TB Green® Premix Ex Taq™ (Tli RNaseH Plus)
Applied Biosystems 7900HT/7300/7500/7500 Fast Real-Time PCR System およびStepOnePlus™ Real-Time PCR System を用いる場合の操作方法
※各機種の取扱説明書に従って操作してください。
- 下記に示す PCR反応液を調製する。
<1反応あたり>
試薬 | 使用量 | 使用量 | 最終濃度 |
TB Green Premix Ex Taq(2×) | 10 μl |
| 25 μl |
| 1× |
|
PCR Forward Primer(10 μM) | 0.4 μl |
| 1 μl |
| 0.2 μM | *1 |
PCR Reverse Primer(10 μM) | 0.4 μl |
| 1 μl |
| 0.2 μM | *1 |
ROX Reference Dye(50×)or Dye II(50×)*2 | 0.4 μl |
| 1 μl |
| 1× |
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template(<100 ng)*3 | 2 μl |
| 4 μl |
|
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滅菌精製水 | 6.8 μl |
| 18 μl |
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total | 20 μl | *4 | 50 μl | *4 |
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*1 | 最終primer濃度は0.2 μMで良い結果が得られる場合が多いが、反応性に問題があるときは0.1~1.0 μMの範囲で最適な濃度を検討すると良い。 |
*2 | ROX Reference Dye II(50×)は、ROX Reference Dye(50×)より濃度が低く設定されている。Applied Biosystems 7500 Real-Time PCR Systemおよび7500 Fast Real-Time PCR Systemで解析する場合には、ROX Reference Dye II(50×)を使用する。 StepOnePlusおよび7900HT/7300 Real-Time PCR Systemには、ROX Reference Dye(50×)を使用する。 |
*3 | template溶液中に存在するターゲットのコピー数により異なる。段階希釈して適当な添加量を検討する。20 μlあたりDNA template 100 ng以下を用いることが望ましい。また、RT-PCRでcDNA(RT反応液)をtemplateとして添加する場合は、添加量をPCR反応液容量の10%以下とする。 |
*4 | 各装置の推奨容量に従って調製する。 |
- 反応を開始する。
PCR反応は、下記のシャトルPCR標準プロトコールで行うことをお勧めします。
まずはこのプロトコールを試し、必要に応じてPCR条件を至適化してください。
Tm値が低めのプライマーなど、シャトルPCRでの反応が難しい場合には、3ステップPCRを行います。(PCR条件を至適化する場合は、「
実験条件の選び方」をご参照ください。)
<Applied Biosystems 7900HT/7300/7500 Real-Time PCR System、StepOnePlus>
Stage 1:初期変性 |
Reps:1 |
95℃、30秒 |
Stage 2:PCR反応 |
Reps:40 |
95℃、5秒 |
60℃、30秒~34秒* |
Dissociation Stage |
* | 7900HTおよびStepOnePlusでは30秒に、7300では31秒に、7500では34秒に設定する。 |
<Applied Biosystems 7500 Fast Real-Time PCR System>
シャトルPCR標準プロトコール |
Holding Stage |
Reps:1 |
95℃、30秒 |
Cycling Stage |
Number of Cycles:40 |
95℃、3秒 |
60℃、30秒 |
Melt Curve Stage |
※使用上の注意
本製品に使用しているTaKaRa Ex Taq HSはポリメラーゼ活性を抑制する抗Taq抗体を利用したホットスタートPCR用酵素です。他社の化学修飾タイプのホットスタートPCR酵素で必要なPCR反応前の95℃(5~)15分の活性化ステップは行わないでください。必要以上の熱処理を加えると酵素活性が低下し、増幅効率、定量精度に影響を及ぼす傾向があります。
PCR反応前に鋳型の初期変性を行う場合でも、通常95℃ 30秒で充分です。
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- 反応終了後、増幅曲線と融解曲線を確認し、定量を行う場合は検量線を作成する。
解析方法は、リアルタイムPCR装置の取扱説明書を参照してください。
TB Green® Premix Ex Taq™ (Tli RNaseH Plus)