赤痢菌および腸管侵入性大腸菌(EIEC)検出用 Primer Set
赤痢菌および腸管侵入性大腸菌
病原因子遺伝子の検出
赤痢菌および腸管侵入性大腸菌のinvE遺伝子およびipaH遺伝子の各陽性株を用いた実験例を示す。
反応液組成
専用10×PCR Buffer*1 |
5 μl |
dNTP Mixture(各2.5 mM)*2 |
4 μl |
Primer-1 |
0.5 μl |
Primer-2 |
0.5 μl |
Template DNA*3 |
5 μl |
TaKaRa Taq(5 U/μl)*4 |
0.25 μl |
滅菌水 |
34.75 μl |
Total |
50 μl |
反応液は氷冷下で調製する。
*1 特殊細菌検出用Primer Set(製品コード S001~S028)に添付している。
*2TaKaRa Taq(製品コード R001A)に添付している。
*3 精製DNAまたは熱抽出サンプルを使用。なお、熱抽出サンプルは、菌体をLB培地中で37℃、一晩培養した培養液10
μlにTE Buffer(10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA、pH8.0)または滅菌水を90 μl加え、95℃、5分間加熱後、卓上遠心機で菌体の残渣を除いた上清液を用いる。
*4 TaKaRa Taq(製品コード R001A)のほか、
TaKaRa Taq Hot Start Version(製品コード R007A)も使用できる。
PCR条件
熱変性 |
94℃、1 min |
35 cycles |
アニーリング |
55℃、1 min |
伸長 |
72℃、1 min |
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テンプレートDNA |
使用プライマー |
Lane 1: |
赤痢菌invE遺伝子陽性株 |
INV-1 & 2 |
2: |
赤痢菌invE遺伝子陰性株 |
3: |
赤痢菌ipaH遺伝子陽性株 |
IPA-1 & 2 |
4: |
赤痢菌ipaH遺伝子陰性株 |
M: |
pHY Marker |
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図1 赤痢菌および腸管侵入性大腸菌病原因子遺伝子の検出3%アガロースゲル(エチジウムブロマイド0.5
μg/mlを含む)による電気泳動の結果
赤痢菌および腸管侵入性大腸菌(EIEC)検出用 Primer Set