制限酵素切断部位数一覧表

* R:A or G  D:A or G or T
Y:C or T H:A or C or T
W:A or T V:A or C or G
S:G or C B:C or G or T
M:A or C N:A or C or G or T
K:G or T  
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制限酵素 認識配列* 切 断 部 位 数
pKF3 pUC19 pUC119 pBR322 ΦX174 ColE 1 M13mp18 λ Ad2
Aat II GACGTC 011 110 0103
Acc I GTMKAC 211 222 1917
Acc II CGCG 71014 231424 18157303
Acc III TCCGGA 100 102 0248
Ace III CAGCTC(7/11) 334 519 22929
Aci I CCGC(-3/-1) 223439 673653 42516582
Afa I GTAC 534 31119 1911383
Afl II CTTAAG 000 021 034
Afl III ACRYGT 211 126 32025
Age I ACCGGT 000 000 0135
Alu I AGCT 141517 172444 27143158
AlwN I CAGNNNCTG 111 107 14125
Aor13H I TCCGGA 100 102 0248
Aor51H I AGCGCT 100 400 2213
Apa I GGGCCC 000 000 0112
ApaB I GCANNNNNTGC 110 221 03320
ApaL I GTGCAC 133 311 047
Apo I RAATTY 313 178 115829
Asc I GGCGCGCC 000 000 022
Ava I CYCGRG 212 111 2840
Ava II GGWCC 122 814 13573
Avi II TGCGCA 122 410 11517
Bae I (10/15)ACNNNNGTAYC(12/7) 000 010 3105
Bal I TGGCCA 100 101 11817
BamH I GGATCC 111 100 153
Ban II GRGCYC 112 200 2757
Bbe I GGCGCC 011 420 1120
Bbv I GCAGC(8/12) 71213 211434 10199179
Bbv II GAAGAC(2/6) 000 333 02427
Bcc I CCATC 135 91213 1414562
Bcef I ACGGC(12/13) 323 3119 711580
Bce83 I CTTGAG(16/14) 344 627 51319
Bcg I (10/12)GCANNNNNNTCG(12/10) 011 322 02810
Bci VI GGATAC 122 244 0269
Bcn I CCSGG 577 10118 411497
Bet I WCCGGW 433 5311 68128
Bfi I ACTGGG(4/11) 122 503 1422
Bgl I GCCNNNNNGGC 022 300 12920
Bgl II AGATCT 100 000 1611
Bin I GGATC(4/5) 61010 12011 45835
Bln I CCTAGG 000 000 022
BmeT110 I CYCGRG 212 111 2840
Bmg I GKGCCC 100 001 1650
BmgT120 I GGNCC 367 1528 474164
Bpl I GAGNNNNNCTC 100 000 0112
Bpu10 I CCTNAGC(-5/-2) 100 173 41923
Bpu1102 I GCTNAGC 000 001 068
BsaA I YACGTR 201 126 51422
BsaB I GATNNNNATC 000 122 2212
BsaX I ACNNNNNCTCC 112 002 41929
Bsb I CAACAC 012 201 21812
BscG I CCCGT 467 12223 810471
BseM II CTSAG 355 71010 237975
BseR I GAGGAG(10/8) 000 021 11963
Bsg I GTGCAG(16/14) 000 104 04134
Bsi I CTCGTG(-5/-1) 133 322 0811
BsiY I CCNNNNNNNGG 969 201921 17176216
Bsm I GAATGC(1/-1) 300 142 14610
BsmA I GTCTC(1/5) 244 3410 53760
BspG I CTGGAC 000 323 11731
BspH I TCATGA 033 432 183
BspLU11 I ACATGT 111 102 329
BspM I ACCTGC(4/8) 111 134 34139
Bsp1286 I GDGCHC 356 1033 538105
Bsp1407 I TGTACA 000 001 155
Bsp24 I (8/13)GACNNNNNNTGG(12/7) 233 412 11818
BspT104 I TTCGAA 100 002 071
BspT107 I GGYRCC 245 932 72557
Bsr I ACTGG(1/-1) 61112 19923 1811086
BsrB I GAGCGG(-3/-3) 134 213 41728
BsrD I GCAATG(2/0) 122 243 34414
BssH II GCGCGC 000 011 0652
Bst1107 I GTATAC 100 101 033
BstP I GGTNACC 100 002 01310
BstX I CCANNNNNNTGG 000 031 01310
Cac8 I GCNNGC 101417 311923 28237285
CfrA I GCANNNNNNNNGTGG 000 002 0108
Cfr10 I RCCGGY 012 705 16140
Cfr13 I GGNCC 367 1528 474164
Cje I (8/14)CCANNNNNNGT(15/9) 588 9613 88879
CjeP I (7/13)CCANNNNNNNTC(14/8) 366 10510 39265
Cla I ATCGAT 100 101 2152
Cpo I CGGWCCG 000 000 052
CviJ I RGCY 394451 7369109 102692680

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制限酵素 認識配列* 切 断 部 位 数
pKF3 pUC19 pUC119 pBR322 ΦX174 ColE 1 M13mp18 λ Ad2
CviR I TGCA 41313 211833 18272207
Dde I CTNAG 466 81411 2910497
Dpn I G6mATC 121515 22019 711687
Dra I TTTAAA 233 323 51312
Dra III CACNNNGTG 001 012 11010
Drd I GACNNNNNNGTC 123 212 136
Drd II GAACCA 101 040 72221
Dsa I CCRYGG 200 231 24682
Eae I YGGCCR 233 623 33970
Eam1105 I GACNNNNNGTC 011 110 099
Eco31 I GGTCTC(1/5) 011 101 0218
Eco52 I CGGCCG 100 100 0219
Eco57 I CTGAAG(16/14) 122 2011 04023
Eco81 I CCTNAGG 000 000 127
Eci I TCCGCC 233 424 23229
EcoE I GAGNNNNNNNATGC 000 101 0104
EcoN I CCTNNNNNAGG 000 100 0910
EcoO65 I GGTNACC 100 002 01310
EcoO109 I RGGNCCY 011 400 0344
EcoR I GAATTC 111 101 155
EcoR V GATATC 000 102 0219
EcoT14 I CCWWGG 100 100 01044
EcoT22 I ATGCAT 000 000 01410
Esp3 I CGTCTC(1/5) 222 104 11421
Fau I CCCGC(4/6) 257 10010 1090147
Fba I TGATCA 100 001 085
Fin I GGGAC 100 4210 23859
Fnu4H I GCNGC 161922 423145 17380411
Fok I GGATG(9/13) 155 12818 415078
Fse I GGCCGGCC 000 000 003
Gdi II YGGCCG(-5/-1) 133 522 22372
Gsu I CTGGAG(16/14) 111 434 22532
Hae I WGGCCW 633 766 46456
Hae II RGCGCY 335 1186 64876
Hae III GGCC 121113 221115 15149216
Hae IV GAYNNNNNRTC 211 363 43916
Hap II CCGG 121314 26537 18328171
Hga I GACGC(5/10) 244 111415 710287
HgiA I GWGCWC 255 832 32838
HgiE II ACCNNNNNNGGT 121 211 11410
Hha I GCGC 91723 311826 26215375
Hin1 I GRCGYC 033 672 14044
Hinc II GTYRAC 311 2130 13525
Hind III AAGCTT 111 100 1712
Hinf I GANTC 468 102115 2714872
Hin4 I GABNNNNNVTC 422 596 55952
Hpa I GTTAAC 100 030 0146
Hph I GGTGA(8/7) 978 12915 1816899
Kpn I GGTACC 111 000 128
Ksp632 I CTCTTC(1/4) 033 224 23429
Mae II ACGT 7511 101913 2214383
Mae III GTNAC 61113 171724 24156118
Mbo I GATC 121515 22019 711687
Mbo II GAAGA(8/7) 578 111121 11130113
Mcr I CGRYCG 455 716 42250
Mfl I RGATCY 477 804 32122
Mlu I ACGCGT 100 021 075
Mly I GACTC(5/5) 246 4106 86140
Mme I TCCRAC(20/18) 323 453 41825
Mnl I CCTC(7/6) 101314 263441 61262397
Mse I TTAA 81320 153530 63195115
Msl I CAYNNNNRTG 133 773 26235
Msp I CCGG 121314 26537 18328171
Mun I CAATTG 000 010 084
Mva I CCWGG 855 6214 770136
Mwo I GCNNNNNNNGC 111317 342135 20346391
Nae I GCCGGC 001 401 1113
Nco I CCATGG 100 000 0420
Nde I CATATG 110 100 372
Nhe I GCTAGC 100 100 014
Nla III CATG 61111 262226 15181183
Nla IV GGNNCC 61114 2466 1882178
Not I GCGGCCGC 100 000 007
Nru I TCGCGA 000 121 055
Nsb I TGCGCA 122 410 11517
Nsp I RCATGY 233 406 63241
Nsp V TTCGAA 100 002 071
NspB II CMGCKG 566 6510 47595
Pac I TTAATTAA 000 000 101

赤字は、タカラバイオで販売している酵素です。
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制限酵素 認識配列* 切 断 部 位 数
pKF3 pUC19 pUC119 pBR322 ΦX174 ColE 1 M13mp18 λ Ad2
Pfl1108 I TCGTAG 011 202 21318
Ple I GAGTC(4/5) 246 4106 86140
PmaC I CACGTG 000 000 0310
Pme I GTTTAAAC 000 000 021
PpuM I RGGWCCY 000 200 0323
PshA I GACNNNNGTC 000 110 072
PshB I ATTAAT 133 120 7173
Psp1406 I AACGTT 223 430 273
Pst I CTGCAG 111 113 12830
Pvu I CGATCG 122 102 137
Pvu II CAGCTG 122 103 31524
RleA I CCCACA(12/9) 000 012 11826
Sac I GAGCTC 111 000 1216
Sac II CCGCGG 100 011 0433
Sal I GTCGAC 111 100 123
SanD I GGGWCCC 000 000 018
Sap I GCTCTTC(1/4) 011 111 0107
Sau3A I GATC 121515 22019 711687
Sca I AGTACT 111 101 055
ScrF I CCNGG 131212 16332 11184233
Sec I CCNNGG 855 868 9105234
SexA I ACCWGGT 000 010 059
SfaN I GCATC(5/9) 388 221226 716986
Sfe I CTRYAG 345 467 73847
Sfi I GGCCNNNNNGGCC 000 000 003
Sgf I GCGATCGC 000 001 001
SgrA I CRCCGGYG 000 100 066
Sim I GGGTC(-3/0) 234 865 44073
Sma I CCCGGG 111 001 1312
Smi I ATTTAAAT 000 000 101
Sml I CTYRAG 444 658 51729
SnaB I TACGTA 000 001 110
Spe I ACTAGT 200 000 003
Sph I GCATGC 111 100 168
Spl I CGTACG 100 022 014
Srf I GCCCGGGC 000 001 001
Sse8387 I CCTGCAGG 111 000 153
Sse8647 I AGGWCCT 000 000 008
Ssp I AATATT 112 113 6205
Sss I CG 147173210 329267361 32931132428
Stu I AGGCCT 100 012 0611
StyLT I CAGAG 766 8317 1912977
StySJ I GAGNNNNNNGTRC 011 100 0612
Taq I TCGA 1145 7109 1212150
Taq II GACCGA(11/9)CACCCA(11/9) 256 624 42836
Tat I WGTACW 122 205 52419
Tau I GCSGC 979 211711 7181232
Tfi I GAWTC 222 6119 198732
Tse I GCWGC 71213 211434 10199179
TspE I AATT 6710 82521 6418987
TspR I CAGTG(2/-7) 61010 12616 811983
Tsp4C I ACNGT 1589 141523 31187122
Tsp45 I GTSAC 145 9812 88173
Tth111 I GACNNNGTC 000 102 0212
Tth111 II CAARCA(11/9) 333 5118 74853
UbaD I GAACNNNNNNTCC 001 001 174
UbaE I CACCTGC 000 001 0129
Van91 I CCANNNNNTGG 200 220 01418
VpaK11B I GGWCC 122 814 13573
Xba I TCTAGA 111 000 115
Xcm I CCANNNNNNNNNTGG 000 000 01214
Xho I CTCGAG 100 010 016
Xmn I GAANNNNTTC 011 232 2245
Xsp I CTAG 545 534 51454

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