制限酵素の中には基質となるDNAに対して大過剰量を用いた場合に、その特異性が低下して本来の認識配列とは一部異なる塩基配列を切断するものがあり、この現象を制限酵素のStar活性と呼んでいる。ここではStar活性の認められている酵素とその出現を促進する条件、さらにStar活性によって切断される塩基配列が報告されているものについてはその配列を示した。
| 制限酵素 | 正常な認識配列*1 | 反応条件*2 | 認識し得る配列*1 | 参考文献 |
| Aat II | GACGT↓C | E | 22 | |
| Aor13H I | T↓CCGGA | A, C, E | 22 | |
| BamH I | G↓GATCC | A, B, E | GRATCC GGNTCC GGANCC GGATYC |
1, 2, 3, 4 |
| Ban II | GRGCY↓C | A, E, F | 22 | |
| BciT130 I | CC↓WGG | A, E | ||
| Bgl I | GCCNNNN↓NGGC | F | 22 | |
| Bgl II | A↓GATCT | E | 22 | |
| BmeT110 I | C↓YCGRG | E | ||
| Bln I | C↓CTAGG | B, E, G | ||
| BspT104 I | TT↓CGAA | A, E | 22 | |
| BstP I | G↓GTNACC | A, F | 22 | |
| Dde I | C↓TNAG | A, B, E | ||
| EcoO65 I | G↓GTNACC | E, F | 22 | |
| EcoR I | G↓AATTC | A, B, E, F | NAATTN | 4, 8, 9, 10, 11 |
| EcoR V | GAT↓ATC | E | RATATC GNTATC GANATC GATNTC GATANC GATATY |
12, 22 |
| EcoT22 I | ATGCA↓T | F, H | 22 | |
| Fba I | T↓GATCA | A, C, E, F | 22 | |
| Hae III | GG↓CC | A | 1 | |
| Hha I | GCG↓C | A, B, E | 4 | |
| Hinc II | GTY↓RAC | E | 22 | |
| Hind III | A↓AGCTT | B, E | RAGCTT ANGCTT AAKCTT AAGMTT AAGCNT AAGCTY |
10, 13, 22 |
| Hpa I | GTT↓AAC | A, E | 1, 22 | |
| Kpn I | GGTAC↓C | A, B, C, E | 22 | |
| Msp I(Hap II、Hpa II) | C↓CGG | A, B | ||
| Mun I | C↓AATTG | A, F | 22 | |
| Nco I | C↓CATGG | A, E | 22 | |
| Nde I | CA↓TATG | B, G | ||
| Nhe I | G↓CTAGC | A, C, E, F | 22 | |
| Psp1406 I | AA↓CGTT | E | 22 | |
| Pst I | CTGCA↓G | A, E | 1, 4, 22 | |
| Pvu II | CAG↓CTG | A, E | NAGCTG CNGCTG CANCTG CAGNTG CAGCNG CAGCTN |
15, 16, 22 |
| RspRS II | T↓TAA | A | ||
| Sac I | GAGCT↓C | A, E | 22 | |
| Sal I | G↓TCGAC | A, B, E, G | 4, 22 | |
| Sau3A I | ↓GATC | A, E | SATC GMTC GAKC GATS |
17, 22 |
| Sca I | AGT↓ACT | B, C, F | 21 | |
| Sfi I | GGCCNNNN↓NGGCC | B, E | 22 | |
| Smi I | ATTT↓AAAT | A, B, C, E | 22 | |
| Spe I | A↓CTAGT | E, F | 22 | |
| Sse8387 I | CCTGCA↓GG | E, F | 22 | |
| Ssp I | AAT↓ATT | A, C, E, F | 22 | |
| Taq I | T↓CGA | A, B, E, G | 22 | |
| Van91 I | CCANNNN↓NTGG | A | 22 | |
| VpaK11B I | G↓GWCC | A, C, E, F | 22 | |
| Xba I | T↓CTAGA | A | 1, 4 |
| *1 | M | ： | A or C | *2 | A | ： | 高濃度グリセロール存在 |
| K | ： | G or T | B | ： | Mn2+存在 | ||
| N | ： | A or C or G or T | C | ： | アルカリpH | ||
| R | ： | A or G | D | ： | 低pH | ||
| Y | ： | C or T | E | ： | DMSO存在 | ||
| W | ： | A or T | F | ： | 低イオン強度 | ||
| S | ： | G or C | G | ： | 高イオン強度 | ||
| H | ： | 2-メルカプトエタノール存在 | |||||
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