ChIP-Seq解析

タンパク質とクロマチンの相互作用研究に
★ATAC-seqおよびChIP-seq受託セミナーを開催いたします。
～データ活用方法から、自分ですぐ使える試薬まで～
セミナー詳細、お申込みはこちら

特長

  • 経験豊富なActive Motif社による作業
  • 細胞や組織からクロマチン免疫沈降サンプルの解析（ChIP-Seq）を実施。バリデーション済み抗体も多数ご用意
  • 修飾ヒストン結合領域、転写因子結合領域、RNA polymerase II結合領域をゲノムワイドに検出

サービス内容

培養細胞、組織をご提供いただき、Active Motif社でChIP反応を実施します。ChIP産物はNextSeq等を用いて網羅的にシーケンスを行います。取得した配列は参照ゲノムにマッピングし、リードの集中する箇所をエンリッチ領域として検出、アノテーション情報を付与してリスト化します。コントロールサンプル（input）の解析を加えることで、バックグラウンドノイズを抑えた高精度の解析が可能です。さらに、マッピングの様子はUCSCゲノムブラウザにて閲覧可能な形式で納品いたします。

■サービス詳細は技術資料をご覧ください（閲覧にはWEB会員ログインが必要です）。
ChiP-Seq解析ウェブ会員限定資料

■チラシをご覧ください。
ATAC-Seq／ChIP-Seq解析受託サービス
ATAC-seq解析受託サービス
  • 作業の流れ
    1. お問い合わせ・・・Active Motif社担当者と実験計画の相談も可能
    2. 検体送付・・・固定化した培養細胞、または凍結組織を送付
    3. ChIP反応・・・クロマチンの調製、およびChIP反応をActive Motif社にて実施
    4. シーケンス・・・イルミナ社シーケンサーを用いてシーケンスし、 検体あたり数千万tagを取得
    5. データ解析・・・検体間比較結果も納品

価格・納期

ご依頼の内容により異なりますので、お問い合わせください。

納品物

  • Summary Report
  • シーケンスデータ一式（fastq）
  • マッピング情報（bam）
  • ChIP解析結果一式（Excel）
  • UCSC閲覧ファイル（bigWigURL）　等

ご注文方法

・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらへご送付ください。
・その他の必要書類、サンプル送付先を担当者よりご連絡します。
※WEB会員にログインした状態で解析依頼書をダウンロードいただくと、WEB会員登録情報が依頼書に反映されます。
※弊社「個人情報としてのゲノムデータの取り扱い」の詳細はこちらをご参照ください。

  • サンプル送付
    ・事前にサンプル送付予定をご連絡ください。担当者よりサンプル送付先をご案内します。
    ・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。

受入サンプル

  • ChIP解析の場合
    提供物 サンプル量 処理方法
    培養細胞 5×106～2×107 cells 別途固定方法をご連絡いたします。
    組織（B細胞・T細胞含む） 100～200 mg 液体窒素で凍結後、－80℃保存した組織
    ・上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。

ご留意事項

・ 供与核酸の品質によっては再提供をお願いすることがあります。
・ ヒト試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒト試料・情報の取り扱いについて」をお読みください。
・ お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。
・ 解析依頼書にご記載いただくサンプル名称およびグループ名称には、文字種や命名方法に関する制約がございます。依頼書記載の命名規定に沿わない名称は解析エラーの原因となる可能性があるため、弊社にて修正させていただく場合がございます。あらかじめご了承ください。

関連製品・受託

ヒト試料・情報の取り扱いについて
個人情報としてのゲノムデータの取り扱い
ATAC-Seq解析
DNAメチル化解析（NGS）
次世代シーケンス（NGS）解析受託
RNA-Seq解析

注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
  • ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。