ColE1 DNA(6646 bp)の制限酵素切断地図

数字は、EcoR Iの認識部位の中央を0として、その位置から制限酵素の最初の認識塩基までの数を表した。円の内側にはColE1を1ヵ所切断する制限酵素を列挙した。外側には2ヵ所と3ヵ所切断する酵素を列挙し、( )内はその制限酵素の切断数を示した。
A:切断数 B:制限酵素 C:最初の認識塩基の位置 D:塩基数(小さい順)

A

B

C

D

(1)































(2)





















































(3)
Afl II
ApaB I
ApaL I
Ava I
Bal I
Bmg I
Bpu1102 I
Bsb I
BseR I
Bsp1407 I
BssH II
BstX I
Bst1107 I
Cla I
Dsa I
EcoE I
EcoR I
Eco31 I
Fba I
HgiE II
Mlu I
Nae I
Nru I
Sac II
Sap I
Sca I
Sgf I
Sma I
SnaB I
Srf I
Uba D I
Uba E I
Acc I

Acc III

Bcg I

BsaB I

BsaX I

Bsi I

Bsm I

BspH I

BspLU11 I

Bsp24 I

BstP I
EcoO65 I)
CfrA I

Dra III

Drd I

EcoR V

Gdi II

HgiA I

HgiC I

Hin l I

Nsp V

Pfl1108 I

Pvu I

RleA I

Spl I

Stu I

Tth111 I

Xmn I

Bbv II


Bfi I


Bpu10 I


Bsp1286 I


BspG I

390
5356
937
5351
2120
4058
3458
4194
541
5087
4786
3993
1469
2309
5147
5479
6644
2429
4645
662
3897
2141
476
5147
5440
6437
3831
5351
4252
5350
4625
3560
1469
5310
1981
2287
1644
6360
2118
4556
2244
4625
1078
6110
4101
4628
4359
6117
1240
3655
741
3939
831
2089
2451
3939
3387
4119
1143
1545
5425
6487
2024
2108
937
2465
2001
4181
2696
4547
188
6240
2548
3956
3832
6360
456
2448
3322
5461
2564
4780
1493
4868
1680
4628
2076
3266
4410
1494
3143
6407
2690
4500
5860
937
2465
4058
1371
1714
4459

6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
6646
2805
3841
306
6340
1930
4716
2438
4208
2381
4265
1614
5032
527
6119
1758
4888
2415
4231
3198
3448
1258
5388
1488
5158
732
5914
402
6244
1062
5584
84
6562
1528
5118
2180
4466
1851
4795
594
6052
1408
5238
2528
4118
1992
4654
2139
4507
2216
4430
3271
3375
2948
3698
1144
1190
4312
1649
1733
3264
1360
1810
3476
1528
1593
3525
343
2745
3558


A

B

C

D































(4)











































(5)














(6)

BsrB I


BsrD I


Dra I


Eae I


Hae IV


Mme I


Msl I


Pst I


Pvu II


Ssp I


Ava II



Bci VI



Bsg I



BspM I



Eci I



Esp3 I



Gsu I



Ksp632 I



Mae I



Mfl I



Taq II



Cfr10 I




Sim I




Tat I




Afl III





BsaA I





Hae I

1309
1569
3537
2818
3247
6290
4073
5115
6336
2024
2108
2120
2422
4882
6475
493
877
1061
1665
5006
5809
5282
5363
6551
1649
2020
3432
371
471
6236
112
533
2222
4461
1042
3205
5804
6504
351
3288
3564
5738
1528
2235
2664
3552
1033
1179
5245
5511
1591
2995
3008
4355
1732
2537
3617
5799
552
3236
5441
5664
88
109
756
2568
597
608
2824
6059
1328
2450
4202
4448
1968
2141
4761
5977
6100
1059
1497
1952
2618
3541
355
2416
2445
5087
6437
1240
2337
3106
3655
3897
6025
515
1205
1488
4252
5459
6026
360
1209
2120
2564
3778

260
1968
4418
429
3043
3174
1042
1221
4383
12
84
6550
1593
2460
2593
184
384
6078
803
2502
3341
81
1188
5377
371
1412
4863
100
781
5765
421
1689
2239
2297
700
1184
2163
2599
276
1259
2174
2937
429
707
888
4622
146
266
2168
4066
13
1347
1404
3882
805
1080
2182
2579
223
1534
2205
2684
21
647
1812
4166
11
1184
2216
3235
246
1122
1752
3526
123
173
1216
2514
2620
438
455
666
923
4164
29
564
1350
2061
2642
242
549
769
1097
1861
2128
283
567
690
1135
1207
2764
444
849
911
1002
1214


A

B

C

D












































(7)




















(8)







































(9)

Hae II





Hin4 I





Mcr I





Mly I





Nla IV





Nsp I





Ple I





AlwN I






Bce83 I






Sfe I






Apo I







Cfr13 I







Sec I







Sml I







Tth111 II







Ace III

4780
1007
1366
2683
2764
3474
5414
530
2422
4398
4882
5772
6475
914
1327
2551
3832
4447
6360
881
1295
1336
3549
5409
5778
532
1182
1965
2001
4181
5974
1240
1605
1896
3655
4663
6456
876
1300
1341
3554
5404
5773
837
2585
3252
3453
4427
4491
5413
604
869
1145
2486
3572
3593
4567
793
2519
2929
3019
5282
5363
6551
2189
2494
3306
3818
4078
6132
6346
6644
112
533
773
1767
2222
3713
4461
5975
1091
1959
2199
2628
3666
4061
5147
5351
390
604
883
1145
2486
3572
3593
4581
116
627
642
666
4583
4925
5393
6587
1556
1589
2123

2226
81
359
710
1317
1940
2239
484
701
703
890
1892
1976
413
615
1200
1224
1281
1913
41
369
414
1749
1860
2213
36
650
783
1204
1793
2180
291
365
1008
1430
1759
1793
41
369
424
1749
1850
2213
64
201
667
922
974
1748
2070
21
265
276
974
1086
1341
2683
81
90
410
888
1188
1726
2263
214
260
298
305
512
812
2054
2191
240
421
455
748
783
994
1491
1514
204
240
395
429
868
1038
1086
2386
21
214
262
279
988
1086
1341
2455
15
24
175
342
468
511
1194
3917
33
116
120


A

B

C

D


































(10)



























































(11)







Bcef I








Tfi I








Taq I








BseM II









BsmA I









CjeP I









Fau I









Fin I









NspB II









Bet I










Bin I

2358
2478
3388
4492
4608
5882
751
1994
2482
2529
2732
2832
3634
3868
4697
1266
1685
2046
2758
2925
2970
3048
3344
4467
189
441
1322
2310
2433
2899
3039
3965
6241
977
2691
2772
3459
4501
4921
5411
5861
6056
6077
1592
2430
2995
3008
3238
4356
4367
4429
4690
4885
458
710
741
810
1449
3939
5232
5757
5849
6470
1519
1759
1944
2066
2169
2771
2829
3172
3533
4043
532
2479
3103
3180
3517
4667
4755
4839
4874
5190
911
1649
2020
2070
3334
3432
3453
5044
5147
5366
828
898
1045
1981
2086
2224
2287
2342
2525
4348
6035
438
569
597
604
683

235
534
910
1104
1274
2320
47
100
203
234
488
802
829
1243
2700
45
78
167
296
361
419
712
1123
3445
123
140
252
466
594
881
926
988
2276
21
81
195
420
450
490
687
1042
1546
1714
11
13
62
195
230
261
565
838
1118
3553
31
69
92
252
525
621
634
639
1293
2490
58
103
122
185
240
343
361
510
602
4122
35
77
84
88
316
337
624
1150
1947
1988
21
50
98
103
219
421
738
1264
1591
2141
55
63
70
105
138
147
183
936
1439
1687
1823
7
28
79
131
134


A

B

C

D








































(12)













(13)


(14)
(15)



(16)
(17)
(18)

(19)


(21)


(23)



(24)

(26)


(30)
(32)
(33)
(34)

(35)
(37)
(41)
(44)
(45)
(53)
(109)
(361)






Dde I










Eco57 I










Tau I










Tsp45 I












切断数13以上の制限酵素
Bcc I
Cje I
Mae II
Mva I
Hae III
Hga I
Hinf I
Hph I
TspR I
StyLT I
Bcn I
Fok I
Afa I
Dpn I
Mbo I(Sau3A I)
BsiY I
Mbo II
TspE I
BscG I
Bsr I
Cac8 I
Tsp4C I
Acc II
Mae III
Hha I
Nla III
SfaN I
Mse I
ScrF I
CviR I
Bbv I
Tse I
Mwo I
Hap II(Msp I)
Mnl I
Alu I
Fnu4H I
Aci I
CviJ I
Sss I

2820
4226
4551
4721
5921
6055
977
2691
2772
3425
3459
4501
4921
5411
5861
6056
6077
722
2276
3375
3752
5419
5468
5660
5666
5747
5932
6125
1053
1315
1402
1452
1947
2026
2110
2374
3455
5046
5243
1491
1586
1799
2090
2699
2798
2988
3383
3393
4866
5447
6512

170
325
1029
1200
1406
2137
21
34
81
195
420
450
490
653
1042
1546
1714
6
49
81
185
192
193
377
1099
1243
1554
1667
50
79
84
87
197
262
264
495
1081
1591
2456
10
95
99
190
213
291
395
581
609
1065
1473
1625

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