LNA microRNA定量PCR用プレート

microRNA Focus PCR Panel : Toxicology

  • 毒性学に関連する87種類のmicroRNA定量PCRプライマーを搭載したPCRパネル
  • 生体液サンプルに関するExiqon社の数千のデータと論文からmicroRNAを選択
  • ヒト、ラット、イヌ、サルの生体液サンプルに適応可能
  • わずか20 μlの血清/血漿から、高感度で特異性の高いmicroRNAのプロファイリングを実現
  • 約3時間で全ての操作が完了
  • 使用機種に応じて96 well plate、384 well plateを選択可能

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製品コード TaKaRa
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EXQ 203851 E23851 Toxicology Focus microRNA PCR Panel, Human, 96 well (V4.RO)
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EXQ 203852 E23852 Toxicology Focus microRNA PCR Panel, Human, 96 well (V4.AF)
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EXQ 203869 E23869 Toxicology Focus microRNA PCR Panel, Monkey, 96 well (V4.RO)
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EXQ 203871 E23871 Toxicology Focus microRNA PCR Panel, Monkey, 96 well (V4.MI)
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EXQ 203874 E23874 Toxicology Focus microRNA PCR Panel, Monkey, 384 well (V4.M)
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製品説明

Toxicology Focus microRNA PCR Panelは、ヒト、ラット、イヌ、サルの血漿、血清、尿、脳脊髄液などの生体液サンプル中で、器官損傷に関連して変動するmicroRNAを対象とした定量PCRパネルである。製品には、反応性が確認された以下のmicroRNA PCR用プライマーセットが搭載されており、毒性学関連の研究に用いることができる。
  • 臓器特異的損傷マーカーとなるmicroRNA
  • 組織特異的または特定の組織で有意に発現しているmicroRNA
  • 多くの組織で高レベルに発現しているmicroRNA
搭載されているプライマーセットは、数千の生体液サンプルから得られたmicroRNA発現データを含むExiqon社のデータベースをもとに毒物学研究のために選択されたもので、器官損傷を研究している研究者が関連する全てのプライマーを利用できるように考慮されている。
本製品は、96 well plate、または384 well plateの各ウェルに、設計済、反応性確認済のmicroRNA LNA PCR Primer Setが1反応分ずつ乾燥状態で含まれており、Universal cDNA Synthesis Kit II(製品コード 203301)で逆転写したcDNAとExiLENT SYBR Green master mix(製品コート 203402/203420)を混合するだけで、すぐに反応を開始することができる。プレートタイプが異なる複数の製品が用意されており、リアルタイムPCR装置の機種に応じた製品を選択することができる。
cDNA合成反応およびリアルタイムPCR反応には必ずExiqon社の試薬を使用してください。

組織損傷バイオマーカーとしてのmicroRNA

尿、血清、血漿、脳脊髄液など生体液サンプル中のmicroRNAは、さまざまな病気や健康状態を知るための低浸潤性バイオマーカーとして注目を集めている。また、尿、血清、血漿などの一般的な臨床サンプル中に存在するmicroRNAは非常に安定であることが知られている。
組織損傷によってmicroRNAが周囲の細胞外間隙に放出されることが明らかにされ、障害の性質に応じて組織特異的microRNAやその他のmicroRNAの増加を個々の生体液サンプルで検出することが可能となってきた。
Exiqon社のmiRCURY LNA Universal RT microRNA PCR systemは、生体液サンプル中のmicroRNAプロファイリングに必要な高い感度を備えており、20 μlの血清、血漿サンプルからプロファイリングを実施することができる。

表1. Toxicology Focus microRNA PCR Panelに搭載されるプライマー数(96ウェルの例)
  ヒト (hsa) ラット (rno) サル (mml) イヌ (cfa)
Toxicology-specific miRNAs*1

1×87

1×87

1×87

1×87

Inter-plate calibrators*2

3

3

3

3

RNA spike-in*3

5

5

5

5

Blank

1

1

1

1

Total

96

96

96

96

搭載されたプライマー情報の詳細はExiqon社Webサイトからダウンロードできます。
*1 陽性コントロールとなるmicroRNAを含む
*2 UniSp3 IPC
*3 UniSp2, UniSp4, UniSp5, UniSp6, cel-miR-39

適応機種

96-well instrument coverage

AF-type

Applied Biosystems 7500 Fast, 7900 Fast, 7900HT Fast Real-Time PCR system
Applied Biosystems StepOnePlus Real-Time PCR system
Applied Biosystems ViiA 7 (FAST)
Applied Biosystems Quantstudio w. 96 well FAST block

RO-type

Roche LightCycler 480 Real-Time PCR system

MI-type

Applied Biosystems 7000, 7300, 7500, 7700 Real-Time PCR system
Applied Biosystems ViiA 7 (96-well Block)
Applied Biosystems Quantstudio w. 96 well std. block
BioRad iCycler, iQ4, iQ5, MyiQ, Chromo4
Eppendorf Mastercycler ep Realplex
Stratagene Mx4000 (after 2003)

ST-type

Stratagene Mx3000P, Mx3005P


384-well instrument coverage

M-type

Applied Biosystems 7900HT and ViiA 7 Real-Time PCR system
Bio-Rad CFX 384 Real-Time PCR system

R-type

Roche LightCycler 480 Real-Time PCR system

使用例

近位尿細管の損傷により急性腎不全を起こすことが知られているネフロトキシンをラットに腹腔内投与した後、尿サンプルから得られたRNAをToxicology Focus microRNA PCR Panelによりプロファイリング解析した。
教師なしクラスター解析により、ネフロトキシン投与によりmicroRNA発現が有意に変化しており、発現差は時間とともに増加していた。図1のヒートマップでは、35種類のmicroRNAの16サンプルの結果を示している。また、rno-miR-21-5p、rno-miR-34a-5p、rno-miR-192-5pについての増加率を図2に示す。


図1.microRNA発現のヒートマップ解析
教師なしクラスター解析を35種のmicroRNAのCq値を使用して行った。青色は平均以上の発現レベルを、黄色は平均以下の発現を示す。サンプル名として、3dC1~4=コントロールの3日後、3dT1=処理動物の3日後、5dC1~4=コントロールの5日後、5dT1~4=処理動物の5日後、のサンプルを示している。


図2.ネフロトキシン処理によるrno-miR-21-5p、rno miR-34a-5p、rno-miR-192-5pの増加率

PCRパネルレイアウトファイル

PCRパネル製品に搭載されているLNA miRNA PCR primer setの詳細は、こちらのExiqon社Webサイトに掲載されているレイアウトファイルにてご確認ください。

内容

Toxicology Focus microRNA PCR Panel, 96 well(製品コード 203851~203854、203857~203860、203863~203866、203869~203872)
96 well plateが4枚(1枚に1回分のプライマーセットが含まれており、4サンプル解析可能)

Toxicology Focus microRNA PCR Panel, 384 well(製品コード 203855、203856、203861、203862、203867、203868、203873、203874)
384 well plateが2枚(1枚に4回分のプライマーセットが含まれており、8サンプル解析可能)

保存

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