In-Fusion SMARTer Directional cDNA Library Construction Kitは、ClontechのSMARTer cDNA合成およびIn-Fusion PCRクローニングという2つのシステムを組み合わせたcDNAライブラリー構築キットである。
本キットを用いることで、面倒なcDNAの制限酵素処理や平滑化、アダプター付加は不要で、cDNA合成からクローニング、ライブラリーの構築増幅までを3日間で簡便に行うことができる(下図)。
total RNAから合成されたcDNAはデイレクショナルにベクターにクローニングされ、大腸菌へ形質転換後、寒天培地上に現れたコロニーの90%以上はインサートを含んでいる。
SMARTer cDNA合成
- 微量total RNA(最小必要量10 ng)からでも、品質の高い完全長cDNAライブラリーを合成できる。
- 1チューブ、一回の酵素反応で完了。アダプターライゲーションやテール形成反応、精製ステップは不要。
In-Fusionクローニング
- 連結したいベクターの末端15塩基とそれぞれ相補的な配列を付加したPCRプライマーで目的遺伝子を増幅しておくだけで*、簡便に高効率にクローニング。
- 任意のプラスミドベクターの任意の部位にディレクショナルに挿入可能。
- 余分な配列をいっさい付加しない
* | 本キットには、クローニングベクター(pSMART2IFD Linearized Vector)および、そのベクター末端15塩基と相補的な配列を付加したPCRプライマー(5’ PCR Primer II A、3’ In-Fusion SMARTer PCR Primer)が含まれています。別途PCR酵素が必要です。 |
図1. In-Fusion SMARTer Directional cDNA Library Construction KitによるcDNA合成、ライブラリー構築、増幅
用途
・cDNA ライブラリー構築
・完全長cDNA取得
・cDNA増幅
・標的遺伝子単離、解析
・SMARTer V Oligonucleotide
・3’In-Fusion SMARTer CDS Primer
・SMARTScribe Reverse Transcriptase
・5× First-Strand Buffer(RNase-Free)
・DTT
・dNTP mix
・RNase Inhibitor
・Control Total RNA
・5’PCR Primer II A
・3’In-Fusion SMARTer PCR Primer
・Sodium Acetate
・Glycogen
・Deionized H
2O
・1× Fractionation Column Buffer
・CHROMA SPIN+TE-1000 Columns
・5X In-Fusion Snap Assembly Master Mix
*1
・pUC19 Control Vector, linearized
*1
・2 kb Control Insert
*1
・pSMART2IFD Linearized Vector
・Forward Screening Primer
・Reverse Screening Primer
・QuickClean Enzyme Removal Resin
*2
*1 In-Fusion Snap Assembly Master Mix(製品コード 638947)と同じものです。
*2 製品コード 631770と同じものです。
※ | 本キットの使用には別途PCR酵素が必要です。ユーザーマニュアルではAdvantage 2 PCR Kit(製品コード 639207)を用いたプロトコールを紹介しています。 |