SMARTer ICELL8 3' DE Kit

  • ハイスループットなシングルセル解析:1,200~1,500個のシングルセルのシーケンスデータを一度に取得
  • サンプルの柔軟性:一度の実験で最大8種類の異なる細胞サンプルを解析可能
  • mRNA 3'配列の濃縮:mRNA 3'末端由来の配列のみを解析することで遺伝子発現差解析に必要とされるリード数を減らすことが可能
  • Illuminaシーケンシンスライブラリー:Illumina社NGSプラットフォームのシーケンシングに適したライブラリーを作製
メーカー
略称
製品コード TaKaRa
Code
製品名 容量 価格(税別) 特記事項 説明書
データシート
ベクター情報
参考
資料
CLN 640164 WF0146 SMARTer® ICELL8® Chip and Reagent 3' DE Kit
  • New
  • 化学物質排出把握管理促進法(PRTR法)
  • 安全データシート(SDS)添付
1 Kit ¥431,000
説明書・データシート・ベクター情報
CLN 640165 WF0147 SMARTer® ICELL8® Chip and Reagent 3' DE Kit
  • New
  • 化学物質排出把握管理促進法(PRTR法)
  • 安全データシート(SDS)添付
3 Kit ¥1,035,000
説明書・データシート・ベクター情報
CLN 640166 WF0148 SMARTer® ICELL8® Chip and Reagent 3' DE Kit
  • New
  • 化学物質排出把握管理促進法(PRTR法)
  • 安全データシート(SDS)添付
5 Kit ¥1,615,000
説明書・データシート・ベクター情報
CLN 640143 WF0095 SMARTer® ICELL8® 3' DE Chip
  • New
1 Chip ¥275,000
CLN 640005 WF0101 SMARTer® ICELL8® 3' DE for UMI Reagent Kit
  • New
1 Kit ¥67,000
CLN 640048 WF0128 SMARTer™ ICELL8® Collection Kit
  • New
1 Kit ¥4,000
説明書・データシート・ベクター情報
CLN 640109 WF0114 SMARTer™ ICELL8® Loading Kit
  • New
1 Kit ¥4,000
説明書・データシート・ベクター情報

製品説明

SMART法を用いたシングルセルRNA-seqライブラリー構築と、SMARTer ICELL8システムの細胞分離と細胞選択能力を組み合わせることで、最大8種類のサンプルからのシングルセルの遺伝子差発現解析のためのIlluminaシーケンスライブラリーの調製が可能です。

細胞サンプルの染色および希釈後、SMARTer ICELL8システムを用いて細胞をSMARTer ICELL8 3' DE Chipに分注します。SMARTer ICELL8 3' DE Chipは4センチ四方に5,184個のナノウェルを搭載しており、各ナノウェルにウェル標識バーコードを付加したoligo dT primerを含んでいます。細胞の分注後、付属の専用ソフトウエアCellSelect Softwareを使用し、イメージングにて生存しているシングルセルを含むウェルを選択します。解析を行う細胞を選択後、対象となるウェルにRT-PCR試薬を分注し、一回のランでcDNA合成および増幅の両方をチップ内で行います。RT-PCR後、cDNA産物をプール、精製し、transposaseに基づく方法でmRNA 3'末端のcDNAを濃縮した後、イルミナインデックス配列を組み込んだPCR増幅を行いシーケンス用ライブラリーの調製を行います。

作製されたライブラリー由来のシーケンスデータは、ナノウェル特異的バーコード配列を用いて個々の細胞にトレースされ、mRNA 3'末端カウンティングによる遺伝子差発現分析を行うことが可能です。1,200~1,500個の細胞から高品質で3'末端に焦点を絞ったシーケンスデータを取得することにより、シングルセルの効率的で低コストなハイスループットな遺伝子差発現分析を行うことが可能です。

3' DE発現解析にUMIを使用する場合とUMIを使用しない場合で必要試薬が異なります。詳細は表1をご覧ください。

表1. 3' DE発現解析にUMIを使用する場合とUMIを使用しない場合の製品選択について
  UMIを使用しない場合 UMIを使用する場合
製品名 SMARTer ICELL8 Chip and Reagent 3' DE Kit 必要試薬をまとめたキット製品はご用意していません。以下試薬を個別にご購入ください。
製品コード 640164、640165、640166 -
構成品 ・SMARTer ICELL8 3' DE Chip(640143) ・SMARTer ICELL8 3' DE Chip(640143)
・SMARTer ICELL8 Collection Kit(640048) ・SMARTer ICELL8 Collection Kit(640048)
・SMARTer ICELL8 Loading Kit(640109) ・SMARTer ICELL8 Loading Kit(640109)
・SMARTer ICELL8 3' DE Reagent Kit(640167)(逆転写酵素を含む) ・SMARTer ICELL8 3' DE for UMI Reagent Kit(640005)(逆転写試薬は含まれません)
プロトコール 1 Step RT-PCR 2 Step RT-PCR
細胞溶解 凍結融解 (-80℃, 30 min)とTriton 凍結融解 (-80℃, 30 min)

なお、血球系サンプルにはSMARTer ICELL8 Chip and Reagent 3' DE Kitのご使用をお勧めします。

細胞調製の条件検討で分注テストを行う際には、各ウェルにpreprinted oligo(dT)プライマーが付加されていないBlank Chipをご利用ください。

内容

SMARTer ICELL8 Chip and Reagent 3' DE Kit(製品コード 640164/640165/640166)
  • SMARTer ICELL8 3' DE Chip
  • SMARTer ICELL8 Collection Kit
  • SMARTer ICELL8 Loading Kit
  • SMARTer ICELL8 3' DE Reagent Kit
    Box 1: Control K562 Total RNA (1 μg/μl)
    Box 2: MgCl2 (1 M)
    5X First-Strand Buffer
    SeqAmp PCR Buffer (2X)
    SMARTScribe Reverse Transcriptase (100 U/μl)
    SeqAmp DNA Polymerase
    Triton X-100 (10%)
    SMARTer ICELL8 3’ DE Oligo Mix
    DTT (100 mM)
    GC Melt (5 M)
    dNTP Mix (25 mM each)
    Second Diluent (100X)
    ICELL8 Fiducial Mix (1X)
    RNase Inhibitor (40 U/μl)
    Primer P5 (5 μM)
    Nuclease-Free Water

SMARTer ICELL8 3' DE for UMI Reagent Kit (製品コード 640005)
  • Fiducial Mix
  • Second Diluent
  • Amplification Primer
  • RT E5OLIGO
  • Nextera Primer P5

SMARTer ICELL8 Collection Kit (製品コード 640048)
  • Collection Fixture
  • Collection Tube
  • Collection Film

SMARTer ICELL8 Loading Kit (製品コード 640109)
  • Blotting Paper
  • Optical Imaging Film
  • TE Sealing Film

保存

SMARTer ICELL8 3' DE Chip:室温
SMARTer ICELL8 Collection Kit:室温
SMARTer ICELL8 Loading Kit:室温
Control K562 RNA:-70℃
その他:-20℃

この製品を見た人は、こんな製品も見ています。

注意事項
  • 弊社の取扱い製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、家庭用品等として使用しないでください。
  • タカラバイオの承認を得ずに製品の再販・譲渡、再販・譲渡のための改変、商用製品の製造に使用することは禁止されています。
  • タカラバイオ製品に関連するライセンス・パテントについては、ライセンスマークをクリックして内容をご確認ください。
    また、他メーカーの製品に関するライセンス・パテントについては、各メーカーのウェブサイトまたはメーカー発行のカタログ等でご確認ください。
  • ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。

▲このページのトップへ