• ヒトCpGサイトのメチル化解析
• ヒト全ゲノム網羅的およびイルミナ社が厳選したメチル化サイトの解析
• プローブ分類、統計解析など、データマイニングサービスも充実

イルミナ社ビーズアレイを用いたDNAメチル化解析を行います。注目されるエピジェネティクス関連研究として、DNAメチル化解析が可能です。
タカラバイオでは遺伝子工学に熟練した技術者と充実した設備により、精度の高いサービスをご提供いたします。

解析対象ビーズアレイ

• Infinium MethylationEPIC BeadChip　（85万以上のメチル化サイト）
  
  85万以上のメチル化サイトを搭載し、大規模なゲノムワイドでのメチル化解析が行えます。バイサルファイト法を採用しているため解析結果にバイアスが少なく、網羅的な解析が可能です。
  
  ‐ CpGアイランドおよびその周辺のCpGサイト
  ‐ ヒト幹細胞で同定された非CpGサイトのメチル化領域（CHHサイト）
  ‐ 腫瘍細胞と正常細胞間で異なるメチル化を示す領域
  ‐ FANTOM5エンハンサー領域
  ‐ ENCODEオープンクロマチンとエンハンサー領域
  ‐ DNase高感受性部位
  ‐ miRNAプロモーター領域
  ‐ HumanMethylation450K BeadChipに搭載されているコンテンツの90％以上
  
  

ビーズアレイ詳細についてはイルミナ社ホームページをご覧ください。

■チラシをご覧ください。
メチル化DNA解析サービス

ゲノムDNAをご送付いただき、イルミナ社の推奨する方法に従い、ターゲットの作製、ハイブリダイゼーション、スキャニングなどの一連の作業を行い、GenomeStudio Data Analysisソフトウェアを用いた解析データを納品いたします。

＜標準解析＞
GenomeStudioでの一時解析結果を納品します。
各検体ごとの標準化とメチル化レベルの算出までを行います。



充実したアノテーション情報（以下表）により、様々な視点から絞込みが可能です。



＜データマイニング解析＞
　　 プローブ、遺伝子、CpG Island毎にメチル化レベル(AVG_Beta値)に有意差のあるデータを抽出します。


Webブラウザで解析結果をグラフィカルに閲覧できるビューワを付属しています。



＜その他のオプションサービス＞

• FFPEサンプル由来DNAからの修復作業
  ホルマリン固定パラフィン包埋組織（FFPE）サンプルからの解析も可能です。

お問い合わせください。

• 作業報告書
• 解析データ（記録メディア）

• 依頼書作成とFAX連絡
  • DNAメチル化解析（ビーズアレイ）依頼書をダウンロードいただき、必要事項をご記入ください。
  • 依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
  • サンプル送付の前に、記入済み依頼書をメール添付またはFAXでご送付ください。
• サンプル送付
  • 解析サンプルならびに依頼書を下記サンプル送付先へご送付ください。
  • サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、冷蔵状態を維持するために充分量の保冷剤を同梱し、冷蔵便、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。

以下のフォーマットにご記入のうえ、依頼書記載のFAX番号へご送付ください。

• DNAメチル化解析（ビーズアレイ）依頼書（Excel）
• ヒトゲノム・遺伝子解析情報提供用紙（Excel） ※弊社「個人情報としてのゲノムデータの取り扱い」の詳細はこちらをご参照ください。
• 臨床検体又は供与細胞に関する情報提供用紙（Excel） ※臨床検体・細胞を送付いただく場合は、受託サービスをお申込みいただく前に、「臨床検体又は供与細胞に関する情報提供用紙」にご記入の上、弊社へお送りください。弊社にてご提供いただいた情報を元にお取り扱いの可否を判断して折り返しご連絡いたします。
  弊社「臨床検体のお取り扱いについて」の詳細はこちらをご参照ください。

• ゲノムDNA
  以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

  	サンプル量	濃度	純度
  			OD260/OD280	OD260/OD230
  ゲノムDNA	2 μg以上	50 ng/μl以上	1.6以上

  • DNAサンプルは、標準的なDNA調製キットを用いて調製されたものが使用できます。Reduced EDTA TE buffer：10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA pH 8.0などに溶解の上、規定濃度以上に調製してください。
  • RNAの混入により反応阻害が生じる可能性があります。必ず RNase 処理を実施したサンプルをご提供ください。
  • 48サンプル以上の場合は96ウェルプレートでご提供ください。プレートはハーフスカートプレートもしくはフルスカートプレートをご使用ください。
    ※推奨：Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates　cat.No 0030128648
    
    
  • DNAサンプルは、電気泳動（1％ゲル）で10～20 kbに明瞭なバンドが検出され、分解がないことをご確認ください。電気泳動写真を依頼書に添付してください。
  • サンプル受領後に、二本鎖DNAの定量および電気泳動による濃度・純度等の確認を行います。その結果によっては、DNAサンプルの再送をお願いする場合があります。あらかじめご了承ください。
  • FFPEサンプルの場合は、別途ご相談ください。

・	ご送付サンプルに起因するシグナル検出不能の場合は、責任を負いかねますのであらかじめご了承ください。
・	本解析作業は研究目的のみです。得られた結果は診断目的には利用できません。
・	ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。 詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
・	お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。