500 mg鉢植え土壌から微生物DNAの抽出を4パターンの溶解条件(SL1, SL2, SL1+SX,SL2+SX)で行った。
4条件とも高分子のDNAの抽出することができたが、収量はBuffer SL2+Enhancer SXの条件を用いたときが最もよかった。(表A,図B)。DNA抽出液からのPCR増幅を検証するために、実際に各DNA抽出液を鋳型にしてPCRを行ったが、すべての抽出液でPCR反応の阻害は観察されなかった(図C)。
A
MN Buffer | DNA yeild (μg) | Purity (A260/A280) |
SL1 | 3.4 | 1.55 |
SL1+SX | 3.5 | 1.55 |
SL2 | 3.4 | 1.54 |
SL2+SX | 5.7 | 1.74 |
B
C