Q1 Random Primer DNA Labeling Kitを用いてラベルすることのできるDNAの長さは?
A1 ニックトランスレーション法の場合でも同じですが、最低300 bpの長さが望まれます。それ以下のDNAでは短いフラグメントが多くなり、プローブとして安心して使用できません。150 bp以下であれば、MEGALABELを用いた末端標識をお勧めします。
Q2 Random Primer DNA Labeling Kit Ver. 2で使用するKlenow Fragmentは市販の製品で代用できるか?
A2 Kitで使っている酵素は3'→5'exonuclease free Klenow Fragmentですので市販のKlenow Fragmentでは代用できません。
Q3 Random Primer DNA Labeling Kitは、Ver. 2になって反応時間が10分に短縮されたが、反応時間をのばしても問題ないか?
A3 かまいません。オーバーナイト反応においても取り込み率の低下はごくわずかです。
Q4 Random Primer DNA Labeling Kitを用いて標識したDNAの取り込み率の測定にTCA沈殿法を用いたら、取り込み率が悪かった。
A4 TCA沈殿法は操作が煩雑で、誤差も大きく、ラベルされたDNA(短いDNA等)が完全にトラップされないことがあります。プロトコール通り、DE81 paperを用いた方法で取り込み率を測定してください。