DNAシーケンスアセンブルソフトウェア

SEQUENCHER™ V5.4

メーカー
略称
製品コード TaKaRa
Code
製品名 容量 価格(税別) 特記事項 説明書
データシート
ベクター情報
参考
資料
GNC 9261 9261 SEQUENCHER™ for Windows V5.4 スタンドアローン版
一式 ¥880,000
GNC 9260 9260 SEQUENCHER™ for Macintosh V5.4 スタンドアローン版
一式 ¥680,000

本製品について

性能、価格など詳細に関しましては、弊社各支店までお問い合わせください。

東京支店:TEL. 03-3271-8553 / FAX. 03-3271-7282
関西支店:TEL. 077-565-6969 / FAX. 077-565-6995

製品説明

SEQUENCHER(シーケンチャー)は、米国 GeneCodes社が開発したキャピラリーシーケンサー、次世代シーケンサー(NGS)に対応したDNA配列解析ソフトウェアです。シンプルかつ分かり易い操作で、アセンブル、アライメント、SNP解析、Blast検索等の解析を行うことができます。SEQUENCHERは全世界でSNP探索、系統分類、法医学、ウィルス学、がん研究など様々な分野で利用されています。

ご注意:
  • ドングルフリーライセンス
    V5.2からライセンスアクチベーションにUSBドングルを使用せず、Gene Codes社が発行したライセンスファイルをソフトウェアに登録してライセンス認証を行う方式になりました。V5.1以前でUSBドングル(黒色)をお持ちのユーザ様は、アップグレード時に必要な手続きを経ることで、引き続きドングルによるライセンス認証を利用することもできます。

  • SEQUENCHER ネットワーク版
    ネットワークに接続したパソコンに台数無制限でSEQUENCHERをインストールし、同時に使用できるパソコン数に制限を設ける形態のライセンスです。詳しくはこちらをご覧ください。

特長

●FastQCによるクオリティチェック機能
FastQC機能でFastQ形式のファイルのクオリティを複数項目でチェックできます。
●優れた操作性
トリミング・アセンブルなどの重要な機能を、ボタン1つで実行できます。
●高機能アセンブル
長大なギャップにも対応できます。
ギャップを3'側に寄せることができます。
●次世代シーケンサ対応
Velvetによるde novoアセンブル、MAQ、GSNAP、BWAによる参照配列へのアライメントおよびCufflinksによる発現解析を行うことができます。
●コネクション機能
BLAST(ホモロジー検索)やMUSCULE(マルチプルアライメント)などのウェブサービスが複数同時に実行できます。
●充実した編集機能
クロマトグラムを見ながらコンティグを編集できます。コンティグとクロマトグラムの表示は常に連動します。
各フラグメント中のコンセンサス配列との不一致部分を自動的に編集することができます。
●SNP探索支援
参照配列(配列間の比較時に標準となる配列)を設定できます。
参照配列と各フラグメント、コンセンサス配列の比較レポートを出力できます。
インフルエンザウィルスなどで、アミノ酸配列(タンパク)の変異を翻訳バリアンステーブルなどを使い確認することができます。
●多用なデータフォーマットへの対応
SEQUENCHERは下表のデータフォーマットに対応しています。
データの種類ファイル形式
波形データABI, ALF, LI-COR, SCF
クオリティデータACE, Qual, TraceTuner, ESD, SCF, ABI3730, FastQ
配列データテキスト, FastA(マルチFastA), FastA aligned, .ma4(Vector NTIデータ)
他社ソフトウェア製品のデータContigExpressプロジェクトファイル(Vector NTI)

SEQUENCHER V5.4の新機能についてはこちらをご覧ください。

適用環境


SEQUENCHER for Win V5.4SEQUENCHER for Mac V5.4
OSWindows 7以降Mac OS X 10.7以上
メモリー3 GB以上
※ 次世代シーケンサーデータを解析する場合は、6 GB以上のメモリーを推奨します。
3 GB以上
※ 次世代シーケンサーデータを解析する場合は、6 GB以上のメモリーを推奨します。
HDD275 MB以上の空き容量
※ 次世代シーケンサーデータを解析する場合は、追加で420 MB以上必要です。
350 MB以上の空き容量
※ 次世代シーケンサーデータを解析する場合は、追加で235 MB以上必要です。

・RNA-Seqツールは64bit OS専用。32bit OSはインストール不可。
・MacintoshおよびMac OSは米国アップルコンピューター社の商標です。
本製品は米国Gene Codes社が開発したソフトウェアです。
SEQUENCHERは米国Gene Codes社のトレードマークです。

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注意事項
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