解析納品データについて

納品データ形式について

納品データは大きく分けて以下の3種に分かれており、CD-ROMまたは、WEB納品システムにて納品いたします。
  • 波形ファイル
    シーケンス解析により得られた波形シグナルのデータ

  • テキストファイル
    波形シグナルを塩基配列に変換したテキストデータ

  • その他のファイル
    データの種類 形式 説明
    波形データ SCF シーケンサー付属のベースコーラーを用いて変換したSCF形式の波形クロマトデータ
    AB1 シーケンサー付属のベースコーラーを用いて変換したAB1形式の波形クロマトデータ
    テキストデータ FASTA シーケンサー付属のベースコーラーを用いて変換したFASTA形式テキストデータ
    TRIM_FASTA FASTA形式テキストデータから低精度両末端塩基およびベクター配列を機械的に取り除いたデータ
    MULTI_FASTA FASTAおよびTRIM_FASTAの各ファイルをマルチ形式にまとめたファイル
    TXT シーケンサー付属のベースコーラーを用いて変換したplain塩基配列テキストデータ
    TRIM_TXT TXT形式データから低精度両末端塩基およびベクター配列を機械的に取り除いたデータ
    その他 EPQC PCR産物の電気泳動写真データ
    Phdcount.csv 各リードのQuality Valueなどを示す弊社独自のcsvファイル
    BLAST Blast相同性検索結果をまとめたファイル

    ご希望の場合に納品いたします(無料オプション)。プレート単位塩基配列解析依頼書の8.データ返却形式欄にご記入ください。
      その他の納品データ形式をご希望の場合は、お気軽にお問い合わせください。
     ・解析結果例(ワンパスシーケンス)(TST88.zip)
     ・解析結果例(ロングリード)(TST88-long.zip)

納品基準について

納品基準 Quality Value 15以上(精度97%以上)の塩基が300塩基以上あるデータが、全解析数の70%以上存在すること

・基準に満たない場合は再解析を行います。
・提供プライマープレートによる解析、サンプル由来により納品基準に満たない場合はこの限りではありません。
・ワンパスシーケンスの通常解析長は平均600~650塩基が全体の90%以上(PCR産物を除く)となっております。

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注意事項
  • 本受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。

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