ThruPLEX®／PicoPLEX® Kit 共通Q＆A
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Q1 ThruPLEX／PicoPLEX Kitの保存温度は？
A1
－20℃で保存してください。
Q2 ThruPLEX／PicoPLEX Kitの有効期限は？
A2
適切な保存条件下で、ラベルに記載の使用期限まで使用可能です。
Q3 増幅反応に高フィデリティー酵素が使用されているか？
A3
はい。ThruPLEX／PicoPLEX Kitには正確性、増幅効率が高く、バイアスの少ないDNAポリメラーゼが使用されています。
Q4 ThruPLEX／PicoPLEX Kitはどんなサーマルサイクラーが使用できるか？
A4
ThruPLEX Kitの場合はヒートリッドを備え、100 µl反応容量に対応可能なサーマルサイクラーを使用する必要があります。ヒートリッド温度は101～105℃、推奨ランプレートは3～5℃/秒です。
PicoPLEX Kitの場合はヒートリッド温度は100～105℃、50 µlの反応液量に対応できるサーマルサイクラーを使用する必要があります。
ご利用のPCR機器のマニュアルをご確認ください。
PicoPLEX Kitの場合はヒートリッド温度は100～105℃、50 µlの反応液量に対応できるサーマルサイクラーを使用する必要があります。
ご利用のPCR機器のマニュアルをご確認ください。
Q5 ThruPLEX／PicoPLEXライブラリーを作製するために、キット以外にどのような試薬が必要か？
A5
ライブラリー作製後、Agencourt AMPure XP beads（Beckman Coulter社、Code No.A63880）を使用してサンプルを精製する必要があります。必要な試薬、備品は各キットのユーザーマニュアルをご確認ください。
Q6 ThruPLEX／PicoPLEX Kitの試薬は、全てボルテックスによって混合できるか？
A6
いいえ。使用前にバッファーとNuclease Free Waterはボルテックスし、軽くスピンダウンしてください。酵素はピペッティングによって穏やかに混合後、軽くスピンダウンしてください。インデックスプレートは使用前に軽くスピンダウンしてください。
Q7 ThruPLEX／PicoPLEX Kitで作製したライブラリーはマイクロアレイまたはPCR分析に使用できるか？
A7
はい。
Q8 リアルタイムPCRにおすすめの蛍光色素は？
A8
EvaGreen蛍光色素（Biotium社、Code No.31000、EvaGreen Dye、20×水溶液）は高感度で、ThruPLEX／PicoPLEX Kitの増幅反応への影響が少ないため適しています。
Q9 PCR増幅を行わずにライブラリー調製可能か？
A9
いいえ。ThruPLEX／PicoPLEX Kitによるライブラリー作製にはPCR増幅が必要です。増幅ステップの詳細は各キットのユーザーマニュアルをご確認ください。
Q10 増幅後のThruPLEX／PicoPLEX Kitのライブラリーは追加増幅までどれくらい保存できるか？
A10
未精製の増幅ライブラリーは精製または追加増幅を行うまで、－20℃、7日間まで保存できます。詳細は各キットのユーザーマニュアルをご確認ください。
Q11 ThruPLEX／PicoPLEX Kitはシングルインデックスまたはデュアルインデックスを使用するか？
A11
各種インデックスがあります。下記のシングルインデックス、デュアルインデックスを選択してください。
- DNA Single Index Kits
- DNA Single Index Kitは、ThruPLEX KitおよびPicoPLEX Kitで使用するために設計されたイルミナ社シーケンサーでのマルチプレックスシーケンシング用のライブラリーを構築するためのインデックスキットです。本キットには、イルミナ社TruSeq Single Index Kitのインデックス配列を持つインデックスPCRプライマーが含まれており、最大24個のサンプルのマルチプレックス解析が可能なsingle indexを提供します。インデックスPCRプライマーは12本のチューブにあらかじめ分注されたセットが2種類提供され、それぞれ最大のsingle indexの組み合わせの2分の1ずつを含んでいます（製品コード R400695、R400697）。各single indexチューブ（12S Set A、12S Set B）には、最大8回の使用に十分な容量が含まれます。
※12S Set A（製品コード R400695）は終売。 - DNA HT Dual Index Kits
- DNA HT Dual Index Kitは、ThruPLEXおよびPicoPLEX Kitで使用するために設計されたイルミナ社シーケンサーでのマルチプレックスシーケンシング用のライブラリーを構築するためのインデックスキットです。
本キットには、イルミナ社Nextera XT Index Kit v2のインデックス配列を持つインデックスPCRプライマーが含まれており、最大384個のサンプルのマルチプレックス解析が可能なdual indexを提供します。インデックスPCRプライマーは、異なるインデックスプレートに分注された製品が4種類提供され、それぞれ最大のdual indexの組み合わせの4分の1ずつを含んでいます（製品コード R400660～R400663）。dual indexプレート（96N Set A～D）の各ウェルには、1回の使用に十分な量が含まれます。
※96N Set B（製品コード R400661）、96N Set C（製品コード R400662）、96N Set D（製品コード R400663）は終売。 - DNA Unique Dual Index Kits
- DNA Unique Dual Index Kitは、ThruPLEXおよびPicoPLEX Kitで使用するために設計されたイルミナ社シーケンサーでのマルチプレックスシーケンシング用のライブラリーを構築するためのインデックスキットです。これらのキットには“IDT for Illumina UD”ユニークデュアルインデックス配列を持つインデックスPCRプライマーが含まれており、最大96個のサンプルのマルチプレックス解析が可能なdual indexを提供します。インデックスPCRプライマーは24本のチューブにあらかじめ分注されたセットが4種類提供され、それぞれ最大のdual indexの組み合わせの4分の1ずつを含んでいます。（製品コード R400665～R400668）。各dual indexチューブ（24U Set A～D）には、最大2回の使用に十分な容量が含まれます。
- Unique Dual Index Kits
- Unique Dual Index (UDI) Kitは、イルミナ社次世代シーケンサー用のライブラリーを調製するためのインデックスキットです。本キットにはデュアルインデックス配列を持つインデックスPCRプライマーが含まれており、各プライマーセットには、プレミックスされたi5およびi7の2つのインデックスプライマーがあらかじめ96ウェルプレートに分注されています。96種類のデュアルインデックスからなる4キット（製品コード 634752～634755）と24種類のデュアルインデックスからなる1キット（製品コード 634756）の2種類あります。製品コード 634756は、製品コード 634752のサブセットとなります。
96種類のデュアルインデックスを搭載した4キットを組み合わせることで、最大384サンプルのマルチプレックスシーケンスライブラリーを調製することが可能です。
