QC PCR Panel, 96 well(製品コード 203844~203847、203887~203890)

96 well plateが2枚(1枚あたりに8回分のプライマーセットが含まれており、16サンプル解析可能)

microRNA QC PCR Panel, 384 well(製品コード 203848、203849、203891、203892)

384 well plate が1枚(1枚に32回分のプライマーセットが含まれており、32サンプル解析可能)

輸送

室温

保存

-20℃

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注意事項
  • 弊社の取扱い製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、家庭用品等として使用しないでください。
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