SmartChipテクノロジーによるシングルセル解析システム

SMARTer™ ICELL8® cx シングルセル解析システム

  • 5,184個のウェルに細胞を分注し、1,200~1,500個程度の細胞をシングルセル化
  • 5~100 μmの幅広い細胞サイズに対応。シングルセル化効率は細胞サイズに依存しない。
  • 専用ソフトウェアで確実なシングルセルのみを選択
  • 最大8種類の細胞サンプルを1枚のSmartChip上で一度に解析可能
  • 解析したいサンプルのみを選択できるため、シングルセル解析で問題となるNGS解析コストを抑えることが可能
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製品コード TaKaRa
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CLN 640189 WF0174 SMARTer™ ICELL8® cx Single-Cell System
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一式 デモ受付中
CLN 640142 WF0094 SMARTer® ICELL8® Chip and Reagent Kit v2
1 Kit 終売 終売日:2018/07
代替品
コンポーネント
640143
640005
640048
640109
CLN 640146 WF0004 SMARTer™ ICELL8® Blank Chip Kit
1 Kit 終売 終売日:2018/07
代替品
コンポーネント
640013
640048
640109
CLN 640018 WF0017 MSND 384-well Source Plate and Seals
20個 ¥32,000

★価格はお問い合わせください

ICELL8 Single - Cell System
4センチ四方の革新
SMARTer ICELL8 cx Single-Cell System SmartChipテクノロジーによるシングルセル自動解析システム

SMARTer ICELL8 cx Single-Cell Systemでシングルセル解析が劇的に変化します。わずか4 cm×4 cmのSmartChipに搭載された5,184個の各ウェルがナノサイズの反応チューブであり、マルチサンプル・ナノディスペンサー(MSND)によって精密な分注が行われます。専用のCellSelectソフトウェアが生きたシングルセルを含むウェルを自動選択するため、実験者間の偏りのない、シングルセルおよび生死判別が可能です。

パンフレットをダウンロード
SmartChipテクノロジー
SmartChipテクノロジー

5,184個の微小ウェル(100 nl/well)が搭載されたChip上に、数10ナノリットルの精密な分注(ナノディスペンシング)を行うことにより、ハイスループットかつ再現性の高い解析を可能にする技術です。
細胞の分注はポアソン分布に従って行われ、1,200~1,500個程度のシングルセルを獲得することができます。また、1回の分注で8種類までのサンプルを分注できます。分注は15分程度で完了するため、細胞の生存率への影響を最小限に抑えることができます。

自動イメージング
自動イメージング

微小ウェルへの細胞分注後、各ウェルのイメージは15分以内に自動で取得されます。
得られた画像データから、専用のソフトウェアによる各ウェル内の細胞数の検出、生死の判定が自動的に行われます。
選択したウェルのみに対してqPCR反応試薬を分注可能なため、NGS解析コストを削減することができます。

サイズの異なる細胞集団を同時に解析
サイズの異なる細胞集団を同時に解析

ICELL8システムは細胞のサイズ制限を受けず、5~100 μmの細胞を均一に分注することが可能です。ICELL8システムを用いた混合細胞サンプルの遺伝子発現解析結果は、個々の細胞特有のプロファイルを示していました。

詳細は技術資料ご覧ください。
技術資料:ICELL8 Systemによる細胞混合サンプルの解析

全長トランスクリプトーム解析例

SMART-Seq技術の圧倒的な感度
SMART-Seq技術の圧倒的な感度とSMARTer ICELL8システムを組み合わせることで、大量のシングルセルから高品質なscRNA-seqデータを生成します。本システムを用いて調製されたライブラリーは、シーケンスdepthが低い場合においても多数の転写物および遺伝子を検出します。さらに、ダウンサンプリングした場合でも、ライブラリーの複雑さを維持します。(全長RNA-seq専用キットは2018年5月以降発売予定)

使用実績のある細胞リスト

Cell line/type Species Source Cell line/type Species Source
307 Mouse Pancreas KU812 Human Blood, CML myeloblast
3T3 Mouse Fibroblast Lung epithelia Mouse Primary FACS-sorted cells
A-20 Mouse B-lymphocyte MCF7 Human Breast
A-375 Human Melanoma MDA-MB-231 Human Mammary gland
BaF/3 Mouse Pre-B cells MIA PaCa-2 Human Pancreas
Beta-TC-6 Mouse Pancreas Nasal epithelia Human Primary nasal scraping
Primary cells Mouse Bone marrow NCH421K Human Glioma/glioblastoma
Primary cells Mouse Cardiomyocyte (adult) Neurons Mouse Fresh dissection
CHO Hamster Ovary Nuclei Human Frozen lung tumor;
frozen breast cancer
ESC; Differentiated
ESC
Mouse Embryonic stem cells PBMCs Human Blood
Ear Mouse Inner ear organs Planaria SC Planarium Stem cells
Primary cells Mouse Embryos Retina Mouse Primary cells
FACS-sorted lymphocytes Human Bone marrow Scheider S2 Drosophila Embryo
Fetal cortex Human Primary cells SK-BR3 Human Breast
Fetal neurons Human Fetal brain Skin Zebrafish Skin
Gut cells Mosquito Gut Spheroids Human MCF10CA-derived
H2452 Human Lung U-87-MG Human Glioblastoma; astrocytoma
HCT 116 Human Colon UTHSC Human Bone marrow EW-8 Ewing
Sarcoma
HSPC Mouse Hematopoietic stem cells Z-138 Human B-cell lymphoma

SMARTer ICELL8システムの大口径ノズルで、幅広い細胞サイズのサンプルをバイアスなく分離可能
SMARTer ICELL8システムで単離した細胞種の一例です。青色で示したサンプルは、SMARTer ICELL8システムが初めて単離に成功したシングルセル、核、スフェロイドです。

MultiSample NanoDispencer(MSND)によるナノディスペンシング

システム紹介動画はこちら(YouTubeサイト)

5,184個の微小ウェルが搭載されたSmartChip上に、数10ナノリットルの精密な分注(ナノディスペンシング)を行います。
分注は15分程度で終了するため、細胞への影響を最小限に抑えることができます。

ユーザーによるレビュー:Sten Linnarsson教授(カロリンスカ研究所, スウェーデン)

システム紹介動画はこちら(YouTubeサイト)

2016年のAGBT(Advances in Genome Biology and Technology)で行われた、スウェーデン カロリンスカ研究所 (Karolinska Institutet)のSten Linnarsson教授の発表をご覧ください。
マウス脳を分子生物学的に解剖することを目的とした一連の研究において、組織サンプルのシングルセル解析は大きな役割を担っています。
「ICELL8システムでの細胞の単離は約2日間で終了する。これは以前は数ヵ月かかっていた。」とSten Linnarsson教授は語っています。


ご購入前に実装置をお試しいただけます
弊社研究所にてICELL8システムのデモンストレーションを行います。試薬・消耗品の費用のみでICELL8システムをお試しいただけます。標準サンプルを用いて、シングルセル解析のための1細胞の単離作業からソフトウェアを用いたシングルセルおよび生死の判別までを行い、cDNA合成フローを確認します。(シーケンス以降の作業は行いません)
ご興味がおありの方は弊社までご連絡ください。
タカラバイオ株式会社 営業企画部 ICELL8(アイセルエイト)担当 TEL 077-565-6972


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システム構成・内容

SMARTer ICELL8 cx Single-Cell System
仕様
サイズ(幅×奥行き×高さ)107 cm×56 cm×56 cm
重さ79.4 kg
電源AC100~240V, 50/60Hz, 3.6A(100V時)
  • SMARTer ICELL8 cxシステム本体
  • CellSelect Software
  • Chip Cycler
SMARTer ICELL8 Chip and Reagent Kit v2(製品コード 640142)

対応機種:HiSeq 2500、NextSeq、MiSeq、HiSeq 4000
・SMARTer ICELL8 Chip v2
・Collection Kit
・SMARTer ICELL8 Chip Loading Kit
・SMARTer ICELL8 Reagent Kit

SMARTer ICELL8 Blank Chip Kit(製品コード 640146)

ウェルに識別バーコード配列が付加されていない、細胞分注テスト用チップ
・SMARTer ICELL8 Blank Chip
・Collection Kit
・SMARTer ICELL8 Chip Loading Kit

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注意事項
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