プレート単位塩基配列解析

A1　 提供サンプルがPCR産物の場合にはサンプル濃度が解析結果に大きく影響し、サンプルの濃度不足により解析不良となる場合があります。本解析サービスではプレート単位で解析作業を行い、プレート内の平均的な濃度やサイズに合わせて解析作業を行います。よって、プレート内でのサンプル濃度のばらつきが解析結果に大きく影響する場合があります。

A2　 提供サンプル（送付サンプル）は解析終了から約3ヵ月保管した後、廃棄させていただきます。サンプルの返却を希望される場合は、オンライン注文のコメント欄にご記入いただくことで、納品時に返送が可能です。

A3　 サンプルプレートは1枚で結構です。プレート単位の分注は弊社で行います。ウェルごとや列ごとの分注や入れ替えはできません。

A4　 可能です。鋳型サンプルの並びに対応したプライマー分注済96ウェルプレート（プライマープレート）をご用意ください。プライマープレートは濃度：5 pmol/μl、量：10 μl以上でご用意ください。 この場合は解析料金内で解析いたします。なお、ご提供プライマープレートによる解析の場合、弊社納品基準を満たさない場合もありますのであらかじめご了承ください。
プライマーならびにサンプル鋳型の並べ替えは弊社では対応できません。ご了承ください。
1プレート内で数種類のプライマーを使用して解析する場合にはサンプル名とプライマーの対応を指示いただく必要がございます。プレート単位塩基配列解析のオンライン注文方法をご参照ください。

A5　 ユニバーサルプライマー一覧をご確認ください。本受託解析では、ユニバーサルプライマーを一般的なベクターマップ上にシーケンスプライマーとして標記しているものとしています。 このようなシーケンスプライマーでユニバーサルプライマー一覧に無いものにつきましてはベクターマップとプライマー配列をご提示ください。弊社でご用意いたします。
ユニバーサルプライマー以外のプライマーはカスタムプライマーと呼んでいます。カスタムプライマーのプライマー設計・合成も承っております。シーケンス解析と合わせてお申し付けください。

表1. プライマー設計・合成価格表

A6　 プライマープレートは1枚で結構です。プレート単位の分注は弊社で行います。ウェルごとや列ごとの入れ替えや分注はできません。

A7　 解析終了後、ご指定の販売店（代理店）から請求させていただきます。

A8　 オンライン注文のコメント欄にご記入の上、着払いで送付してください。解析料金に乗せて実費をご請求いたします。

A9 F/Rをつなげるような簡単なものでしたら￥30,000／注文です。ご要望内容によってはさらに追加料金がかかります。アセンブル結果はテキストデータやFASTAデータでお返しいたします。

A10　 96ウェルプレートは市販のものであればメーカー指定などはございません。底が平たい96ウェルプレートでは溶液が壁面に偏り、正確にサンプルを取ることができない恐れがありますので、容量を多く送付いただくかV底やU底のもので送付してください。
8連チューブではなく、96ウェルプレートで送付ください。

A11　 波形データを閲覧するには波形閲覧ソフトが必要となります。
インターネットから無償でダウンロードできるものをご案内いたします。

～ Sequence Scanner ソフトウェア ～
このソフトは波形の生データとベースコールデータの閲覧ができます。無償でダウンロード可能です。
Sequence Scanner ソフトウェア ver2.0 ダウンロード先

A12　 約600 bp程度解析できます。立ち上がりの30 bp程度は精度が低いですが、600 bpの最後まで精度よく解析できます。
オプションのロングリードシーケンスのお申し込みで800 bp～1,000 bp程度の解析が可能です。この場合には800 bp以上は精度が徐々に低下します。読み取り長はサンプルの状態や種類、配列（GCリッチ、ATリッチ、高次構造、polyなど）によっては短くなったり、精度が保てないこともあります。 納品結果例をご確認ください。

A13　 インターネットを介して解析データをダウンロードしていただく納品方法です。 WEB納品には弊社WEB会員になっていただく必要があります。依頼時にWEB会員ID（ユーザーID）をお知らせいただくと、納品時にダウンロードアドレスが登録のメールアドレスへ送信されます。ダウンロードアドレスから入っていただき、WEB会員ID（ユーザーID）とパスワードで納品物をダウンロードしていただけます。
WEB納品に関してこちらをご覧ください。

A14　 同じです。

A15　 WEB会員新規登録・変更画面の「すでにWEB会員にご登録いただいている方へ」下部の「ID、パスワードをお忘れの方はこちら」をクリックし、メールアドレスをご記入ください。ご記入いただいたメールアドレスへ会員IDとパスワードをお知らせいたします。

A16　 オンライン注文のコメント欄に送付先のメールアドレスを全てご記入ください。ご依頼の度にご記入いただく必要があります。なお、WEB会員登録されているメールアドレスは必ずご記入ください。

A17　 一例として下記のような表記があります。
The sequencing of the 「サンプルなどの名前」 was performed by TAKARA BIO INC.(Kusatsu, Japan).

また、使用機器・試薬は、下記を使用しています。
・使用シーケンサー
　　　Applied Biosystems 3730xl DNA Analyzer
・シーケンス反応
　　　BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit
・シーケンス精製
　　　Sephadex G-50 Fine(Cytiva)

A18　 金額、納期、お客様のサンプル調製手間、納品物などに違いがあります。
「塩基配列解析受託サービス比較」をご確認ください。