BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]

Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= TST-90.f
         (1048 letters)

Database: /PUBDB/blastdb/ddbj/16S/2012_04_06_01_00_0/16S 
           298,797 sequences; 305,506,631 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

M26923_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA                      1511   0.0  
EU652052_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA                    1511   0.0  
EU214609_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA                    1511   0.0  
DQ087525_1|Thermus sp. E26|16S ribosomal RNA                         1511   0.0  
AP008226_2|Thermus thermophilus HB8|16S ribosomal RNA                1511   0.0  
>M26923_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA
          Length = 1775

 Score = 1511 bits (762), Expect = 0.0
 Identities = 771/774 (99%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
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Sbjct: 815 ccaggtggctgccttcgccatcggcgttcctcccggtatctgcgcatttcaccgctactc 756

                                                                       
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>EU652052_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA
          Length = 1480

 Score = 1511 bits (762), Expect = 0.0
 Identities = 771/774 (99%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
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Sbjct: 58  acgacttgcatgtcttaggcacgccgccagcgttcaccctgagccaggatcaaa 5
>EU214609_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA
          Length = 1515

 Score = 1511 bits (762), Expect = 0.0
 Identities = 771/774 (99%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
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Sbjct: 665 cgggaattccaccaccctctcccaccgtctagcctgagcgtatcccacgctcccccacgg 606

                                                                       
Query: 262 ttgagccgtggtctttcacatgggacgccccaggccgcctacacgccctttacgcccagt 321
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Sbjct: 605 ttgagccgtggtctttcacatgggacgccccaggccgcctacacgccctttacgcccagt 546

                                                                       
Query: 322 gaatccgggtaacgctcgcgccctccgtattaccgcggctgctggcacggagttggccgg 381
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Sbjct: 545 gaatccgggtaacgctcgcgccctccgtattaccgcggctgctggcacggagttggccgg 486

                                                                       
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Sbjct: 485 cgctattaccccggtaccgtcagtcccctcgtcgggggtttcgtcccgggttcaggagtt 426

                                                                       
Query: 442 tacaccccgaagggcttcttcctccaagcggcgtcgctccgtcaggcttgcgcccattgc 501
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Sbjct: 425 tacaccccgaagggcttcttcctccaagcggcgtcgctccgtcaggcttgcgcccattgc 366

                                                                       
Query: 502 ggaagattcctaactgctgcctcccgtaggagtggggcccgtgtctcagtgcccctgtgg 561
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Sbjct: 365 ggaagattcctaactgctgcctcccgtaggagtggggcccgtgtctcagtgcccctgtgg 306

                                                                       
Query: 562 ccggccatcctctcagaccggctacccgtcgtcgccttggtgggccgttaccccaccaac 621
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Sbjct: 305 ccggccatcctctcagaccggctacccgtcgtcgccttggtgggccattaccccaccaac 246

                                                                       
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Sbjct: 125 gtcacccacgcgttactcacccgtccgccgctgaccacggagtaaaaccccgcggcccgc 66

                                                                 
Query: 802 acgacttgcatgtcttatgcacgccgccagcgttcaccctgagccaggatcaaa 855
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 65  acgacttgcatgtcttaggcacgccgccagcgttcaccctgagccaggatcaaa 12
>DQ087525_1|Thermus sp. E26|16S ribosomal RNA
          Length = 1480

 Score = 1511 bits (762), Expect = 0.0
 Identities = 771/774 (99%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
Query: 82  taccagggtatctaatccggtttgctccccacgctttcgcgcctcagcgtcacgggtgga 141
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Sbjct: 778 tacccgggtatctaatccggtttgctccccacgctttcgcgcctcagcgtcacgggtgga 719

                                                                       
Query: 142 ccaggtggctgccttcgccatcggcgttcctcccggtatctgcgcatttcaccgctactc 201
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Sbjct: 718 ccaggtggctgccttcgccatcggcgttcctcccggtatctgcgcatttcaccgctactc 659

                                                                       
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>AP008226_2|Thermus thermophilus HB8|16S ribosomal RNA
          Length = 1504

 Score = 1511 bits (762), Expect = 0.0
 Identities = 771/774 (99%)
 Strand = Plus / Minus

                                                                       
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Sbjct: 666 cgggaattccaccaccctctcccaccgtctagcctgagcgtatcccacgctcccccacgg 607

                                                                       
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Sbjct: 606 ttgagccgtggtctttcacatgggacgccccaggccgcctacacgccctttacgcccagt 547

                                                                       
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Sbjct: 546 gaatccgggtaacgctcgcgccctccgtattaccgcggctgctggcacggagttggccgg 487

                                                                       
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Sbjct: 486 cgctattaccccggtaccgtcagtcccctcgtcgggggtttcgtcccgggttcaggagtt 427

                                                                       
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Sbjct: 426 tacaccccgaagggcttcttcctccaagcggcgtcgctccgtcaggcttgcgcccattgc 367

                                                                       
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Sbjct: 366 ggaagattcctaactgctgcctcccgtaggagtggggcccgtgtctcagtgcccctgtgg 307

                                                                       
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Query: 742 gtcacccacgcgttactcacccgtccgccgctgaccacggagtaaaaccccgcggcccgc 801
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Query: 802 acgacttgcatgtcttatgcacgccgccagcgttcaccctgagccaggatcaaa 855
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Sbjct: 66  acgacttgcatgtcttaggcacgccgccagcgttcaccctgagccaggatcaaa 13
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