qPCRによるプロモーター領域のDNAメチル化解析

EpiScope® Promoter qPCR Array (Human)

  • DNAメチル化の影響が報告されている25種類の遺伝子がターゲット
  • プライマーは転写開始点上流付近に設定
  • SYBR Premix Ex Taq GCを用いて高感度に検出
  • 便利な解析ツールをダウンロード可能
メーカー
略称
製品コード TaKaRa
Code
製品名 容量 価格(税別) 特記事項 説明書
データシート
ベクター情報
参考
資料
TKR 5301 5301 EpiScope® Promoter qPCR Array (Human)
  • バルクなど特別対応可能
1 Set ¥65,000
説明書・データシート・ベクター情報

製品説明

本製品は、EpiXplore Methylated DNA Enrichment Kit(製品コード 631963/631962)やクロマチン免疫沈降法によりゲノムDNA の目的領域を濃縮後、DNA メチル化による発現調節が報告されている遺伝子のゲノムDNA領域を、リアルタイムPCR(qPCR)で定量するためのプライマーセットである。プライマーは、25種類の遺伝子(スプライスバリアントを含む30種類)をターゲットとして、転写開始点上流付近に設計されている。また、コントロールとして、リピート配列であるLINE-1検出用およびDNAメチル化のネガティブコントロールとなるGAPDH検出用のプライマーも含まれている。各プライマーセットは、SYBR Premix Ex Taq GC (Perfect Real Time)(製品コード RR071A/B)で良好に反応することを確認している。
なお、興味深い結果が得られた遺伝子に関してより詳細な解析を行うために、個々のプライマーを別途購入可能である。

本製品の専用解析ツール(episcope_promoter_qpcrarray_analysis_tool_v1_4.zip:XLSファイルを圧縮)および解析ツールの説明書(episcope_promoter_qpcrarray_analysis_tool-v1_j.pdf)を以下よりダウンロードしてご利用いただけます。
本解析ツールを使用すると、Ct値を入力するだけで自動的に前述の解析を行いグラフ化することができます。96ウェルプレート2枚分のデータを入力でき、1~3セットのInputおよびBoundデータ、または1~3セットのUnbound およびBoundデータに対応しています。

(注)
「EpiScope Promoter qPCR Array Analysis Tool Ver.1」はマクロを使用しています。Excelのセキュリティがアクティブな場合、マクロを含むブックを開くたびに実際にウイルスに感染していなくても注意を促すメッセージが表示されます。「マクロを有効にする」を選択してファイルをご利用ください。

プライマー情報リストをご確認ください(xlsファイル)

内容

ターゲット遺伝子検出用プライマー 50 μl×30ウェル(×3 レプリケート)
コントロール遺伝子検出用プライマー 50 μl×2ウェル(×3 レプリケート)

※ 各ウェルにForward & Reverse primer mix(各2.5 μM)が含まれる。
※ 25 μl反応系の場合、1反応あたり2 μlを使用する。

【注意】 ラバーマット(フタ)は繰り返し使用するので、取り扱いに注意し、大切に保管してください。

保存

-20℃
※適切に保存し、受取り後1年を目途にご使用ください。
※短期間(~1ヵ月)に繰り返し使用する場合には4℃で保存してください。ただし、本製品は防腐剤を含んでおりませんので、コンタミネーションには十分にご注意ください。
使用上の注意:
EpiScope Promoter qPCR Arrayを-20℃で凍結保存している場合には、使用する前に冷凍庫から取り出し室温で溶解させます。その後、プライマー溶液の濃度が均一になるように、ラバーマット(フタ)が密着していることを確認した上でqPCR Array全体を振って撹拌し、ウェル壁面の溶液を底に落とすためにプレート遠心機で軽くスピンダウンします。
EpiScope Promoter qPCR Arrayを4℃で冷蔵保存している場合には、使用する前に冷蔵庫から取り出し、同様にプライマー溶液を撹拌し、軽くスピンダウンします。

本製品以外に必要な試薬、器具(主なもの)

  • リアルタイムPCR装置
    Thermal Cycler Dice Real Time Systemシリーズ(製品コード TP800/TP850)など
  • リアルタイムPCR 装置専用の反応プレートおよびシール
  • 8連マルチチャンネルピペット、マイクロピペットおよびチップ
  • プレート遠心機
  • リアルタイムPCR試薬
    SYBR Premix Ex Taq GC (Perfect Real Time)(製品コード RR071A/B)をご使用ください。
<DNAメチル化解析の場合>
  • DNA抽出試薬
    NucleoSpin Tissue(製品コード 740952.10/50/250)
  • メチル化DNA濃縮試薬
    EpiXplore Methylated DNA Enrichment Kit(製品コード 631963/631962)

個別プライマーのご購入方法

EpiScope Promoter qPCR Array (Human) に搭載されたプライマーは、すべて個別にご購入いただけます。以下の専用の注文書にプライマー情報リストに記載のPrimer Set IDと必要事項を記入してご注文ください。通常納期は、受注後、5営業日です。
(価格は「リアルタイムPCR用プライマー合成受託」をご参照ください。)

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注意事項
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