シングルセル自動調製システム

SMARTer™ ICELL8® cx Single-Cell System

  • 5,184個のナノウェルを搭載したICELL8 Chipに細胞を分注し、1,200~1,500個程度のシングルセルを取得
  • 5~100 μmの幅広い細胞サイズに対応、様々なサイズの細胞集団を解析可能
  • イメージングによりシングルセルを自動判別し、ダブレットや空ウェル、死細胞を解析から排除
  • 最大8種類の細胞サンプルを1枚のICELL8 Chip上で一度に解析可能
  • 様々なシングルセルRNA-seqアプリケーションに対応
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製品コード TaKaRa
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CLN 640189 WF0174 SMARTer™ ICELL8® cx Single-Cell System
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CLN 640018 WF0017 MSND 384-well Source Plate and Seals
20個 ¥32,000

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ICELL8 Single - Cell System
4センチ四方の革新
SMARTer ICELL8 cx Single-Cell System
ナノディスペンシングによるシングルセル自動調製システム

SMARTer ICELL8 cx Single-Cell Systemでシングルセル解析が劇的に変化します。わずか4 cm×4 cmのICELL8 Chipに搭載された5,184個の各ウェルがナノサイズの反応チューブであり、マルチサンプル・ナノディスペンサー(MSND)によって精密な分注が行われます。専用のCellSelectソフトウェアが生きたシングルセルを含むウェルを自動選択するため、実験者間の偏りのない、シングルセルおよび生死判別が可能です。

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ICELL8 Chip
SmartChipテクノロジー

5,184個のナノウェルが搭載されたChip上に、数10ナノリットルの精密な分注(ナノディスペンシング)を行うことにより、ハイスループットかつ再現性の高い解析を可能にします。
細胞の分注はポアソン分布に従って行われ、1,200~1,500個程度のシングルセルを獲得することができます。また、1回の分注で8種類までのサンプルを分注できます。分注は15分程度で完了するため、細胞の生存率への影響を最小限に抑えることができます。

自動イメージング
自動イメージング

微小ウェルへの細胞分注後、各ウェルのイメージは15分以内に自動で取得されます。
得られた画像データから、専用のソフトウェアによる各ウェル内の細胞数の検出、生死の判定が自動的に行われます。
選択したウェルのみに対してqPCR反応試薬を分注可能なため、NGS解析コストを削減することができます。

サイズの異なる細胞集団を同時に解析
サイズの異なる細胞集団を同時に解析

ICELL8システムは細胞のサイズ制限を受けず、5~100 μmの細胞を均一に分注することが可能です。ICELL8システムを用いた混合細胞サンプルの遺伝子発現解析結果は、個々の細胞特有のプロファイルを示していました。

詳細は技術資料ご覧ください。
技術資料:ICELL8 Systemによる細胞混合サンプルの解析

SMARTer ICELL8システムを用いた解析フロー例(3' DE解析の場合)

SMARTer ICELL8システムを用いた解析フロー例(3’DE解析の場合)

様々なシングルセルRNA-seqアプリケーションに対応

以下のRNA-seqアプリケーションを可能にする専用試薬がご利用いただけます。SMART技術により超微量のRNAを高感度かつ再現性高く増幅し、より多くの遺伝子の検出が可能です。
Single cell 3' DE RNA-seq
SMARTer ICELL8 cxシステムで単離した単一細胞由来のmRNA転写産物の3' 端配列情報を網羅的に得ることで、遺伝子発現差解析(Differential gene Expression (DE) analysis)を行う。 専用試薬はこちら
Single cell Full-length RNA-seq
SMARTer ICELL8 cxシステムで単離した単一細胞由来のmRNA転写産物の全長配列情報を得ることで、全長トランスクリプトーム解析を行う。 Coming soon!
Single cell TCR profiling
SMARTer ICELL8 cxシステムで単離した単一ヒトT細胞のα鎖およびβ鎖のV(D)J可変領域のシーケンスとペアリング情報を取得する。 専用試薬はこちら
SMARTer NGS

使用実績のある細胞リスト

Cell line/type Species Source Cell line/type Species Source
307 Mouse Pancreas KU812 Human Blood, CML myeloblast
3T3 Mouse Fibroblast Lung epithelia Mouse Primary FACS-sorted cells
A-20 Mouse B-lymphocyte MCF7 Human Breast
A-375 Human Melanoma MDA-MB-231 Human Mammary gland
BaF/3 Mouse Pre-B cells MIA PaCa-2 Human Pancreas
Beta-TC-6 Mouse Pancreas Nasal epithelia Human Primary nasal scraping
Primary cells Mouse Bone marrow NCH421K Human Glioma/glioblastoma
Primary cells Mouse Cardiomyocyte (adult) Neurons Mouse Fresh dissection
CHO Hamster Ovary Nuclei Human Frozen lung tumor;
frozen breast cancer
ESC; Differentiated
ESC
Mouse Embryonic stem cells PBMCs Human Blood
Ear Mouse Inner ear organs Planaria SC Planarium Stem cells
Primary cells Mouse Embryos Retina Mouse Primary cells
FACS-sorted lymphocytes Human Bone marrow Scheider S2 Drosophila Embryo
Fetal cortex Human Primary cells SK-BR3 Human Breast
Fetal neurons Human Fetal brain Skin Zebrafish Skin
Gut cells Mosquito Gut Spheroids Human MCF10CA-derived
H2452 Human Lung U-87-MG Human Glioblastoma; astrocytoma
HCT 116 Human Colon UTHSC Human Bone marrow EW-8 Ewing
Sarcoma
HSPC Mouse Hematopoietic stem cells Z-138 Human B-cell lymphoma

SMARTer ICELL8システムを用いて、幅広い細胞サイズのサンプルをバイアスなく分離可能
SMARTer ICELL8システムで単離した細胞種の一例です。青色で示したサンプルは、SMARTer ICELL8システムが初めて単離に成功したシングルセル、核、スフェロイドです。

SMARTer ICELL8 cx Single-Cell Systemだからこそ可能なシングルセル解析

SMARTer ICELL8 cx Single-Cell Systemは5,184個の微小ウェルが搭載されたICELL8 Chipに数10ナノリットルの精密な分注を行うことで、1,200~1,500個程度のシングルセルを単離します。5~100 μmの幅広い細胞サイズに対応し、心筋細胞や植物細胞などの大きなサイズの細胞のシングルセル化も可能です。
自動イメージング機能により「生きたシングルセル」のみを選択して後の解析に用いるため、信頼性の高い結果を得ることができます。また解析に用いる細胞の選択条件を自在にコントロールすることもできるため、独自の解析系を構築するなど豊富なアプリケーションを実現します。

ユーザーによるレビュー:Sten Linnarsson教授(カロリンスカ研究所, スウェーデン)

システム紹介動画はこちら(YouTubeサイト)

2016年のAGBT(Advances in Genome Biology and Technology)で行われた、スウェーデン カロリンスカ研究所 (Karolinska Institutet)のSten Linnarsson教授の発表をご覧ください。
マウス脳を分子生物学的に解剖することを目的とした一連の研究において、組織サンプルのシングルセル解析は大きな役割を担っています。
「ICELL8システムでの細胞の単離は約2日間で終了する。これは以前は数ヵ月かかっていた。」とSten Linnarsson教授は語っています。


ご購入前に実装置をお試しいただけます
弊社研究所にてICELL8システムのデモンストレーションを行います。試薬・消耗品の費用のみでICELL8システムをお試しいただけます。標準サンプルを用いて、シングルセル解析のための1細胞の単離作業からソフトウェアを用いたシングルセルおよび生死の判別までを行い、cDNA合成フローを確認します。(シーケンス以降の作業は行いません)
ご興味がおありの方は弊社までご連絡ください。
タカラバイオ株式会社 営業企画部 ICELL8(アイセルエイト)担当 TEL 077-565-6972


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システム構成・内容

SMARTer ICELL8 cx Single-Cell System
仕様
サイズ(幅×奥行き×高さ)107 cm×56 cm×56 cm
重さ79.4 kg
電源AC100~240V, 50/60Hz, 3.6A(100V時)
  • SMARTer ICELL8 cxシステム本体
  • CellSelect Software
  • Chip Cycler

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