NGS解析のためのターゲットエンリッチメントシステム

Seq-Ready™ TE MultiSample System

  • 最大5,184のシングルプレックスPCRを1Chip上で実施
  • 最速4時間でターゲットエンリッチメントとライブラリー調製を完了
  • 個々の反応をフレキシブルに追加・削除可能
メーカー
略称
製品コード TaKaRa
Code
製品名 容量 価格(税別) 特記事項 説明書
データシート
ベクター情報
参考
資料
WFG 640043 WF0026 Seq-Ready™ TE MultiSample System
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一式
旧製品コード:420-000029
WFG 640001 WF0007 SmartChip™ MultiSample NanoDispenser
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一式
旧製品コード:420-000035
WFG 640055 WF0040 Seq-Ready™ TE MultiSample FLEX Kit
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1 Kit ¥49,000
旧製品コード:430-000199
WFG 640073 WF0047 Seq-Ready™ TE MultiSample FLEX Reagent Kit 1-24 (ILMN)
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1 Kit ¥163,000
旧製品コード:430-000220
WFG 640049 WF0039 Seq-Ready™ TE MultiSample BRCA 1/2 Panel
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一式 ¥238,000
旧製品コード:430-000136
WFG 640068 WF0051 Seq-Ready™ TE MultiSample Reagent Kit 1-24 (ILMN)
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1 Kit ¥131,000
旧製品コード:430-000138

★価格はお問い合わせください

製品説明

Seq-Ready TE MultiSample System(製品コード 640043)は、5,184個の微小なウェルが搭載されたSmartChip上に数10ナノリットルスケールの精密な分注(ナノディスペンシング)を行うSmartChipテクノロジーを応用したターゲットエンリッチメントシステムである。
最大で5,184のシングルプレックスPCRを行うことにより、NGS解析に適した均一なライブラリーを作製可能である。作製したNGSライブラリーはイルミナ社のNGS装置にて解析する。
操作を行うためにはSeq-Ready TE MultiSample FLEX Kit(製品コード 640055)とSeq-Ready TE MultiSample FLEX Reagent Kit 1-24 (ILMN)(製品コード 640073)、あるいはSeq-Ready TE MultiSample Custom DNA PanelとSeq-Ready TE MultiSample Reagent Kit 1-24 (ILMN)(製品コード 640068)を組み合わせて、NGS用Universal配列が付加されたPCRアンプリコンを調製する。

システムの特長

■SmartChipテクノロジー
SmartChipテクノロジー
5,184個の微小なウェル(100 nl/well)が搭載されたSmartChip上に、数10ナノリットルレベルの精密な分注(ナノディスペンシング)を行うことにより、ハイスループットかつ再現性の高い解析を可能にする技術である。


■最大2.5 Mbのターゲット領域をカバー
1アンプリコンのサイズを300~600 bp程度にデザインすることで、計算上2.5 Mbのターゲット領域のエンリッチメントが可能である。個々のPrimer setにタグをつけてPCRを行いバーコード配列とユニバーサル配列を付加することで、ライゲーション反応を行うことなくNGS解析用ライブラリーを調製できる。
Primer setのデザイン・検証・分注をオーダーするSeq-Ready TE MultiSample Custom DNA Panelを用いると、最大2.5 Mb程度のターゲット領域をエンリッチできる(表1)。また、作製したアンプリコンライブラリーをNGS解析した結果は、他社ライブラリー調製試薬と比較して均一なカバー率を獲得できることを示している(図1)。
既製パネルとして、BRCA遺伝子をエンリッチするためのSeq-Ready TE MultiSample BRCA1/2 Panel(製品コード 640049)も利用可能である。

表1.MultiSample Custom DNA PanelのPCR反応デザイン一覧
Assays
Samples
 
Assays
Samples
48
96
432
12
72
72
648
8
96
54
864
6
108
48
1296
4
216
24
2592
2
288
18
5184
1
360
14
-
-


図1.他社試薬との比較

■PCR反応のデザインはインハウスでも実施可能
Primer setのデザイン・検証・分注をインハウスで実施したい場合はSeq-Ready TE MultiSample FLEX Kit(製品コード 640055)を使用することができる。マルチプレックスPCRと異なり、個々のPCRを独立して実施できるため、反応のフレキシブルな追加・削除が可能である。

表2.FLEX PanelのPCR反応デザイン一覧
Assays
Samples
 
Assays
Samples
384
12
80
64
296
16
72
72
248
20
54
96
216
24
48
108
144
36
36
144
120
42
24
216
96
54
12
384

■バーコード配列、ユニバーサル配列が付加されたアンプリコンを調製
バーコード配列、ユニバーサル配列が付加されたアンプリコンを調整
当システムでは、個々のPrimer setにタグをつけてPCRを行うことにより、ライゲーションを行うことなく、バーコード配列とユニバーサル配列を付加したアンプリコンを調製する。作製したアンプリコンは精製・定量を行った後、NGS解析用のライブラリーとして利用することができる。

システム構成・内容

Seq-Ready TE MultiSample System(製品コード 640043)
 ・SmartChip MultiSample NanoDispenser(製品コード 640001)
 ・Chip Cycler

消耗品・試薬(システム一式とは別にご購入ください)
MultiSample Panel
 ○Panelの設計・検討、Primerの分注を承ります(下記2点を一緒にご注文ください)。
 ・Seq-Ready TE MultiSample Custom DNA Panels*1
 ・Seq-Ready TE Custom DNA Primers*1

 ○BRCA遺伝子のための既製パネル
 ・Seq-Ready TE MultiSample BRCA 1/2 Panel(製品コード 640049)

 ○Custom DNA PanelおよびBRCA 1/2 Panel用試薬
 ・Seq-Ready TE MultiSample FLEX Reagent Kit 1-24 (ILMN)(製品コード 640068)*1

FLEX Panel
 ○インハウスでデザイン
 ・Seq-Ready TE MultiSample FLEX Kit(製品コード 640055)*2

 ○FLEX用試薬
 ・Seq-Ready TE MultiSample Reagent Kit 1-24 (ILMN) (製品コード 640073)*1

*1 25~96サンプルに対応した製品もございます。
*2 FLEXの場合もプライマーの分注をご依頼いただけます。
   Seq-Ready TE MultiSample Custom DNA Primers

仕様

MultiSample NanoDispenser
サイズ 1,350 (W)×750 (D)×460 (H) mm
電源 100~230 VAC、50/60 Hz
Chip Cycler
サイズ 260 (W)×345 (D)×260 (H) mm
電源 100~240 VAC、50/60 Hz

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注意事項
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