Thermal Cycler Dice® Real Time Systemを用いる場合の操作方法
TB Green™ Premix Ex Taq™ (Tli RNaseH Plus）（製品コード RR420A/B）
- 下記に示す PCR反応液を調製する。
＜1反応あたり＞試薬 使用量 最終濃度 TB Green Premix Ex Taq（2×） 12.5 μl 1× PCR Forward Primer（10 μM） 0.5 μl 0.2 μM *1 PCR Reverse Primer（10 μM） 0.5 μl 0.2 μM *1 template（＜100 ng）*2 2 μl 滅菌精製水 9.5 μl total 25 μl *3 *1 最終primer濃度は0.2 μMで良い結果が得られる場合が多いが、反応性に問題があるときは0.1～1.0 μMの範囲で最適な濃度を検討すると良い。
*2 template溶液中に存在するターゲットのコピー数により異なる。段階希釈して適当な添加量を検討する。DNA template 100 ng以下を用いることが望ましい。また、RT-PCRでcDNA（RT反応液） をtemplateとして添加する場合は、添加量をPCR反応液容量の10％以下とする。
*3 反応液量は25 μlを推奨。
- 反応を開始する。
PCR反応は、下記のシャトルPCR標準プロトコールで行うことをお勧めします。
まずはこのプロトコールを試し、必要に応じてPCR条件を至適化してください。
Tm値が低めのプライマーなど、シャトルPCRでの反応が難しい場合には、3ステップPCRを行います。
シャトルPCR標準プロトコール
Holding（初期設定） Cycle：1 95℃、30秒 2 Step PCR*4 Cycles：40 95℃、5秒 60℃、30秒 Dissociation
*4 PCR条件を至適化する場合は、「実験条件の選び方」をご確認ください。
※使用上の注意
本製品に使用しているTaKaRa Ex Taq HSはポリメラーゼ活性を抑制する抗Taq抗体を利用したホットスタートPCR用酵素です。他社の化学修飾タイプのホットスタートPCR酵素で必要なPCR反応前の95℃（5～）15分の活性化ステップは行わないでください。必要以上の熱処理を加えると酵素活性が低下し、増幅効率、定量精度に影響を及ぼす傾向があります。
PCR反応前に鋳型の初期変性を行う場合でも、通常95℃ 30秒で充分です。
Thermal Cycler Dice Real Time Systemでの解析方法は、Thermal Cycler Dice Real Time System取扱説明書を参照してください。
