テクノスルガ・ラボ微生物同定システム

メーカー
略称
製品コード TaKaRa
Code
製品名 容量 価格(税別) 特記事項 説明書
データシート
ベクター情報
参考
資料
TSR 14107142 AP251 解析ソフトウェア アドバンスト
  • 取寄
¥500,000
TSR 14107143 AP252 解析ソフトウェア iアドバンスト
  • 取寄
¥550,000
TSR 14107150 AP255 データベースDB-BA(細菌:1年間版)
  • 取寄
¥100,000
TSR 14107151 AP256 データベースDB-FU(菌類:1年間版)
  • 取寄
¥200,000
TSR 14107152 AP257 細菌ライセンス(1年間版)
  • 取寄
¥100,000
TSR 14107153 AP258 菌類ライセンス(1年間版)
  • 取寄
¥100,000

特長

  • 相同性検索から系統解析まで全自動。複数も同時RUN可能。
  • 複数配列をドラッグ&ドロップで取り込める。
  • バイオセーフティーレベルの表示も可能
  • データベースのBLASTシステムを変えてスピードアップ
  • 出力機能も改良。品質管理にも便利なPDF出力も可能。
  • ユーザーDBに参照配列を登録可能

製品説明

テクノスルガ・ラボ微生物同定システムは、簡単な操作で菌種の絞り込みができる遺伝子解析ツールである。国立遺伝学研究所生命情報・DDBJ研究センター(DDBJ)の支援により構築しており「微生物同定用の塩基配列データベース」を搭載し、手元のサンプルが既知種のどのグループに属するかを、相同性検索と系統解析により、明確に示すことが可能である。
客観的な安全性評価を必要とする医薬品・飲料・食品製造の微生物管理や、幅広い環境微生物種が対象となる微生物群集・生態研究に適している。
解析ソフトウェア iアドバンストでは、インターネット経由の相同性検索機能の使用が可能である。

適用環境

適用機種 CPUクロック 2.0 GHz以上、RAM 2 GB以上
適用OS Windows 7、8
※全て日本語版のみ対応
(Windows Vistaでの動作は保証しない)
推奨環境 1 GB以上のRAM
CD-ROMドライブ(インストール時に必要)
ディスプレイ解像度 GXA(1024×768)以上
インターネット接続環境 Internet Explorer7.0以上

★本製品の表示価格は、すべてPC端末1台分です。複数のPCにて使用する場合は、台数相当の製品をご購入いただく必要があります。製品に関する詳細は弊社東京支店または関西支店までお問合せください。

主な機能

■ 同定に必要な塩基配列のみをデータベース化
細菌については16S rDNAのほぼ全長領域、菌類(カビ・酵母)については、ITS領域(ITS1-5.8S rDNA-ITS2を含む領域)、28S (26S) rDNA-D1/D2領域の塩基配列情報を収録している。細菌・酵母では基準株由来の塩基配列データを、カビでは、分類学的な比較に有効なタイプ標本由来株などの塩基配列を採用している。公共データベースに適切な配列が存在しない微生物については、テクノスルガ・ラボが独自にデータを追加している。

■ データベースは毎年更新
新種の追加や学名の変更に対応するため、データベースは毎年更新
細菌 16S rDNA 2,287属 11,349種 357亜種
菌類28S(26S)-D1/D2 1,227属 4,651種、
ITS領域 787属 4,542種
          (2016年7月現在)

■ 判りやすい相同性検索結果
学名、株名、公共データベースのアクセッション番号、相同率、バイオセーフティレベルが表示される。
検索結果をPDFやHTML形式で保存可能である。

■ 近縁種の推定が容易
系統樹を描くことで、相同率の比較だけでは理解しにくい近縁種との系統関係を明確にする。
STEP 1
塩基配列を入力
テキストやFASTA形式のシーケンスデータをドラッグアンドドロップで読み込める。
エレクトロフェログラムは読み込めない。
塩基配列を入力
STEP 2
ボタンをクリック
相同性検索や系統樹作成ボタンを押せば、
読み込んだ配列をリスト順に自動解析する。
塩基配列を入力
 
分かり易い相同性検索結果
学名、株名、公共データベースのアクセッション番号、
相同率、バイオセーフティレベルが表示される。
検索結果をPDFやHTML形式で保存可能である。
ボタンをクリック
 
系統樹を使えば近縁種の推定が容易
系統樹を書くことで、相同率の比較だけでは理解しにくい近縁種との系統関係を明確にする。出力結果をPDFやjpeg形式で保存可能である。
結果
「テクノスルガ・ラボ微生物同定用DNAデーターベース」のデモ版CDを配布しています。詳しくは弊社までお問い合わせください。


本製品の使用目的は研究または品質管理のみとなります。解析受託目的での使用はできません。

テクノスルガ・ラボ微生物同定システムは、(株)テクノスルガ・ラボの製品です。

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注意事項
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