（2）アガロースゲル電気泳動例と判別
キット添付のMarker DNA Solutionを構成する4つのフラグメント（約0.65 kb、約0.77 kb、約0.87 kb、約1.6 kb）と同じ大きさの増幅産物の出現パターンにより判別する。
検体がコシヒカリの場合、約0.65 kb、約0.77 kb、約0.87 kbの大きさのPCR増幅断片が得られる。
検出結果の信頼性を確保するため、Negative Control試験、Positive Control試験も同時に実施することを推奨する。Negative Control試験にはDNA溶液のかわりに滅菌精製水を添加する。Positive Control試験にはDNA溶液のかわりにキット添付のControl template 2 μlを添加する（約0.88 kbおよび約2.7 kbの増幅断片が検出される）。
アガロース電気泳動例（2% Agarose L03、1×TAE buffer）
検体がコシヒカリの場合、約0.65 kb、約0.77 kb、約0.87 kbの大きさのPCR増幅断片が得られる。
検出結果の信頼性を確保するため、Negative Control試験、Positive Control試験も同時に実施することを推奨する。Negative Control試験にはDNA溶液のかわりに滅菌精製水を添加する。Positive Control試験にはDNA溶液のかわりにキット添付のControl template 2 μlを添加する（約0.88 kbおよび約2.7 kbの増幅断片が検出される）。
アガロース電気泳動例（2% Agarose L03、1×TAE buffer）
| 1 | ： | Marker DNA solution |
| 2 | ： | コシヒカリ |
| 3 | ： | コメ検体A |
| 4 | ： | コメ検体B |
| 5 | ： | コメ検体C |
| 6 | ： | キット添付Positive Control DNA |
| 7 | ： | φX174-Hae III digest |
| 8 | ： | Negative Control |
