Fluidigm社C1 Systemに最適化
- Fluidigm社 C1システムで単離された単一細胞から直接cDNAを合成
- 2 IFC、10 IFC 2種類の反応スケールに対応
- 高品質のRNA-Seq（RNA Sequencing）解析データを取得可能
－完全長遺伝子解析により全トランスクリプトーム情報を取得
－5’端、3’端でのcDNA合成のバイアスがない
－rRNA配列の混入は2％以下
－エキソンを幅広くカバー
－高い相関性（ERCC correlation）
製品説明
本製品は、Fluidigm社 C1システムで単離された細胞からSingle-Cell mRNA Sequencingに用いるcDNAを調製するためのキットである。本製品はSMARTer Ultra Low RNA Kit for Illumina SequencingをC1システム用に改良しており、逆転写酵素、PCR酵素などcDNA合成に必要な全ての試薬が含まれている。本製品はイルミナ社のGenome Analyzerシステム、HiSeqシステム、HiScanシステム、MiSeqシステム用にデザインされている。
SMART technology
SMART（Switching Mechanism At the 5’End of the RNA Template）技術は、遺伝子の全長をカバーでき、単一細胞の研究、血中循環腫瘍細胞研究、腫瘍細胞中でのスプライシング現象の解析など、トランスクリプトーム解析において威力を発揮する優れた技術である。
解析の流れ
SMARTer Ultra Low RNA Kitは、Fluidigm社 C1システムによるsingle cell mRNA-seqの一環として、単一細胞からのcDNA合成に使用する。本製品で調製したcDNAはイルミナ社のNexteraによるライブラリー作製に使用する。
内容
BOX1
SMARTer IIA Oligonucleotide（12 μM）
BOX2
3' SMART CDS Primer IIA（12 μM）
5×First-Strand Buffer（RNase-Free）
dNTP Mix（10 mM）
Dithiothreitol（DTT）（100 mM）
IS PCR Primer（12 μM）
RNase Inhibitor（40 U/μl）
Dilution Buffer
SMARTScribe Reverse Transcriptase（100 U/μl）
Advantage 2 PCR Kit(製品コード 639207)
5×First-Strand Buffer（RNase-Free）
dNTP Mix（10 mM）
Dithiothreitol（DTT）（100 mM）
IS PCR Primer（12 μM）
RNase Inhibitor（40 U/μl）
Dilution Buffer
SMARTScribe Reverse Transcriptase（100 U/μl）
50×Advantage 2 Polymerase Mix
10×Advantage 2 PCR Buffer
10×Advantage 2 SA PCR Buffer
50×dNTP Mix（10 mM each）
Control DNA Template（100 ng/μl）
Control Primer Mix（10 μM each）
PCR-Grade Water
10×Advantage 2 PCR Buffer
10×Advantage 2 SA PCR Buffer
50×dNTP Mix（10 mM each）
Control DNA Template（100 ng/μl）
Control Primer Mix（10 μM each）
PCR-Grade Water
保存
SMARTer IIA Oligonucleotide：－70℃
Dilution Buffer：－20℃（融解後は4℃保存）
その他のコンポーネント：－20℃
Dilution Buffer：－20℃（融解後は4℃保存）
その他のコンポーネント：－20℃
用途
・Fluidigm社 C1システム単離細胞からのRNA-Seq解析用cDNAの合成
・RNA-Seq解析前のFluidigm社BioMark qPCR用cDNAの合成
・RNA-Seq解析前のFluidigm社BioMark qPCR用cDNAの合成
Fluidigm C1はFluidigm社のトレードマークです。
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