試薬の調製 | Buffer RST1に沈殿がないことを確認する。もし沈殿がある場合には、40~50℃で保温して沈殿を溶解する。 Buffer RST5*1 、rDNase溶液*2が添付の英文説明書に従って調製されていることを確認する。 |
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1. | サンプルの準備 |
180~220 mgのヒト糞便試料をMN Bead Tubes Type Aに入れる。過剰量の試料を使用すると収量、純度が低下する可能性があるため注意する。 200 μlのNucleoZOLと660 μlのBuffer RST1を加えて蓋を閉める。 |
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2. | サンプルの溶解 |
Bead TubeをVortex mixer上のMN Bead Tube Holderにセットし、室温で10分間最高速度で振盪する。 13,000×g、5分間遠心する。 沈殿物や浮遊物を吸わないように510 μlの上清を2 mlの新しいチューブ(各自で用意)に移す。 |
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3. | PCR阻害物質の沈殿 |
Buffer RST2 140 μlを加えて、vortexで5秒間混合する。13,000×g、3分間遠心する。 |
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4. | 溶解液の濾過 |
NucleoSpin Inhibitor Removal Column(赤リング)をCollection Tube(2 ml:蓋付)にセットする。 3.の上清 600 μlをカラムに加え、13,000×g、1分間遠心する。 |
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5. | Bufferの添加 | Buffer RST2 180 μlを4.の上清に加えて、vortexで5秒間混合する(small RNAが不要な場合は加えるBuffer RST2 量を120 μlとする)。 |
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6. | カラムへの吸着 | NucleoSpin RNA Stool Column(水色リング)をCollection Tube(2 ml)にセットする。 5.の上清600 μlをカラムに加え、13,000×g、1分間遠心する。 ろ液を捨てた後、同じCollection Tubeにカラムをセットし、残りの5.の上清をカラムに加え、13,000×g、1分間遠心する。 ろ液を捨てた後、同じCollection Tubeにカラムを再セットする。 |
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7. | メンブレンの洗浄 |
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8. | メンブレンの乾燥 | カラムをさらに13,000×gで2分間遠心する。カラムをCollection Tube内のろ液に触れないよう取り出す。 |
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9. | RNAの溶出 |
カラムをマイクロチューブ(1.5 ml:各自で用意)にセットする。 RNase free H2O 100 μlを添加し、蓋を閉めて、13,000×gで1分間遠心し、RNAを溶出させる。溶出後にvortexで2秒間撹拌しておく。 |