制限酵素切断部位数一覧表

*	R：	A or G	D：	A or G or T
	Y：	C or T	H：	A or C or T
	W：	A or T	V：	A or C or G
	S：	G or C	B：	C or G or T
	M：	A or C	N：	A or C or G or T
	K：	G or T

赤字は、タカラバイオで販売している酵素です。

制限酵素	認識配列*	切　断　部　位　数
制限酵素	認識配列*	pKF3	pUC19	pUC119	pBR322	ΦX174	ColE 1	M13mp18	λ	Ad2
Aat II	GACGTC	0	1	1	1	1	0	0	10	3
Acc I	GTMKAC	2	1	1	2	2	2	1	9	17
Acc II	CGCG	7	10	14	23	14	24	18	157	303
Acc III	TCCGGA	1	0	0	1	0	2	0	24	8
Ace III	CAGCTC(7/11)	3	3	4	5	1	9	2	29	29

Aci I	CCGC(-3/-1)	22	34	39	67	36	53	42	516	582
Afa I	GTAC	5	3	4	3	11	19	19	113	83
Afl II	CTTAAG	0	0	0	0	2	1	0	3	4
Afl III	ACRYGT	2	1	1	1	2	6	3	20	25
Age I	ACCGGT	0	0	0	0	0	0	0	13	5

Alu I	AGCT	14	15	17	17	24	44	27	143	158
AlwN I	CAGNNNCTG	1	1	1	1	0	7	1	41	25
Aor13H I	TCCGGA	1	0	0	1	0	2	0	24	8
Aor51H I	AGCGCT	1	0	0	4	0	0	2	2	13
Apa I	GGGCCC	0	0	0	0	0	0	0	1	12

ApaB I	GCANNNNNTGC	1	1	0	2	2	1	0	33	20
ApaL I	GTGCAC	1	3	3	3	1	1	0	4	7
Apo I	RAATTY	3	1	3	1	7	8	11	58	29
Asc I	GGCGCGCC	0	0	0	0	0	0	0	2	2
Ava I	CYCGRG	2	1	2	1	1	1	2	8	40

Ava II	GGWCC	1	2	2	8	1	4	1	35	73
Avi II	TGCGCA	1	2	2	4	1	0	1	15	17
Bae I	(10/15)ACNNNNGTAYC(12/7)	0	0	0	0	1	0	3	10	5
Bal I	TGGCCA	1	0	0	1	0	1	1	18	17
BamH I	GGATCC	1	1	1	1	0	0	1	5	3

Ban II	GRGCYC	1	1	2	2	0	0	2	7	57
Bbe I	GGCGCC	0	1	1	4	2	0	1	1	20
Bbv I	GCAGC(8/12)	7	12	13	21	14	34	10	199	179
Bbv II	GAAGAC(2/6)	0	0	0	3	3	3	0	24	27
Bcc I	CCATC	1	3	5	9	12	13	14	145	62

Bcef I	ACGGC(12/13)	3	2	3	3	11	9	7	115	80
Bce83 I	CTTGAG(16/14)	3	4	4	6	2	7	5	13	19
Bcg I	(10/12)GCANNNNNNTCG(12/10)	0	1	1	3	2	2	0	28	10
Bci VI	GGATAC	1	2	2	2	4	4	0	26	9
Bcn I	CCSGG	5	7	7	10	1	18	4	114	97

Bet I	WCCGGW	4	3	3	5	3	11	6	81	28
Bfi I	ACTGGG(4/11)	1	2	2	5	0	3	1	4	22
Bgl I	GCCNNNNNGGC	0	2	2	3	0	0	1	29	20
Bgl II	AGATCT	1	0	0	0	0	0	1	6	11
Bin I	GGATC(4/5)	6	10	10	12	0	11	4	58	35

Bln I	CCTAGG	0	0	0	0	0	0	0	2	2
BmeT110 I	CYCGRG	2	1	2	1	1	1	2	8	40
Bmg I	GKGCCC	1	0	0	0	0	1	1	6	50
BmgT120 I	GGNCC	3	6	7	15	2	8	4	74	164
Bpl I	GAGNNNNNCTC	1	0	0	0	0	0	0	1	12

Bpu10 I	CCTNAGC(-5/-2)	1	0	0	1	7	3	4	19	23
Bpu1102 I	GCTNAGC	0	0	0	0	0	1	0	6	8
BsaA I	YACGTR	2	0	1	1	2	6	5	14	22
BsaB I	GATNNNNATC	0	0	0	1	2	2	2	21	2
BsaX I	ACNNNNNCTCC	1	1	2	0	0	2	4	19	29

Bsb I	CAACAC	0	1	2	2	0	1	2	18	12
BscG I	CCCGT	4	6	7	12	2	23	8	104	71
BseM II	CTSAG	3	5	5	7	10	10	23	79	75
BseR I	GAGGAG(10/8)	0	0	0	0	2	1	1	19	63
Bsg I	GTGCAG(16/14)	0	0	0	1	0	4	0	41	34

Bsi I	CTCGTG(-5/-1)	1	3	3	3	2	2	0	8	11
BsiY I	CCNNNNNNNGG	9	6	9	20	19	21	17	176	216
Bsm I	GAATGC(1/-1)	3	0	0	1	4	2	1	46	10
BsmA I	GTCTC(1/5)	2	4	4	3	4	10	5	37	60
BspG I	CTGGAC	0	0	0	3	2	3	1	17	31

BspH I	TCATGA	0	3	3	4	3	2	1	8	3
BspLU11 I	ACATGT	1	1	1	1	0	2	3	2	9
BspM I	ACCTGC(4/8)	1	1	1	1	3	4	3	41	39
Bsp1286 I	GDGCHC	3	5	6	10	3	3	5	38	105
Bsp1407 I	TGTACA	0	0	0	0	0	1	1	5	5

Bsp24 I	(8/13)GACNNNNNNTGG(12/7)	2	3	3	4	1	2	1	18	18
BspT104 I	TTCGAA	1	0	0	0	0	2	0	7	1
BspT107 I	GGYRCC	2	4	5	9	3	2	7	25	57
Bsr I	ACTGG(1/-1)	6	11	12	19	9	23	18	110	86
BsrB I	GAGCGG(-3/-3)	1	3	4	2	1	3	4	17	28

BsrD I	GCAATG(2/0)	1	2	2	2	4	3	3	44	14
BssH II	GCGCGC	0	0	0	0	1	1	0	6	52
Bst1107 I	GTATAC	1	0	0	1	0	1	0	3	3
BstP I	GGTNACC	1	0	0	0	0	2	0	13	10
BstX I	CCANNNNNNTGG	0	0	0	0	3	1	0	13	10

Cac8 I	GCNNGC	10	14	17	31	19	23	28	237	285
CfrA I	GCANNNNNNNNGTGG	0	0	0	0	0	2	0	10	8
Cfr10 I	RCCGGY	0	1	2	7	0	5	1	61	40
Cfr13 I	GGNCC	3	6	7	15	2	8	4	74	164
Cje I	(8/14)CCANNNNNNGT(15/9)	5	8	8	9	6	13	8	88	79

CjeP I	(7/13)CCANNNNNNNTC(14/8)	3	6	6	10	5	10	3	92	65
Cla I	ATCGAT	1	0	0	1	0	1	2	15	2
Cpo I	CGGWCCG	0	0	0	0	0	0	0	5	2
CviJ I	RGCY	39	44	51	73	69	109	102	692	680

赤字は、タカラバイオで販売している酵素です。

制限酵素	認識配列*	切　断　部　位　数
制限酵素	認識配列*	pKF3	pUC19	pUC119	pBR322	ΦX174	ColE 1	M13mp18	λ	Ad2
CviR I	TGCA	4	13	13	21	18	33	18	272	207
Dde I	CTNAG	4	6	6	8	14	11	29	104	97
Dpn I	G^6mATC	12	15	15	22	0	19	7	116	87
Dra I	TTTAAA	2	3	3	3	2	3	5	13	12
Dra III	CACNNNGTG	0	0	1	0	1	2	1	10	10

Drd I	GACNNNNNNGTC	1	2	3	2	1	2	1	3	6
Drd II	GAACCA	1	0	1	0	4	0	7	22	21
Dsa I	CCRYGG	2	0	0	2	3	1	2	46	82
Eae I	YGGCCR	2	3	3	6	2	3	3	39	70
Eam1105 I	GACNNNNNGTC	0	1	1	1	1	0	0	9	9

Eco31 I	GGTCTC(1/5)	0	1	1	1	0	1	0	2	18
Eco52 I	CGGCCG	1	0	0	1	0	0	0	2	19
Eco57 I	CTGAAG(16/14)	1	2	2	2	0	11	0	40	23
Eco81 I	CCTNAGG	0	0	0	0	0	0	1	2	7
Eci I	TCCGCC	2	3	3	4	2	4	2	32	29

EcoE I	GAGNNNNNNNATGC	0	0	0	1	0	1	0	10	4
EcoN I	CCTNNNNNAGG	0	0	0	1	0	0	0	9	10
EcoO65 I	GGTNACC	1	0	0	0	0	2	0	13	10
EcoO109 I	RGGNCCY	0	1	1	4	0	0	0	3	44
EcoR I	GAATTC	1	1	1	1	0	1	1	5	5

EcoR V	GATATC	0	0	0	1	0	2	0	21	9
EcoT14 I	CCWWGG	1	0	0	1	0	0	0	10	44
EcoT22 I	ATGCAT	0	0	0	0	0	0	0	14	10
Esp3 I	CGTCTC(1/5)	2	2	2	1	0	4	1	14	21
Fau I	CCCGC(4/6)	2	5	7	10	0	10	10	90	147

Fba I	TGATCA	1	0	0	0	0	1	0	8	5
Fin I	GGGAC	1	0	0	4	2	10	2	38	59
Fnu4H I	GCNGC	16	19	22	42	31	45	17	380	411
Fok I	GGATG(9/13)	1	5	5	12	8	18	4	150	78
Fse I	GGCCGGCC	0	0	0	0	0	0	0	0	3

Gdi II	YGGCCG(-5/-1)	1	3	3	5	2	2	2	23	72
Gsu I	CTGGAG(16/14)	1	1	1	4	3	4	2	25	32
Hae I	WGGCCW	6	3	3	7	6	6	4	64	56
Hae II	RGCGCY	3	3	5	11	8	6	6	48	76
Hae III	GGCC	12	11	13	22	11	15	15	149	216

Hae IV	GAYNNNNNRTC	2	1	1	3	6	3	4	39	16
Hap II	CCGG	12	13	14	26	5	37	18	328	171
Hga I	GACGC(5/10)	2	4	4	11	14	15	7	102	87
HgiA I	GWGCWC	2	5	5	8	3	2	3	28	38
HgiE II	ACCNNNNNNGGT	1	2	1	2	1	1	1	14	10

Hha I	GCGC	9	17	23	31	18	26	26	215	375
Hin1 I	GRCGYC	0	3	3	6	7	2	1	40	44
Hinc II	GTYRAC	3	1	1	2	13	0	1	35	25
Hind III	AAGCTT	1	1	1	1	0	0	1	7	12
Hinf I	GANTC	4	6	8	10	21	15	27	148	72

Hin4 I	GABNNNNNVTC	4	2	2	5	9	6	5	59	52
Hpa I	GTTAAC	1	0	0	0	3	0	0	14	6
Hph I	GGTGA(8/7)	9	7	8	12	9	15	18	168	99
Kpn I	GGTACC	1	1	1	0	0	0	1	2	8
Ksp632 I	CTCTTC(1/4)	0	3	3	2	2	4	2	34	29

Mae II	ACGT	7	5	11	10	19	13	22	143	83
Mae III	GTNAC	6	11	13	17	17	24	24	156	118
Mbo I	GATC	12	15	15	22	0	19	7	116	87
Mbo II	GAAGA(8/7)	5	7	8	11	11	21	11	130	113
Mcr I	CGRYCG	4	5	5	7	1	6	4	22	50

Mfl I	RGATCY	4	7	7	8	0	4	3	21	22
Mlu I	ACGCGT	1	0	0	0	2	1	0	7	5
Mly I	GACTC(5/5)	2	4	6	4	10	6	8	61	40
Mme I	TCCRAC(20/18)	3	2	3	4	5	3	4	18	25
Mnl I	CCTC(7/6)	10	13	14	26	34	41	61	262	397

Mse I	TTAA	8	13	20	15	35	30	63	195	115
Msl I	CAYNNNNRTG	1	3	3	7	7	3	2	62	35
Msp I	CCGG	12	13	14	26	5	37	18	328	171
Mun I	CAATTG	0	0	0	0	1	0	0	8	4
Mva I	CCWGG	8	5	5	6	2	14	7	70	136

Mwo I	GCNNNNNNNGC	11	13	17	34	21	35	20	346	391
Nae I	GCCGGC	0	0	1	4	0	1	1	1	13
Nco I	CCATGG	1	0	0	0	0	0	0	4	20
Nde I	CATATG	1	1	0	1	0	0	3	7	2
Nhe I	GCTAGC	1	0	0	1	0	0	0	1	4

Nla III	CATG	6	11	11	26	22	26	15	181	183
Nla IV	GGNNCC	6	11	14	24	6	6	18	82	178
Not I	GCGGCCGC	1	0	0	0	0	0	0	0	7
Nru I	TCGCGA	0	0	0	1	2	1	0	5	5
Nsb I	TGCGCA	1	2	2	4	1	0	1	15	17

Nsp I	RCATGY	2	3	3	4	0	6	6	32	41
Nsp V	TTCGAA	1	0	0	0	0	2	0	7	1
NspB II	CMGCKG	5	6	6	6	5	10	4	75	95
Pac I	TTAATTAA	0	0	0	0	0	0	1	0	1

赤字は、タカラバイオで販売している酵素です。

制限酵素	認識配列*	切　断　部　位　数
制限酵素	認識配列*	pKF3	pUC19	pUC119	pBR322	ΦX174	ColE 1	M13mp18	λ	Ad2
Pfl1108 I	TCGTAG	0	1	1	2	0	2	2	13	18
Ple I	GAGTC(4/5)	2	4	6	4	10	6	8	61	40
PmaC I	CACGTG	0	0	0	0	0	0	0	3	10
Pme I	GTTTAAAC	0	0	0	0	0	0	0	2	1
PpuM I	RGGWCCY	0	0	0	2	0	0	0	3	23

PshA I	GACNNNNGTC	0	0	0	1	1	0	0	7	2
PshB I	ATTAAT	1	3	3	1	2	0	7	17	3
Psp1406 I	AACGTT	2	2	3	4	3	0	2	7	3
Pst I	CTGCAG	1	1	1	1	1	3	1	28	30
Pvu I	CGATCG	1	2	2	1	0	2	1	3	7

Pvu II	CAGCTG	1	2	2	1	0	3	3	15	24
RleA I	CCCACA(12/9)	0	0	0	0	1	2	1	18	26
Sac I	GAGCTC	1	1	1	0	0	0	1	2	16
Sac II	CCGCGG	1	0	0	0	1	1	0	4	33
Sal I	GTCGAC	1	1	1	1	0	0	1	2	3

SanD I	GGGWCCC	0	0	0	0	0	0	0	1	8
Sap I	GCTCTTC(1/4)	0	1	1	1	1	1	0	10	7
Sau3A I	GATC	12	15	15	22	0	19	7	116	87
Sca I	AGTACT	1	1	1	1	0	1	0	5	5
ScrF I	CCNGG	13	12	12	16	3	32	11	184	233

Sec I	CCNNGG	8	5	5	8	6	8	9	105	234
SexA I	ACCWGGT	0	0	0	0	1	0	0	5	9
SfaN I	GCATC(5/9)	3	8	8	22	12	26	7	169	86
Sfe I	CTRYAG	3	4	5	4	6	7	7	38	47
Sfi I	GGCCNNNNNGGCC	0	0	0	0	0	0	0	0	3

Sgf I	GCGATCGC	0	0	0	0	0	1	0	0	1
SgrA I	CRCCGGYG	0	0	0	1	0	0	0	6	6
Sim I	GGGTC(-3/0)	2	3	4	8	6	5	4	40	73
Sma I	CCCGGG	1	1	1	0	0	1	1	3	12
Smi I	ATTTAAAT	0	0	0	0	0	0	1	0	1
Sml I	CTYRAG	4	4	4	6	5	8	5	17	29

SnaB I	TACGTA	0	0	0	0	0	1	1	1	0
Spe I	ACTAGT	2	0	0	0	0	0	0	0	3
Sph I	GCATGC	1	1	1	1	0	0	1	6	8
Spl I	CGTACG	1	0	0	0	2	2	0	1	4
Srf I	GCCCGGGC	0	0	0	0	0	1	0	0	1

Sse8387 I	CCTGCAGG	1	1	1	0	0	0	1	5	3
Sse8647 I	AGGWCCT	0	0	0	0	0	0	0	0	8
Ssp I	AATATT	1	1	2	1	1	3	6	20	5
Sss I	CG	147	173	210	329	267	361	329	3113	2428
Stu I	AGGCCT	1	0	0	0	1	2	0	6	11

StyLT I	CAGAG	7	6	6	8	3	17	19	129	77
StySJ I	GAGNNNNNNGTRC	0	1	1	1	0	0	0	6	12
Taq I	TCGA	11	4	5	7	10	9	12	121	50
Taq II	GACCGA(11/9)CACCCA(11/9)	2	5	6	6	2	4	4	28	36

Tat I	WGTACW	1	2	2	2	0	5	5	24	19
Tau I	GCSGC	9	7	9	21	17	11	7	181	232
Tfi I	GAWTC	2	2	2	6	11	9	19	87	32
Tse I	GCWGC	7	12	13	21	14	34	10	199	179
TspE I	AATT	6	7	10	8	25	21	64	189	87

TspR I	CAGTG(2/-7)	6	10	10	12	6	16	8	119	83
Tsp4C I	ACNGT	15	8	9	14	15	23	31	187	122
Tsp45 I	GTSAC	1	4	5	9	8	12	8	81	73
Tth111 I	GACNNNGTC	0	0	0	1	0	2	0	2	12
Tth111 II	CAARCA(11/9)	3	3	3	5	11	8	7	48	53

UbaD I	GAACNNNNNNTCC	0	0	1	0	0	1	1	7	4
UbaE I	CACCTGC	0	0	0	0	0	1	0	12	9
Van91 I	CCANNNNNTGG	2	0	0	2	2	0	0	14	18
VpaK11B I	GGWCC	1	2	2	8	1	4	1	35	73
Xba I	TCTAGA	1	1	1	0	0	0	1	1	5

Xcm I	CCANNNNNNNNNTGG	0	0	0	0	0	0	0	12	14
Xho I	CTCGAG	1	0	0	0	1	0	0	1	6
Xmn I	GAANNNNTTC	0	1	1	2	3	2	2	24	5
Xsp I	CTAG	5	4	5	5	3	4	5	14	54

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