低コピープラスミドの精製には、使用するバッファー量を増やす必要があるため、追加バッファーが必要です。NucleoBond Xtra Buffer Set I(製品コード 740417)をご利用ください。
1 | 培養液の調製 集菌 | 培養液のOD600を測定し、培養液の推奨液量を求める。 培養液の液量(V)=800/ OD600 (ml) 培養液を、4℃、4,500~6,000×gで10分間以上遠心し、上清を除去する。 |
2 | 菌の溶解 | 細胞ペレットを、Buffer RES(+RNase A)*1 16 mlに完全に溶解する。 Buffer LYS 16 mlを細胞懸濁液に加え、穏やかに混合する。ボルテックスはしてはならない。 室温で、5分間静置する。 |
3 | カラムの平衡化 | | カラムフィルターを挿入したNucleoBond Xtra Columnを、Buffer EQU 12 mlで平衡化する。 図に示すように、カラムの縁に沿ってバッファーを注ぐ。液を自然落下させてカラムを空にする。 フィルター全体が湿っていることを確認する。 |
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4 | 中和 | Buffer NEU 16 mlを、2の細胞懸濁液に加え、直ちに穏やかに混合する。ボルテックスはしてはならない。 |
5 | ライセートの清澄化とローディング | 4の溶液が入ったチューブを3回反転して沈殿が均一に懸濁している状態にした後、フィルターに加える。 液を自然落下させてカラムを空にする。 |
6 | カラムの洗浄(1回目) | |
Buffer EQU 5 mlでフィルターとカラムを洗浄する。
図に示すようにカラムの縁に沿ってバッファーを注ぎ、フィルターに残っている溶液を確実に洗浄する。 |
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7 | カラムフィルターの廃棄 | | カラムからフィルターを引き抜く。あるいは、カラムを逆さにしてフィルターを除く。 |
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8 | カラムの洗浄(2回目) | | Wash Buffer WASH 8 mlで、カラムを洗浄する。 |
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9 | 溶出 | Elution Buffer ELU*2 5 mlでプラスミドDNAを溶出する。 溶出液を15 ml遠心チューブ(各自で用意)に集める。 |
10 | 沈殿 | | イソプロパノール(室温)を3.5 ml加え、ボルテックスで十分混合した後、室温で2分間静置する。 |
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NucleoBond Finalizerを用いた精製(所要時間:約5分) |
11 | 沈殿のローディング | | 30 mlシリンジからプランジャーを抜き取り、出口にNucleoBond Finalizerを取り付ける。 沈殿混液をシリンジの中にいれ、プランジャーを挿入してFinalizerに通す。 流出液は廃棄する。 |
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12 | 沈殿の洗浄 | | 30 mlシリンジからFinalizerを取り外し、プランジャーを抜き取る。 Finalizerをシリンジの出口に再びとりつける。 70%エタノール2 mlをシリンジの中にいれ、プランジャーを挿入してエタノールを押しこみ、Finalizerに通す。 流出したエタノールは廃棄する。 |
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13 | 膜フィルターの乾燥 | |
30 mlシリンジからFinalizerを取り外し、プランジャーを抜き取る。 Finalizerを再びシリンジの出口に取り付ける。 残ったエタノールを飛ばすため、プランジャーを挿入して空気を押しこみ、Finalizerに通す。 エタノールが全く出てこなくなるまで、このステップを3回以上繰り返す。 (キムタオル等の上で、Finalizerの先からエタノールが出てこないことを確認する。) |
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14 | DNAの溶出 | | 30 mlシリンジからFinalizerを取り外す。 1 mlシリンジからプランジャーを抜き取り、Finalizerをシリンジの出口に取り付ける。 適量のBuffer TRIS(またはTE Buffer)200~800 μlをシリンジの中に加える。 Finalizerの出口を新しい回収チューブにセットし、プランジャーを挿入してプラスミドを溶出する。 1 mlシリンジからFinalizerを取り外し、プランジャーを抜き取る。 Finalizerをシリンジの出口に再び取り付ける。 最初の溶出液をシリンジに戻し、同じ回収チューブの中に再び溶出する。 |
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