ウェルシュ菌検出用 Primer Set CPE-1 & 2
ウェルシュ菌毒素遺伝子の検出
種々のClostridium属の菌の熱抽出サンプルを鋳型にPCRを行った結果を示す。
反応液組成
専用10×PCR Buffer*1 | 5 μl |
dNTP Mixture(各2.5 mM)*2 | 4 μl |
Primer-1 | 0.5 μl |
Primer-2 | 0.5 μl |
Template DNA*3 | 5 μl |
TaKaRa Taq(5 U/μl)*4 | 0.25 μl |
滅菌水 | 34.75 μl |
Total | 50 μl |
*1 特殊細菌検出用Primer Set(製品コード S001~S028)に添付している。
*2 TaKaRa Taq(製品コード R001A)に添付している。
*3 精製DNAまたは熱抽出サンプルを使用。なお、熱抽出サンプルは、菌体をGAMブイヨン培地中で37℃、一晩培養した培養液10 μlにTE Buffer(10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA、pH8.0)または滅菌水を90 μl加え、95℃、5分間加熱後、遠心機で菌体の残渣を除いた上清液を用いる。
*4 TaKaRa Taq(製品コード R001A)のほか、
TaKaRa Taq Hot Start Version(製品コード R007A)も使用できる。
PCR条件
熱変性 | 94℃、1 min | 35 cycles |
アニーリング | 55℃、1 min |
伸長 | 72℃、1 min |
結果
図1 ウェルシュ菌毒素遺伝子の検出
3%アガロースゲル(エチジウムブロマイド0.5 μg/mlを含む)による電気泳動の結果
Lane M: | φX174-Hinc II digest |
1~7: | ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)毒素陽性株 |
8~9: | ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)毒素陰性株 |
10: | Clostridium difficile |
11: | Clostridium sporogenes
|
12: | Clostridium barati
|
13: | Negative control |
ウェルシュ菌検出用 Primer Set CPE-1 & 2