DNAメチル化解析(ビーズアレイ)

遺伝子発現調節やエピゲノム解析

■お問い合わせ窓口(A)

TEL:077-565-6999

特長

  • ヒトCpGサイトのメチル化解析
  • ヒト全ゲノム網羅的およびイルミナ社が厳選したメチル化サイトの解析
  • プローブ分類、統計解析など、データマイニングサービスも充実

概要

イルミナ社ビーズアレイを用いたDNAメチル化解析を行います。注目されるエピジェネティクス関連研究として、DNAメチル化解析が可能です。
タカラバイオでは遺伝子工学に熟練した技術者と充実した設備により、精度の高いサービスをご提供いたします。

解析対象ビーズアレイ
  • Infinium MethylationEPIC BeadChip (85万以上のメチル化サイト)
    85万以上のメチル化サイトを搭載し、大規模なゲノムワイドでのメチル化解析が行えます。バイサルファイト法を採用しているため解析結果にバイアスが少なく、網羅的な解析が可能です。

    ‐ CpGアイランドおよびその周辺のCpGサイト
    ‐ ヒト幹細胞で同定された非CpGサイトのメチル化領域(CHHサイト)
    ‐ 腫瘍細胞と正常細胞間で異なるメチル化を示す領域
    ‐ FANTOM5エンハンサー領域
    ‐ ENCODEオープンクロマチンとエンハンサー領域
    ‐ DNase高感受性部位
    ‐ miRNAプロモーター領域
    ‐ HumanMethylation450K BeadChipに搭載されているコンテンツの90%以上

ビーズアレイ詳細についてはイルミナ社ホームページをご覧ください。
■チラシをご覧ください。
メチル化DNA解析サービス

サービス内容

ゲノムDNAをご送付いただき、イルミナ社の推奨する方法に従い、ターゲットの作製、ハイブリダイゼーション、スキャニングなどの一連の作業を行い、GenomeStudio Data Analysisソフトウェアを用いた解析データを納品いたします。

<標準解析>
GenomeStudioでの一時解析結果を納品します。
各検体ごとの標準化とメチル化レベルの算出までを行います。



充実したアノテーション情報(以下表)により、様々な視点から絞込みが可能です。



<データマイニング解析>
   プローブ、遺伝子、CpG Island毎にメチル化レベル(AVG_Beta値)に有意差のあるデータを抽出します。


Webブラウザで解析結果をグラフィカルに閲覧できるビューワを付属しています。



<その他のオプションサービス>
  • FFPEサンプル由来DNAからの修復作業
    ホルマリン固定パラフィン包埋組織(FFPE)サンプルからの解析も可能です。

価格・納期

お問い合わせください。

納品物

  • 作業報告書
  • 解析データ(記録メディア)

ご注文方法

・サンプル送付の前に、以下のフォーマットに必要事項をご記入の上、電子メールにてこちらこちらへご送付ください。
・依頼書記載のサンプル名称と、実際の送付サンプルに記載の名称は必ず一致させてください。
※WEB会員にログインした状態で、解析依頼書をダウンロードいただきますと、登録情報が依頼書に反映されます。
  • サンプル送付
    ・解析サンプルならびに依頼書を下記サンプル送付先へご送付ください。
    ・サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
    ・送付サンプルがDNAの場合には-20℃の状態の冷凍便でお送りください。

受入サンプル

  • ゲノムDNA
    以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

    サンプル量 濃度 純度
    OD260/OD280 OD260/OD230
    ゲノムDNA 2 μg以上 50 ng/μl以上 1.6以上
    • DNAサンプルは、標準的なDNA調製キットを用いて調製されたものが使用できます。Reduced EDTA TE buffer:10 mM Tris-HCl、0.1 mM EDTA pH 8.0などに溶解の上、規定濃度以上に調製してください。
    • RNAの混入により反応阻害が生じる可能性があります。必ず RNase 処理を実施したサンプルをご提供ください。
    • 48サンプル以上の場合は96ウェルプレートでご提供ください。プレートはハーフスカートプレートもしくはフルスカートプレートをご使用ください。
      ※推奨:Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates cat.No 0030128648
      Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates
    • DNAサンプルは、電気泳動(1%ゲル)で10~20 kbに明瞭なバンドが検出され、分解がないことをご確認ください。電気泳動写真を依頼書に添付してください。
    • サンプル受領後に、二本鎖DNAの定量および電気泳動による濃度・純度等の確認を行います。その結果によっては、DNAサンプルの再送をお願いする場合があります。あらかじめご了承ください。
    • FFPEサンプルの場合は、別途ご相談ください。

ご留意事項

ご送付サンプルに起因するシグナル検出不能の場合は、責任を負いかねますのであらかじめご了承ください。
本解析作業は研究目的のみです。得られた結果は診断目的には利用できません。
ヒト生体試料の解析にあたり、個人情報に関わるサンプルは、お客様ご所属施設の倫理委員会等で遺伝子解析研究に用いられることの承認が得られており、かつお客様の元で匿名化されたものに限らせていただきます。
詳しくは、「ヒトゲノム・遺伝子解析受託サービスについて」をお読みください。
お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、業務終了後3ヵ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。
タカラバイオはイルミナ社認定のサービスプロバイダーです。
イルミナ社認定
注意事項
  • 本受託サービスは、個別に合意した場合を除き、すべて研究目的として作業を行います。納品物を試験研究目的以外へご使用される場合、弊社では納品物に起因する損失・損害等については一切の責任を負いかねます。納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合がありますのでご注意ください。
  • 納品物に起因して、直接的もしくは間接的に発生したお客様の損害については、明らかに弊社の責に帰すべき事由による場合を除いて、弊社は一切その責任を負いません。
  • ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。