rRNA遺伝子配列情報を用いた微生物種の推定

微生物推定解析

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タカラバイオ株式会社 バイオメディカルセンター 受託受付担当 宛て
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特長

  • サンガー法による高品質塩基配列解析による微生物種の推定
  • 最新のNCBIデータベースやDDBJデータベースを利用したin houseでの相同性検索

概要

第十七改正日本薬局方収載の方法に準じて、リボソームRNA遺伝子塩基配列を決定し、相同性検索による推定を行います。また、ご希望に沿ったリボソームRNA遺伝子塩基配列の決定にも対応いたします。

サービス内容

  • 16S rRNA配列部分解析(細菌)
    細菌の16S rRNA遺伝子の約500塩基の塩基配列を決定し、相同性検索結果より推定される菌種の上位リスト(50位)を納品いたします。
  • 16S rRNA配列全長解析(細菌)
    細菌の16S rRNA遺伝子の約1500塩基の塩基配列を決定し、相同性検索結果より推定される菌種の上位リスト(50位)を納品いたします。

    <16S rRNA配列 相同性検索結果例>
  • ITS1配列解析(真菌)
    真菌の18S rRNAと5.8S rRNA間のスペーサー領域(ITS1、約300塩基)の塩基配列を決定し、相同性検索結果より推定される菌種の上位リスト(50位)を納品いたします。
  • リボソームRNA配列解析(ご希望領域)
    真菌または細菌のrRNA塩基配列を決定し、相同性検索結果より推定される菌種の上位リストを納品いたします。
■チラシをご覧ください。
細菌叢・メタゲノム解析サービス

価格・納期

サービス項目 参考価格 参考納期
16S rRNA配列部分解析(細菌) ¥30,000  1検体あたり 2週間~
16S rRNA配列全長解析(細菌) ¥85,000  1検体あたり 2週間~
ITS1配列解析(真菌) ¥30,000  1検体あたり 2週間~
リボソームRNA配列解析(ご希望領域) 別途ご相談 2週間~

・リボソームRNA配列解析(ご希望領域)の価格は作業内容によって異なりますので別途ご相談ください。

納品物

  • 塩基配列解析結果
  • 相同性検索結果
  • 作業報告書
WEB納品も可能です。

ご注文方法

以下のフォーマットにご記入のうえ、依頼書記載のFAX番号へご送付ください。

受入サンプル

  • 通常解析:単離された菌体から調製したゲノムDNA(200 ng以上)

ご留意事項

タカラバイオでは菌種同定判断までは対応しておりません。得られた相同性検索結果よりお客様にご判断していただくことになります。
病原性が疑われるサンプルや生菌はお受けすることができません。
お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

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注意事項
  • 本受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。

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