次世代シーケンサーによる糞便・環境サンプルの細菌叢解析

16S (V3-V4) Metagenomic Library Construction Kit for NGS

メーカー
略称
製品コード TaKaRa
Code
製品名 容量 価格(税別) 特記事項 説明書
データシート
ベクター情報
参考
資料
TKR R161A R161A 16S (V3-V4) Metagenomic Library Construction Kit for NGS
50回 ¥96,000
説明書・データシート・ベクター情報
TKR R161B(A×2) R161B(A×2) 16S (V3-V4) Metagenomic Library Construction Kit for NGS
100回 ¥180,000
説明書・データシート・ベクター情報

製品説明

本製品は、イルミナ社MiSeqで16S rRNA細菌叢解析を行うためのPCR増幅キットである。細菌16S rRNA遺伝子のV3-V4領域を対象とし、PCR酵素に、多様な配列を効率よく増幅可能なTks Gflex DNA Polymeraseを採用している。
V3-V4領域の増幅には使用実績の高い341F、806Rプライマーを採用しており(参考文献1、2、図1)、プライマーの5’側には、Illumina MiSeq用のoverhang配列が付加されている。本製品で増幅したPCR産物に、Nextera XT Index Kit(イルミナ社)のプライマーでシーケンスアダプターと検体ごとのシーケンスデータを識別するためのIndex配列を付加することにより、MiSeq用のライブラリーを調製する(図2)。
【注意】ライブラリー作製には本キットの他に以下の製品もご用意ください。
  • Nextera XT Index Kit(イルミナ社)
  • Agencourt AMPure XP(Beckman Coulter社)

図1.16S rRNAの可変領域と本製品のPCR増幅領域

図2.ライブラリー作製のフロー

内容

(50回)
  1. 2×Gflex PCR Buffer (Mg2+, dNTP plus)
    1.25 ml
  2. Tks Gflex DNA Polymerase(1.25 units/μl)
    62.5 U(50 μl)
  3. 16S V3-V4 Primer Mix(10×)
    125 μl
  4. H2O
    1 ml

キット以外に必要な試薬、機器など(主なもの)

・核酸抽出キット
[糞便試料の場合]
NucleoSpin DNA Stool(製品コード 740472.10/.50)など
[土壌試料の場合]
NucleoSpin Soil(製品コード 740780.10/.50/.250)など
PCR産物の精製
Agencourt AMPure XP(Beckman Coulter社 Code. A63880/A63881/A63882)
0.2 ml 磁気スタンド:Magnetic Separator-PCR Strip(製品コード 635011)など
80% エタノール
溶出液(10 mM Tris-HCl, pH8.5)
・シーケンスアダプターとIndex配列の付加
Nextera XT Index Kit(イルミナ社 Code. FC-131-1001/FC-131-1002)
Nextera XT Index Kit v2 set A-D(イルミナ社 Code. FC-131-2001~2004)
・サーマルサイクラー
TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch(製品コード TP350)
TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Gradient(製品コード TP600)など
・アガロース電気泳動装置
Mupid-2plus(製品コード M-2P)
Mupid-exU(製品コード EXU-1)など
・アガロースゲル
Agarose L03「TAKARA」(製品コード 5003/5003B)
PrimeGel Agarose PCR-Sieve(製品コード 5810A)など
・微量高速遠心機
・マイクロピペットおよびチップ

保存

-20℃

この製品を見た人は、こんな製品も見ています。

注意事項
  • 弊社の取扱い製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、家庭用品等として使用しないでください。
  • タカラバイオの承認を得ずに製品の再販・譲渡、再販・譲渡のための改変、商用製品の製造に使用することは禁止されています。
  • タカラバイオ製品に関連するライセンス・パテントについては、ライセンスマークをクリックして内容をご確認ください。
    また、他メーカーの製品に関するライセンス・パテントについては、各メーカーのウェブサイトまたはメーカー発行のカタログ等でご確認ください。
  • ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。

▲このページのトップへ