試薬の準備 | Buffer H1が沈殿していないことを確認する。 沈殿している場合は50℃で数分間温めて溶解させる。 | |
1. | サンプルの準備 | 培養細胞 107個までの細胞を50 mlチューブで遠心により集める。 動物組織 300 mgまでの組織を細切れにした後、50 mlのチューブに入れる。 バクテリア 50 mlのチューブに20 mgのバクテリアとBuffer H1 1 mlを加えて懸濁する。 この懸濁液にリゾチーム溶液*1100 μlを加えて混合し、37℃で1時間インキュベートする。 酵母 50 mlのチューブに50 mgの酵母とBuffer H1 1 mlを加えて懸濁する。 この懸濁液にzymolyase溶液*2100 μlを加えて混合し、37℃で2時間インキュベートする。 液体試料 2 ml分の液体試料を50 mlのチューブに入れる。 |
2. | 溶解Bufferの添加 | Buffer H1 5 mlとLiquid Proteinase K 200 μlを加える(リゾチーム処理、zymolyase処理 を行った場合にはBuffer H1を加えて最終液量を5 mlにする)。Vortexで5秒間混合する。 |
3. | サンプルの溶解 | 時々混合しながら50℃で30分間インキュベートして溶解させる。 |
4. | RNAの分解 | Liquid RNase A 100 μlを添加して、転倒混和を行う。 室温で5分間インキュベートする。 |
5. | カラムの平衡化 | カラムフィルターを挿入したNucleoBond HMW ColumnをBuffer H2 12 mlで平衡化する。 |
6. | Bufferの添加 | 4の溶液にBuffer H2 10 mlを加えて転倒混和する。 |
7. | カラムへの結合 | 5のカラムに6の溶液を添加し、自然落下させてカラムを空にする。 |
8. | フィルターの共洗い | Buffer H3 6 mlをカラムフィルターの縁から加え、自然落下で通す。 カラムが空になったら、カラムフィルターを取り除く。 |
9. | カラムの洗浄 | Buffer H4 12 ml添加し、自然落下でカラムを空にする。 |
10. | 溶出 | カラムの下に50 mlチューブをセットして、Buffer H5 5 mlをカラムに加え、DNAを溶出させる。 |
11. | 沈殿 | 3.5 mlイソプロパノールを加えて、10回転倒混和を行う。 4,500×g以上室温で10分間遠心して、DNAを沈殿させる。 上清を注意深く除去する。 |
12. | 乾燥 | 70%エタノール2 mlを加え、4,500×g以上で室温5分間遠心した後、 注意深く上清を完全に取り除く。エタノールの液滴が見えなくなるまで、 室温で風乾する。(過剰な乾燥は避ける) |
13. | DNAの溶解 | 150 μlのBuffer HEを加えて、ゆっくり揺らしながら溶解させる(完全に溶解させるためには 終夜程度の時間をかけることが必要)。以後の実験には広口のピペットチップを使用することが 望ましい。 |