1.試薬の準備 |
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TCEP*1,Carrier RNA溶液*2,rDNase溶液*4,Buffer RA3*5が添付のprotocolに従って調製、希釈されていることを確認する。
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2. サンプルの準備 |
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組織:5
mgの組織を用意する。液体窒素を加え、凍結しながら乳鉢で粉状にする、またはホモジナイザー処理などで細分化処理を行う。
細胞:1×105個の培養細胞を遠心で回収する。または、ディッシュ上で直接溶解する場合は、ディッシュ上の培地を出来る限り吸引除去する。 |
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3. サンプルの溶解 |
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Buffer RA1 200 μl(組織の場合)または100 μl(細胞の場合)にTCEP*1 4 μl(組織の場合)または2 μl(細胞の場合)を添加した溶液を、組織または細胞に添加し、vortexを行い(5秒間×2回)、均一にホモジナイズする。 |
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4. キャリアRNAの添加
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Carrier RNA希釈溶液*2 5 μlを添加する。vortexを行い(5秒間×2回)、スピンダウンする。 |
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5. ライセートのろ過 (オプション) |
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NucleoSpin Filter(紫のリング)をCollection Tube(2 ml)にセットする。
4のライセートをNucleoSpin Filterに加え、11,000×g、30秒間遠心する。
NucleoSpin Filterを取り除く。*3
※サンプルが少量の細胞の場合は、この操作は除いてもよい。
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6. エタノールの添加 |
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ろ液に70%エタノール200 μl(組織の場合)または100 μl(細胞の場合)を添加し、よく混合する。 |
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7. カラムへの吸着 |
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NucleoSpin RNA XS Column(水色のリング)を用意する。
6の溶液をカラムに添加し、11,000×g、30秒間遠心する。
カラムを新しいCollection Tube(2 ml)にセットする。 |
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8. メンブレンの脱塩 |
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MDB 100 μlをカラムに添加し、11,000×g、30秒間遠心する。 |
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9. DNase処理 |
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rDNase溶液*4
3 μlとReaction Buffer for rDNase 27 μlを混合し、DNase reaction mixtureを調製する。
DNase reaction mixture 25 μlをシリカメンブレンの中央へ直接添加し、室温(18~25℃)で15分間インキュベートする。 |
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10. メンブレンの洗浄 |
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1回目の洗浄
Buffer RA2 100 μlをカラムに添加し、室温で2分間インキュベートした後、11,000×gで30秒間遠心する。
カラムを新しいCollection Tube(2 ml)にセットする。 |
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2回目の洗浄
Buffer RA3*5 400 μlをカラムに添加し、11,000×gで30秒間遠心する。
ろ液を捨てた後、再び同じCollection Tubeにセットする。 |
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3回目の洗浄
Buffer RA3*5 200 μlをカラムに添加し、11,000×gで2分間遠心する。
カラムを新しいCollection Tube(1.5 ml)にセットする。 |
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11. RNAの溶出 |
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RNase-free H2O 10 μlをカラムに加え、11,000×gで30秒間遠心する。
溶出したRNA溶液は、-20℃または-70℃で保存する。 |
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