• 3’Expression Arrayに加えて、低価格アレイやトランスクリプトームアレイなど豊富なラインナップ
• 複数プローブによる再現性の高い高精度なデータ
• ハイブリダイゼーション以降の工程の自動化により高い再現性の解析が可能
• フリーソフトウェア Transcriptome Analysis Console（TAC）Softwareを用いたデータ解析が可能
• 最短5営業日での短納期対応も可能

サーモフィッシャーサイエンティフィック社（旧アフィメトリクス社）の遺伝子発現解析用アレイは、フォトリソグラフィーとコンビナトリアル・ケミストリーを組み合わせ、オートメーション化された製造工程により、アレイ間の差が小さいことが特長です。これにより比較したい検体の遺伝子発現の差を高い精度で求めることが可能です。
タカラバイオでは、アフィメトリクス認定のサービスプロバイダーとして、各種アレイを用いた網羅的な遺伝子発現解析を行います。遺伝子工学に熟練した技術者と充実した設備により、精度の高いサービスを提供いたします。ご要望に応じて、組織や細胞からのRNA抽出も承ります。

■チラシをご覧ください。

アレイ発現解析受託サービス

遺伝子発現解析受託サービス

total RNAを送付いただき、cDNA合成、cRNA増幅、ハイブリダイゼーション、スキャニングなどの一連の作業を行います。解析にはサーモフィッシャーサイエンティフィック社が推奨する試薬・ソフトウェアを使用します。
組織・細胞からのRNA抽出やデータマイニングなどのオプション作業も充実しています。

代表的アレイ種類

物種	製品名	主要な搭載プローブ
ヒト	Human Genome U133 Plus 2.0 Array	38,500の遺伝子
	Clariom S Array, Human	20,800の遺伝子
	Clariom D Array, Human	948,300のエクソン
マウス	Mouse Genome 430 2.0 Array	34,000の遺伝子
	Clariom S Array, Mouse	22,100の遺伝子
	Clariom D Array, Mouse	498,500のエクソン
ラット	Rat Genome 230 2.0 Array	28,000の遺伝子
	Clariom S Array, Rat	22,900の遺伝子
	Clariom D Array, Rat	320,400のエクソン

アレイ詳細についてはサーモフィッシャーサイエンティフィック社のホームページをご覧ください。


Affymetrix Transcriptome Analysis Console（TAC）Softwareによる解析
TAC SoftwareはRawデータを取りこむことによって各種データマイニング処理が可能なサーモフィッシャーサイエンティフィック社が提供するフリーソフトウェアです。事前にお客様ご自身で、ご使用になられるPCにインストールしていただく必要がございますので、予めご了承ください。

＊ Affymetrix Transcriptome Analysis Console（TAC）Softwareは、サーモフィッシャーサイエンティフィック社より無償でインストールすることが可能です。


（サーモフィッシャーサイエンティフィック社資料より）


弊社過去取得データとの比較について
タカラバイオではGeneChip発現解析に使用するtotal RNA量を2018/5/21のサンプル到着分より、250 ngから100 ngに変更いたします。
インプットするtotal RNAの異なる解析データ間では、特に低発現領域に於いてバイアスのかかる可能性があることにご留意ください。

【オプションサービス】

• 組織や細胞からのRNA抽出
• DNase I 処理
• サンプル再精製（純度が低いRNAの精製）
• 微量total RNA（500 pg以上、濃度100 pg/μl以上）からの増幅^＊
• データマイニング^＊
＊ Clariom D Arrayは対応しておりません。

・オンライン注文では、事務手続き、作業内容を簡便化することによって低価格対応しております。
　オンライン注文に関してはこちらからアクセスください。
・表記以外の生物種のアレイは別途お問い合せください。


短納期対応解析について
GeneChip 3’ IVT Array（Human Genome U133 Plus 2.0 Array、Mouse Genome 430 2.0 Array）を短納期対応で最短5営業日で納品し、Clariom S Array（Clariom S,Human 、Clariom S,Mouse）を短納期対応で最短7営業日で納品いたします。

オンライン注文にてご依頼いただきます。注文入力時に、要望事項に「短納期解析希望」と記載ください。


■ 対応サンプルはtotal RNAのみとなります。必ず事前に濃度、純度を測定して、正確な値を入力ください。微量増幅オプションは短納期対応できません。
■ 入力するサンプル名称とチューブ記載名称を一致させてください。また、サンプル名称は10文字以内で登録ください。
■ 納品形態はWEB納品のみとなります。CD納品は別途有償となります。お問合せください。
■ 短納期対応による追加費用はございません。



■ 本サービスは毎週1週間の到着サンプルを、その週の金曜日に解析開始するサービスとなります。RNAサンプルは金曜日の午前必着でお送りください。
■ オンライン注文はその週の木曜日の15時までに必要情報を入力ください。15時以降の注文の場合は翌週金曜日の解析開始とさせていただきます。
■ 金曜日が祝日の場合には、前日の木曜日がサンプル到着期限日、その前日の水曜日がオンライン注文入力期限となります。
■ 解析期間中に祝日を挟む場合には＋2営業日となります。
■ 短納期対応の場合、RNA品質検定結果の報告は行いません。またQCデータの納品も行いません。
■ 品質検定で問題があった場合には、解析の進め方を相談いたします。その場合は納期等も変更となります。
　 解析中止となる場合は品質検定費用など、そこまでの作業費用を申し受けます。
■ 短納期対応可能な総解析数には限りがあります。依頼が集中した場合にはサンプル到着順で対応させていただきます。

GeneChip （3’IVT Expression）
・作業報告書
・解析補足資料（PDFファイル）
・Rawデータ（ARR、CEL、CHPファイル）
・QCレポート^※
・オリジナルビューワ
・解析データ　※Adobe AIR上で動く弊社オリジナルビューワで閲覧可能
　シグナルデータ
　発現比率データ
・Supplementalデータ
　csvファイル
　解析結果サンプル例の詳細はこちら

Clariom S Array
・作業報告書
・解析データ
　Rawデータ（ARR、CEL、CHPファイル）
　QCレポート^※

Clariom D Array
・作業報告書
・解析データ
　Rawデータ（ARR、CEL、CHPファイル）
　QCレポート

　※ 短納期対応での解析時には、RNA品質結果は納品いたしません。

オンライン注文とFAX注文の2種類からお選びください。

• オンライン注文：
  WEB会員登録後、必要事項を入力してご注文ください。オンライン注文へ
  
  ご注文方法の概略については、こちらをご参照ください。
  「オンラインのご注文方法について」
  
  ※オンライン注文ページは Internet Explorer11.0のバージョンのブラウザで動作確認をしております。それ以前のブラウザでは正しく機能しないことがありますのでご注意ください。 また、JavaScriptを無効にしている場合やポップアップブロックを有効にしている場合は、一部の画面が表示できません。


• FAX注文：
  • 解析依頼書をダウンロードいただき、必要事項をご記入ください。
  • 依頼書記載のサンプル名称と、送付検体に記載されている名称は統一してください。
  • サンプル送付の前に、記入済み依頼書を依頼書に記載のFAXまで送付ください。
    
    GeneChip（3’IVT Expression）
    • GeneChip発現解析依頼書（PDF）
    • GeneChip発現解析依頼書（Excel）
    
    オプションサービス
    
    • データマイニング解析依頼書（PDF）
    • データマイニング解析依頼書（Excel）
    
    Clariom S Array
    • Clariom S 発現解析依頼書（PDF）
    • Clariom S 発現解析依頼書（Excel）
    
    Clariom D Array
    • Clariom D / GeneChip Transcriptome Array発現解析依頼書（PDF）
    • Clariom D / GeneChip Transcriptome Array発現解析依頼書（Excel）

サンプル送付

• 解析サンプルならびに依頼書（オンライン注文の場合は注文依頼完了画面の印刷物）を上記サンプル送付先へご送付ください。
• サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、凍結状態を維持するために充分量のドライアイスを同梱し、冷凍便、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。

※サンプルのご準備、発送にあたり下記手引きに詳細を記載しています。

• total RNAなど
  以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

  	サンプル量＊2	濃度	純度＊3
  			OD260/OD280	OD260/OD230	28S/18S
  total RNA＊1	500 ng以上	50～300 ng/μl	1.6以上		1.8以上
  組織・細胞（オプション）	別途ご相談＊4

  ＊1	すでにpolyA＋ RNAの状態でサンプルをご用意されている場合は、別途ご相談ください。
  ＊2	原核生物の解析の場合は、total RNA量30 μg以上、濃度1 μg/μl以上の検体をご用意ください。 精製が必要なtotal RNAの場合、以下のRNA量をご用意ください。 エタノール沈殿：2 μg以上　　　　DNasa I 処理：10 μg以上
  ＊3	電気泳動にてrRNAの明瞭なバンドが検出され、分解していないことをあらかじめご確認ください。
  ＊4	送付サンプルの採取方法によっては良質なRNAが抽出できない場合がございます。

  
  

  ・	RNAサンプルはRNase free水に溶解し、1.5 mlチューブでご提供ください。TEや界面活性剤、DEPCを使用すると、反応を阻害する場合がありますので、溶解の際には絶対に使用しないでください。
  ・	RNAサンプル調製時にエタノール沈殿を実施する場合は、共沈剤としてグリコーゲンを添加しないでください。 血液検体由来RNAを調製される際は、抗凝固剤にヘパリンを使用しないでください。
  ・	上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。

・	送付サンプルに起因するシグナル検出不能の場合は、責任を負いかねますのであらかじめご了承ください。
・	ご送付いただいたRNAサンプルはアジレント2200 TapeStationなどを用いて検定を行います。この時点で量・純度が次の作業に十分でない場合ご連絡し、対応方法についてご相談いたします。
・	ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。 詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
・	お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。