TB Green® Premix Ex Taq™ (Tli RNaseH Plus)
Smart Cycler® II Systemを用いる場合の操作方法
- 下記に示す PCR反応液を調製する。
<1反応あたり>
試薬 | 使用量 | 最終濃度 |
TB Green Premix Ex Taq(2×) | 12.5 μl | 1× |
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PCR Forward Primer(10 μM) | 0.5 μl | 0.2 μM | *1 |
PCR Reverse Primer(10 μM) | 0.5 μl | 0.2 μM | *1 |
template(<100 ng)*2 | 2 μl |
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滅菌精製水 | 9.5 μl |
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total | 25 μl |
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*1 | 最終primer濃度は0.2 μMで良い結果が得られる場合が多いが、反応性に問題があるときは0.1~1.0 μMの範囲で最適な濃度を検討すると良い。 |
*2 | template溶液中に存在するターゲットのコピー数により異なる。段階希釈して適当な添加量を検討する。DNA template 100 ng以下を用いることが望ましい。また、RT-PCRでcDNA(RT反応液)をtemplateとして添加する場合は、添加量をPCR反応液容量の10%以下とする。 |
- 反応チューブをSmart Cycler用遠心機で軽く遠心後、Smart Cyclerにセットし、反応を開始する。
PCR反応は、下記のシャトルPCR標準プロトコールで行うことをお勧めします。
まずはこのプロトコールを試し、必要に応じてPCR条件を至適化してください。
Tm値が低めのプライマーなど、シャトルPCRでの反応が難しい場合には、3ステップPCRを行います。(PCR条件を至適化する場合は、「
実験条件の選び方」をご参照ください。)
シャトルPCR標準プロトコール
Stage 1:初期変性 |
Hold |
95℃、30秒 |
Stage 2:PCR反応 |
Repeats:40 times |
95℃、5秒 |
60℃、20秒 |
Stage 3:Melt Curve |
※使用上の注意
本製品に使用しているTaKaRa Ex Taq HSはポリメラーゼ活性を抑制する抗Taq抗体を利用したホットスタートPCR用酵素です。他社の化学修飾タイプのホットスタートPCR酵素で必要なPCR反応前の95℃(5~)15分の活性化ステップは行わないでください。必要以上の熱処理を加えると酵素活性が低下し、増幅効率、定量精度に影響を及ぼす傾向があります。
PCR反応前に鋳型の初期変性を行う場合でも、通常95℃ 30秒で充分です。
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- 反応終了後、増幅曲線と融解曲線を確認し、定量を行う場合は検量線を作成する。
Smart Cycler Systemでの解析方法は、Smart Cycler System取扱説明書を参照してください。
TB Green® Premix Ex Taq™ (Tli RNaseH Plus)