SmartChipテクノロジーによるシングルセル解析システム

ICELL8™ Single-Cell System

  • 5,184個のウェルに細胞を分注し、最大1,800個程度の細胞をシングルセル化
  • 5~100 μmの幅広い細胞サイズに対応
  • 専用ソフトウェアで確実なシングルセルのみを選択
  • 最大8種類の細胞サンプルを1枚のチップ上で解析可能
  • 解析したいサンプルのみを選択できるため、シングルセル解析で問題となるNGS解析コストを抑えることが可能
メーカー
略称
製品コード TaKaRa
Code
製品名 容量 価格(税別) 特記事項 説明書
データシート
ベクター情報
参考
資料
WFG 420-000043 WF0001 ICELL8™ Single-Cell System
  • 取寄
一式 ¥37,500,000
デモ受付中
WFG 430-000233 WF0003 ICELL8™ Chip and Reagent Kit
  • 取寄
1 Kit ¥431,000

製品説明

ICELL8 Single-Cell System
ICELL8 Single-Cell Systemは、5,184個の微小なウェルが搭載されたSmartChip上に数10ナノリットルスケールの精密な分注(ナノディスペンシング)を行うSmartChipテクノロジーを応用したシングルセル解析システムである。最大1,800個程度の細胞をシングルセル化することが可能で、CellSelectソフトウェアを用いて確実なシングルセルのみを選択して、cDNAを合成することができる。
本システムは、ICELL8 MultiSample NanoDispenser、Imaging Station/CellSelect Software、Chip Cyclerで構成されている。合成したシングルセル由来のcDNAには各ウェルを認識するバーコード配列が付加されており、Illumina社NGS解析装置を用いた網羅的な遺伝子発現解析を行うことが可能である。


システム紹介動画はこちら(YouTubeサイト)

システムの特長

SmartChipテクノロジー
SmartChipテクノロジー
5,184個の微小なウェル(100 nl/well)が搭載されたSmartChip上に、数10ナノリットルレベルの精密な分注(ナノディスペンシング)を行うことにより、ハイスループットかつ再現性の高い解析を可能にする技術である。
細胞の分注はポアソン分布に従って行われるため、計算上最大1,800個程度のシングルセルを獲得することができる。また、1回の分注で8種類までのサンプルを分注できる。分注は15分程度で完了するため、細胞の生存率への影響を最小限に抑えることができる。


5,184ウェルを自動でイメージング
5,184ウェルを自動でイメージング
SmartChipに分注された各ウェル内の細胞イメージは15分以内で自動的に撮影される。事前に細胞を染色することにより、分注された細胞の数と生死を識別できる。
得られた画像データは、専用のCellSelect Softwareを使用することで、SmartChipの各ウェルに分注された細胞数の検出、生死の判定を自動的に行うことができる。その結果を吟味した後に、解析に使用するウェルのみを選択して以降の反応に持ち込むことが可能である。


サイズの異なる細胞集団を均一に解析
5,184ウェルを自動でイメージング
ICELL8による分注操作は細胞のサイズによる制限を受けず、5~100 μmの範囲の細胞を均一に分注できる。単離・選択したシングルセル由来のcDNAから、NGS用のライブラリーを調製し、RNA-seq解析後の発現分布を主成分分析(PCA解析)した結果は個々のサンプルが類似の発現プロファイリングを示し、同一集団に集積していることを示している。

SmartChipテクノロジーと組み合わされた分子バーコード技術
SmartChipテクノロジーと組み合わされた分子バーコード技術
SmartChip上の5,184個のウェルには、個々のウェルを識別するバーコード配列が予め固相化されている。ウェルごとのバーコード配列はCellSelectソフトウェア上で細胞イメージ画像とリンクさせることができる。
また、ウェルを識別する個々のバーコード配列には100万種類を超えるUnique Molecule Identifier(UMI)を付加しているため、NGS解析においてサンプルユニークな分子のみを補正して定量することを可能にしている。

デモンストレーション

弊社研究所にてデモンストレーションを行います。試薬・消耗品の費用のみでICELL8システムをお試しいただけます。標準サンプルを用いて、シングルセル解析のための1細胞の単離作業からソフトウェアを用いたシングルセルおよび生死の判別までを行い、cDNA合成フローを確認します。(シーケンス以降の作業は行いません)

デモンストレーションをご希望の方は、弊社までご連絡ください。
タカラバイオ(株)営業部 WaferGen(ウェーファジェン)担当 TEL 077-565-6972

システム構成・内容

ICELL8 MultiSample NanoDispenser
  ・ICELL8 MultiSample NanoDispenser
  ・Centrifuge Chip Spinner
  ・Spinner Balance
  ・Centrifuge Chip Spinners
  ・Blank chip for centrifuge balance
  ・Film Applicator & Blotter
  ・Chip Cold Block

Imaging Station
  ・ICELL8 Imager
  ・ICELL8 Imager Microscopy suite
  ・ICELL8 Chip Holder

CellSelect Software
  ・CellSelect Image Analysis

Chip Cycler

消耗品・試薬(システム一式とは別にご購入ください)
・ICELL8 Chip and Reagent Kit(製品コード 430-000233)
  ・ICELL8 Chip Kit
    ・ICELL8 Chip (5,184 Barcodes)
    ・ICELL8 Chip Loading Kit
      ・Blotting papers
      ・Imaging Film
      ・PCR Film
   ・Collection Kit
      ・Collection Fixture
      ・Collection Tubes
      ・Collection Film
   ・ICELL8 Reagent Kit
      ・Fiducial Mix
      ・Second Diluent 2X
      ・Second Diluent 100X
      ・RT E5OLIGO
      ・Amp Primer
      ・Nextera Primer P5

逆転写試薬、PCR試薬は別に用意する必要があります。

対応システム
Illumina社 Nextera XT DNA Library Preparation Kit

仕様

ICELL8 MultiSample NanoDispenser
サイズ 1,350 (W)×750 (D)×460 (H) mm
電源 100~230 VAC、50/60 Hz
Imaging Station
サイズ 1,630 (W)×660 (D)×860 (H) mm
電源 100~240 VAC、47~63 Hz
Chip Cycler
サイズ 260 (W)×345 (D)×260 (H) mm
電源 100~240 VAC、50/60 Hz
ICELL8およびSmartChipはWaferGen Bio-systems社の商標です。

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