TaKaRa LA PCR™ Kit Ver.2.1
GC richな繰り返し配列の増幅
―ハンチントン病遺伝子の増幅―
TaKaRa LA TaqとGC Bufferおよび従来のLA PCR Bufferをそれぞれ組み合わせたものと、B社製GC Kitを用いて、ハンチントン病遺伝子(HD遺伝子IT15 CAGリピート;サイズ262 bp/GC含量73%、358 bp/GC含量71.5%)を増幅、比較検討した。その結果、従来のLA PCR BufferやB社製GC Kitを用いたものでは、いずれのバンドも検出できなかったが、GC Bufferを用いたTaKaRa LA Taqでは、2本のバンドがはっきり検出できた。
■ PCR反応条件
TaKaRa LA Taqの場合
| 94℃、1 min | |
| ↓ |
| 94℃、30 sec | 30 cycles |
| 60℃、30 sec |
| 72℃、1 min |
| ↓ | |
| 72℃、5 min |
B社製GC Kit(マニュアルに従った)
| 94℃、1 min | |
| ↓ |
| 94℃、30 sec | 30 cycles |
| 68℃、3 min |
| ↓ | |
| 68℃、3 min |
■ 結果
| レーン |
酵素 |
バッファー |
template量 |
| 1: |
TaKaRa LA Taq |
10×LA PCR Buffer |
100 ng |
| 2: |
2×GC Buffer I |
100 ng |
| 3: |
2×GC Buffer II |
100 ng |
| 4: |
B社製GC Kit |
同キット添付バッファー |
100 ng |
| M: |
100 bp DNA Ladder Marker |
Thermal Cycler:TaKaRa PCR Thermal Cycler MP
ゲル:3% NuSieve 3:1 Agarose gel
アプライ量:8 μl/50 μl
TaKaRa LA PCR™ Kit Ver.2.1