BcaBEST® RNA PCR Kit Ver. 1.1

複雑な二次構造をもつターゲットの増幅

■ 方法

ターゲット:IGFR II遺伝子516 bp(GC含量63.5%)
サンプル:ヒト骨格筋由来全RNA 5 μg/RT液20 μl

逆転写反応液の調製
試薬使用量
2×Bca1st Buffer10 μl
MgSO4(25 mM)4 μl
dNTP Mixture(10 mM)1 μl
RNase Inhibitor0.5 μl
BcaBEST Polymerase1 μl
Oligo dT Primer1 μl
サンプルRNA1 μl
RNase Free dH2O1.5 μl
Total20 μl
逆転写反応条件
65℃1 min1 cycle
30℃5 min
↓ 15 min
65℃15 min
98℃5 min
5℃5 min
PCR反応
A法(通常の方法)
試薬使用量
MgSO4(25 mM)6 μl
5×Bca 2nd Buffer16 μl
Bca-Optimized Taq0.5 μl
上流プライマー1 μl
下流プライマー1 μl
滅菌精製水55.5 μl
Total80 μl
B法
試薬使用量
MgSO4(25 mM)6 μl
2×Bca1st Buffer16 μl
Bca-Optimized Taq0.5 μl
上流プライマー1 μl
下流プライマー1 μl
滅菌精製水31.5 μl
Total80 μl

上記の反応液(80 μl)を逆転写反応終了液(20μl)に別々に加え、以下の条件でPCRを行った。

PCR反応条件
94℃1 min 
94℃30 sec40 cycles
60℃30 sec
72℃1 min
72℃5 min 

■ 結果

A法(通常の方法)では増幅産物が得られなかったが、B法では増幅産物が得られた。
電気泳動像
レーン
M:100 bp DNA Ladder
1:BcaBEST RNA PCR Kit Ver. 1.1 A法
2:BcaBEST RNA PCR Kit Ver. 1.1 B法
3:TaKaRa RNA PCR Kit(AMV)Ver. 2.1
4:TaKaRa RNA LA PCR Kit(AMV)Ver. 1.1
3% アガロースゲル

  BcaBEST® RNA PCR Kit Ver. 1.1