クロマチン免疫沈降（ChIP; Chromatin Immunoprecipitation）は、生きた細胞内のタンパク質-DNA間相互作用を解析する手法の1つとして、修飾ヒストンや転写因子などクロマチン関連タンパク質のゲノム上局在解析に利用されている。
EpiScope ChIP Kit (anti-mouse IgG)には、クロスリンク処理後の細胞からの、

1. 細胞溶解および超音波破砕によるクロマチン断片化
2. 断片化クロマチンのマウスIgG抗体を用いた免疫沈降
3. 免疫沈降後の目的タンパク質-DNA複合体からのDNA溶出

の各ステップに必要な試薬が含まれている。
本キットで使用するクロマチン免疫沈降用の磁性ビーズ(Magnosphere anti-mouse IgG）には、マウスIgG抗体と特異的に結合する抗体が固定化されているため、目的のタンパク質を認識するマウスIgG抗体を別途用意することで、容易にクロマチン免疫沈降実験を開始することができる。
本製品のプロトコールは、一般的に2～3日を要する細胞のクロスリンク処理から免疫沈降後のDNA溶出までを、最短1日で行うことができるように最適化されている。免疫沈降後の溶出DNAは、精製操作なしに直接PCRの鋳型として使用できるので、クロマチン免疫沈降後の解析対象ゲノム領域の濃縮率をリアルタイムPCRを用いて迅速に測定可能である。


クロマチン免疫沈降の概略

（24反応分）

1. Quenching Solution	35 ml×2
2. Cytoplasmic Lysis Buffer	25 ml
3. SDS Lysis Buffer	5 ml
4. Dilution Buffer	15 ml
5. RIPA Buffer-1	35 ml
6. RIPA Buffer-2	20 ml
7. TE	40 ml
8. Elution Buffer	2.5 ml
9. Chelate Resin（10%）	840 μl×3
10. Protease Inhibitor Cocktail（100×）	330 μl
11. Proteinase K（20 mg/ml）	50 μl
12. RNase A（1 mg/ml）	50 μl
13. 10×EASY Dilution	500 μl
14. Magnosphere anti-mouse IgG（0.2%）	2.5 ml×2

コンポーネント 9、10、14：4℃（9、14は凍結厳禁）
その他のコンポーネント：－20℃

・1×PBS
・4% ホルムアルデヒド
・培地（血清含有培地または無血清培地）
・セルスクレーパー
・1.5 mlシリコナイズドチューブ
・15 ml遠心チューブ
・微量高速冷却遠心機
・Magnetic Stand (6 tubes)（製品コード 5328）
・超音波破砕機
・ChIP用マウスIgG各種抗体
・NucleoSpin Gel and PCR Clean-up（製品コード 740609.10）
・Buffer NTB（製品コード 740595.150）
・サーマルサイクラー
・リアルタイムPCR用試薬：SYBR Premix Ex Taq GC (Perfect Real Time)（製品コード RR071A)など
・ChIP用リアルタイムPCR用プライマー（製品コード 5311～5316等）