PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase
PrimeSTAR® GXL DNA Polymeraseの高速PCRプロトコール
● 反応液組成
| 使用量 |
| 最終濃度 |
5×PrimeSTAR GXL Buffer | 10 μl | 1× |
dNTP Mixture (2.5 mM each) | 4 μl | 各200 μM |
primer 1 | 10~15 pmol | 0.2~0.3 μM* |
primer 2 | 10~15 pmol | 0.2~0.3 μM* |
Template | 下記参照 |
|
PrimeSTAR GXL DNA Polymerase | 2μl | 2.5 U / 50μl |
滅菌精製水 | up to 50μl |
|
* 10 kb以上の長鎖を増幅する場合、final conc. 0.2 μMで反応してください。
【推奨鋳型量】
| | (長鎖増幅の場合) |
ヒトゲノムDNA | 5~500 ng | (100~500 ng) |
大腸菌ゲノムDNA | 100 pg~200 ng | (10~200 ng) |
プラスミドDNA | 10 pg~10 ng | (1~10 ng) |
cDNA | 25~750 ng | (250~750 ng) |
● PCR条件
- 【増幅鎖長が≦10 kbの場合】
-
98℃ | 10 sec. | |
30 cycles |
55℃ or 60℃*1 | 15 sec. |
68℃*2 | 10 sec./kb |
*1 Tm値(下記の式※で計算)が55℃を超える場合はアニーリング温度を60℃に、Tm値が55℃以下の場合はアニーリング温度を55℃に設定してください。
※ Tm値(℃)=[(A、Tの数)×2]+[(G、Cの数)×4]-5
*2 3 step PCRの場合も、伸長温度は68℃に設定してください。
- 【増幅鎖長が10 kb~20 kbの場合】
-
98℃ | 10 sec. | |
30 cycles |
68℃ | 20 sec./kb |
または
98℃ | 10 sec. | |
30 cycles |
60℃ | 15 sec. |
68℃ | 10 sec./kb |
- ◆PCR条件の選択
- 10 kb以下の増幅は、3 step PCRで行ってください。2 step PCRでの反応はお勧めしません。
- 10 kbを超える増幅においては、より短時間での反応を求める場合は3 step PCR、より特異性の高い反応を求める場合には2 step PCRをお勧めします。
- GCリッチな鋳型については、標準プロトコールをお勧めします。
PrimeSTAR® GXL DNA Polymerase