1. | 血漿サンプルの遠心 | 血漿サンプル*1を4,500×g、10分間遠心して、細胞やその残滓を除去する。 |
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2. | サンプルの溶解 |
1. の血漿3 ml*1を50 mlチューブに移し、45 μlのProteinase Kを添加し、混合する。室温で5分間反応させたのち、Buffer VL 3 mlを加え、20秒間激しく混合する。 56℃で5分間インキュベートする。 |
3. | エタノールの添加 | エタノール(96~100%)3 mlを*1添加し、10秒間激しく混合する。 |
4. | カラムへの吸着 |
NucleoSnap cfDNA ColumnをVacuum Manifoldにセットする。Column Conditioner CC 500 μlをカラムに添加し、0.4~0.6 barで液がカラムを通過するまで約30秒間吸引する。*2 3. の溶液をカラムに加え、約0.4 barで液がカラムを通過するまで5~15分間吸引する。通過後は吸引を止める。 |
5. | メンブレンの洗浄 |
1回目の洗浄 Buffer VW1 1 mlをカラムに添加し、0.2~0.4 barで液が通過するまで約1分間吸引する。通過後吸引を止める。 2回目の洗浄 Buffer WB 500 μlをカラムに添加し、0.2~0.4 barで液が通過するまで約30秒間吸引する。通過後吸引を止める。 |
6. | メンブレンの乾燥 |
5. のカラムをManifoldから取り外し、Collection Tube(2 ml:蓋なし)に装着し、カラムの上部コンテナ部分を取り外す。 カラムを入れた2 mlのチューブを11,000~20,000×gで3分間遠心する。カラムをCollection Tubeのろ液に触れないよう取り出す。 |
7. | DNAの溶出 |
カラムを1.5 mlのCollection Tubeにセットする。 Elution Buffer 50 μlを添加し、3分間室温でインキュベートする。 11,000×gで1分間遠心し、DNAを溶出させる。 |
*1 | 血漿サンプルの容量 使用する血漿量を変える場合には、血漿量に比例させてProteinase K、Buffer VL、エタノールの使用量を変える必要がある。 5 mlを超える血漿を使用する場合には、追加のProteinase K(製品コード 740396)、Buffer VL(製品コード 740833.200)が必要になる。 |
血漿量 [ml] | Proteinase K [μl] | Buffer VL [ml] | Ethanol [ml] |
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1 | 15 | 1 | 1 |
2 | 3 | 2 | 2 |
3 | 45 | 3 | 3 |
4 | 60 | 4 | 4 |
5 | 75 | 5 | 5 |
6 | 90 | 6 | 6 |
7 | 105 | 7 | 7 |
8 | 120 | 8 | 8 |
9 | 135 | 9 | 9 |
10 | 150 | 10 | 10 |
*2 | カラムの平衡化は、3. の溶液をカラムに加える1~5分前に行う。 |