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PicoPLEX® Gold Single Cell DNA-Seq Kit

参考文献

Performance of four modern whole genome amplification methods for copy number variant detection in single cells.
Deleye, L. et al. Sci.Rep. (2017) 7, 3422.
この論文では、Loucy細胞株から分離した1個、3個、または5個の細胞を出発材料として、PicoPLEX DNA-seq Kit、DOPlify WGA Kit、REPLI-g Single Cell KitおよびAmpli1 WGA Kitを用いてシーケンス深度の浅い全ゲノムシーケンス解析による異数性スクリーニングおよびコピー数解析を行い、キットの性能を比較しています。細胞の全ゲノム増幅後、PCRフリーのライブラリーを調製し、イルミナ社製システムによるシーケンス解析を行いました。PicoPLEX DNA-seq Kitは、全ゲノム増幅(WGA)とライブラリー構築を同時に行うことから、「1チューブでの反応によりシーケンス解析用ライブラリー」を調製できるため、ライブラリー調製のステップを別に行う必要がありませんでした。PicoPLEX DNA-seqを用いて作製したライブラリーでは、「バルクサンプルのシーケンスで確認されたコピー数多型(CNV)が100%検出された。すなわち、偽陽性は検出されず真の陽性率が最も高かった」という結果となりました。

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