PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase
PrimeSTAR® GXL DNA Polymeraseの標準プロトコール
● 反応液組成
| 使用量 |
| 最終濃度 |
5×PrimeSTAR GXL Buffer | 10 μl | 1× |
dNTP Mixture (2.5 mM each) | 4 μl | 200 μM each |
primer 1 | 10~15 pmol | 0.2~0.3 μM* |
primer 2 | 10~15 pmol | 0.2~0.3 μM* |
Template | 下記参照 | |
PrimeSTAR GXL DNA Polymerase | 1 μl | 1.25 U/50 μl |
滅菌精製水 | up to 50 μl |
|
|
* 10 kb以上の長鎖を増幅する場合、final conc. 0.2 μMで反応してください。
【推奨鋳型量】
| | (長鎖増幅の場合) |
ヒトゲノムDNA | 5~500 ng | (100~500 ng) |
大腸菌ゲノムDNA | 100 pg~200 ng | (10~200 ng) |
プラスミドDNA | 10 pg~10 ng | (1~10 ng) |
cDNA | 25~750 ng | (250~750 ng) |
● PCR条件
- 【増幅鎖長が≦10 kbの場合】
-
98℃ | 10 sec. |
|
30 cycles |
55℃ or 60℃*1 | 15 sec. |
68℃*2 | 1min. / kb |
または
98℃ | 10 sec. | |
30 cycles |
68℃ | 1 min./kb |
*1 Tm値(下記の式※で計算)が55℃を超える場合はアニーリング温度を60℃に、Tm値が55℃以下の場合はアニーリング温度を55℃に設定してください。
※ Tm値(℃)=[(A、Tの数)×2]+[(G、Cの数)×4]-5
*2 3 step PCRの場合も、伸長温度は68℃に設定してください。
- 【増幅鎖長が10 kb~30 kbの場合】
-
98℃ | 10 sec. | |
30 cycles |
68℃ | 10 min. |
- 【増幅鎖長が>30 kbの場合】
-
98℃ | 10 sec. | |
30 cycles |
68℃ | 15 min. |
- ◆ PCR条件の選択
- ・増幅鎖長が10 kb以下の場合はまず3 step PCRをお試しください。スメアや非特異的増幅が見られる場合はアニーリング温度を上げるか、2 step PCRをお試しください。
- ・GCリッチな鋳型や10 kb以上の長鎖の増幅には、2 step PCRを推奨します。
PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase