癌などの疾患に関与する網羅的な融合遺伝子の検出

Fusion Gene解析

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[サンプル送付先]
タカラバイオ株式会社 CDMセンター 遺伝子工学研究/検査 受託受付担当 宛て
〒525-0058 滋賀県草津市野路東七丁目4番38号
TEL:077-567-9262
ご注意:伝票の品名に受託名をご記載ください。 お問い合わせフォームは こちら

特長

  • 次世代シーケンサーによる網羅的な融合遺伝子探索
  • mRNA-seq配列データを用いた情報解析により候補をリストアップ
  • 遺伝子発現解析との同時解析も可能

概要

近年、がん細胞の分子標的治療のターゲットとして、融合遺伝子が注目されています。次世代シーケンサーを用いることで、比較的低い発現量の融合遺伝子の検出や網羅的な探索が可能になりつつあります。本解析では、ヒトがん細胞などのtotal RNAをご提供いただき、次世代シーケンサーによる配列取得後、fusion gene解析ソフトウェアにより、融合遺伝子の検出と偽陽性の判別を行い候補遺伝子のリスト化を行います。

サービス内容

total RNAを提供いただき、専用試薬により、mRNA精製、断片化およびcDNA合成によりライブラリー作製を行います。HiSeqなどの次世代シーケンサーを用いて、ペアエンドシーケンスを行い、fusion gene解析ソフトウェアにより融合遺伝子を検出します。
解析結果は、融合遺伝子候補の一覧をリスト化し、breakpoint前後の配列やアノテーション情報、ゲノム位置、偽陽性スコア情報等を付与いたします。情報解析だけのご依頼も可能です。


  • 納品データ例
    候補融合遺伝子について、確からしさとともに、位置情報やアノテーション情報などをまとめたリストを納品いたします。
    納品データ例
         納品データ例2

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合せください。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • 融合遺伝子候補をまとめたExcelデータ

ご注文方法

  • 依頼書作成とFAX連絡
    • 高速シーケンス解析依頼書をダウンロードいただき、必要事項をご記入ください。
    • 依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
    • サンプル送付の前に、記入済み依頼書をFAXでご送付ください。
  • サンプル送付
    • 解析サンプルならびに依頼書を上記サンプル送付先へご送付ください。
    • サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、-20℃の冷凍便で平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。

以下のフォーマットにご記入のうえ、依頼書記載のFAX番号へご送付ください。

受入サンプル

  • 参照配列情報
  • total RNAなど

    以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

    サンプル量 濃度 純度
    OD260/OD280 OD260/OD230 28S/18S
    total RNA 4 μg以上 200 ng/μl以上 1.6以上 2.0以上
    組織・細胞(オプション) 別途ご相談

    ・RNAサンプルはRNase free水に溶解してください。
    ・DNase処理を実施してください。
    ・電気泳動にてrRNAの明瞭なバンドが検出され、分解していないことをあらかじめご確認ください。
    ・送付サンプルの採取方法によっては良質なRNAが抽出できない場合がございます。
    ・上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。

ご留意事項

ご送付いただいたRNAサンプルはアジレント2200 TapeStationなどを用いて検定を行います。この時点で量・純度が次の作業に十分でない場合はご連絡し、対応方法についてご相談いたします。
ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

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注意事項
  • 本受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。

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