BLASTN 2.2.20 [Feb-08-2009]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= TST-27.f
(1051 letters)
Database: /PUBDB/blastdb/ddbj/16S/2012_04_06_01_00_0/16S
298,797 sequences; 305,506,631 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
M26923_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA 1520 0.0
EU652052_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA 1520 0.0
EU214609_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA 1520 0.0
DQ087525_1|Thermus sp. E26|16S ribosomal RNA 1520 0.0
AP008226_2|Thermus thermophilus HB8|16S ribosomal RNA 1520 0.0
>M26923_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA
Length = 1775
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Identities = 773/775 (99%)
Strand = Plus / Plus
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>EU652052_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA
Length = 1480
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Identities = 773/775 (99%)
Strand = Plus / Plus
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>EU214609_1|Thermus thermophilus|16S ribosomal RNA
Length = 1515
Score = 1520 bits (767), Expect = 0.0
Identities = 773/775 (99%)
Strand = Plus / Plus
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>DQ087525_1|Thermus sp. E26|16S ribosomal RNA
Length = 1480
Score = 1520 bits (767), Expect = 0.0
Identities = 773/775 (99%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 203 ggaagagggggacaacccggggaaactcgggctaatcccccatgtggacccgccccttgg 262
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Query: 263 ggtgtgtccaaagggctttgcccgcttccggatgggcccgcgtcccatcagctagttggt 322
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Query: 383 gggcactgagacacgggccccactcctacgggaggcagcagttaggaatcttccgcaatg 442
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Sbjct: 425 tgaacccgggacgaaacccccgacgaggggactgacggtaccggggtaatagcgccggcc 484
Query: 563 aactccgtgccagcagccgcggtaatacggagggcgcgagcgttacccggattcactggg 622
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Sbjct: 485 aactccgtgccagcagccgcggtaatacggagggcgcgagcgttacccggattcactggg 544
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Query: 683 gggagcgtgggatacgctcaggctagacggtgggagagggtggtggaattcccggagtag 742
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Sbjct: 605 gggagcgtgggatacgctcaggctagacggtgggagagggtggtggaattcccggagtag 664
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Sbjct: 665 cggtgaaatgcgcagataccgggaggaacgccgatggcgaaggcagccacctggtccacc 724
Query: 803 cgtgacgctgaggcgcgaaagcgtggggagcaaaccggattagataccctggtag 857
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Sbjct: 725 cgtgacgctgaggcgcgaaagcgtggggagcaaaccggattagatacccgggtag 779
>AP008226_2|Thermus thermophilus HB8|16S ribosomal RNA
Length = 1504
Score = 1520 bits (767), Expect = 0.0
Identities = 773/775 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 83 tttgatcctggctcagggtgaacgctggcggcgtgcctaagacatgcaagtcgtgcgggc 142
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Query: 203 ggaagagggggacaacccggggaaactcgggctaatcccccatgtggacccgccccttgg 262
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Sbjct: 133 ggaagagggggacaacccggggaaactcgggctaatcccccatgtggacccgccccttgg 192
Query: 263 ggtgtgtccaaagggctttgcccgcttccggatgggcccgcgtcccatcagctagttggt 322
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Sbjct: 193 ggtgtgtccaaagggctttgcccgcttccggatgggcccgcgtcccatcagctagttggt 252
Query: 323 ggggtaatggcccaccaaggcgacgacgggtagccggtctgagaggatggccggccacag 382
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Sbjct: 253 ggggtaatggcccaccaaggcgacgacgggtagccggtctgagaggatggccggccacag 312
Query: 383 gggcactgagacacgggccccactcctacgggaggcagcagttaggaatcttccgcaatg 442
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Sbjct: 313 gggcactgagacacgggccccactcctacgggaggcagcagttaggaatcttccgcaatg 372
Query: 443 ggcgcaagcctgacggagcgacgccgcttggaggaagaagcccttcggggtgtaaactcc 502
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Sbjct: 373 ggcgcaagcctgacggagcgacgccgcttggaggaagaagcccttcggggtgtaaactcc 432
Query: 503 tgaacccgggacgaaacccccgacgaggggactgacggtaccggggtaatagcgccggcc 562
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Sbjct: 433 tgaacccgggacgaaacccccgacgaggggactgacggtaccggggtaatagcgccggcc 492
Query: 563 aactccgtgccagcagccgcggtaatacggagggcgcgagcgttacccggattcactggg 622
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Sbjct: 493 aactccgtgccagcagccgcggtaatacggagggcgcgagcgttacccggattcactggg 552
Query: 623 cgtaaagggcgtgtaggcggcctggggcgtcccatgtgaaagaccacggctcaaccgtgg 682
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Sbjct: 553 cgtaaagggcgtgtaggcggcctggggcgtcccatgtgaaagaccacggctcaaccgtgg 612
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Sbjct: 673 cggtgaaatgcgcagataccgggaggaacgccgatggcgaaggcagccacctggtccacc 732
Query: 803 cgtgacgctgaggcgcgaaagcgtggggagcaaaccggattagataccctggtag 857
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Sbjct: 733 cgtgacgctgaggcgcgaaagcgtggggagcaaaccggattagatacccgggtag 787
BLAST Search Results