シングルセル自動調製システム
- イメージングによりシングルセルを自動判別し、ダブレットや空ウェル、死細胞を解析から排除
- 独自のPicoPLEX技術を用いたWGAにより、ハイスループットなscDNA-Seq解析を実現
- 最大100,000細胞から全長scRNA-Seqライブラリーを調製
- 5～100 μmの幅広い細胞サイズに対応
製品説明
Shastaシステムは、革新的なナノディスペンシング技術を採用し、より高精度で堅牢なシステムを実現しました。さらに、新しいサンプルバーコーディングフローにより、最大10万個の細胞をシングルセル解析することができます。ナノディスペンシング技術を使用した細胞の取得では、マイクロ流路タイプの手法と比較して、より広範囲な細胞サイズのサンプルの解析が可能です。Shastaシステムのテクノロジーにより、スプライシングアイソフォーム、遺伝子融合、染色体アームレベルのCNVなどのイベントを、これまで以上に多くの細胞で検出することができるようになりました。
最先端のナノディスペンシング技術と蛍光イメージング機構に合わせて、タカラバイオのNGSライブラリー前処理ケミストリーと包括的なデータ解析のためのバイオインフォマティクスツールを組み合わせたソリューションを提供します。また、 オープンシステムであるため、既存のアプリケーションを使用するだけでなく、独自のアプリケーションを開発することも可能です。
最先端のナノディスペンシング技術と蛍光イメージング機構に合わせて、タカラバイオのNGSライブラリー前処理ケミストリーと包括的なデータ解析のためのバイオインフォマティクスツールを組み合わせたソリューションを提供します。また、 オープンシステムであるため、既存のアプリケーションを使用するだけでなく、独自のアプリケーションを開発することも可能です。
特長
イメージングにより生きたシングルセルを自動判別
ナノウェルチップへの細胞分注後、システム本体に内蔵された蛍光顕微鏡により全5,184ウェルの画像を取得します。核を染色するHoechst（青色蛍光）と死細胞を染色するPI（Propidium Iodide、赤色蛍光）を用いて細胞を予め染色しておくことで、専用のCellSelectソフトウェアにより画像を解析し、生きたシングルセルを含むウェルのみを自動判別します。選択したウェルのみにRT試薬を分注し、後の反応に進むことができるため、シングルセル解析で問題となるダブレットや空ウェル、死細胞を判別し、シーケンスを行う前に解析から排除することができます＊ 。また、サンプル処理中の細胞懸濁液やチップ上の反応液の蒸発を防止するため、システムには加湿機能が搭載されています。
＊ Shasta Total RNA-Seq Kitでは、固定した細胞を用いるため、生細胞の選択は行われません。
心筋細胞などのサイズの大きな細胞のシングルセル化も可能
5～100 μmのさまざまな大きさの細胞に対応しており、心筋細胞などのサイズの大きな細胞のシングルセル化も可能にします。
＜実施例＞ナノウェル内でシングルセル化されたマウス成体由来の心筋細胞（約100 μm）
細胞はHoechstおよびCellTracker Redで染色。
※データご提供 ： マックス・プランク研究所 Stefan Günther博士
ナノウェルチップへの細胞分注後、システム本体に内蔵された蛍光顕微鏡により全5,184ウェルの画像を取得します。核を染色するHoechst（青色蛍光）と死細胞を染色するPI（Propidium Iodide、赤色蛍光）を用いて細胞を予め染色しておくことで、専用のCellSelectソフトウェアにより画像を解析し、生きたシングルセルを含むウェルのみを自動判別します。選択したウェルのみにRT試薬を分注し、後の反応に進むことができるため、シングルセル解析で問題となるダブレットや空ウェル、死細胞を判別し、シーケンスを行う前に解析から排除することができます＊ 。また、サンプル処理中の細胞懸濁液やチップ上の反応液の蒸発を防止するため、システムには加湿機能が搭載されています。
＊ Shasta Total RNA-Seq Kitでは、固定した細胞を用いるため、生細胞の選択は行われません。
心筋細胞などのサイズの大きな細胞のシングルセル化も可能
5～100 μmのさまざまな大きさの細胞に対応しており、心筋細胞などのサイズの大きな細胞のシングルセル化も可能にします。
＜実施例＞ナノウェル内でシングルセル化されたマウス成体由来の心筋細胞（約100 μm）
細胞はHoechstおよびCellTracker Redで染色。
※データご提供 ： マックス・プランク研究所 Stefan Günther博士
様々なアプリケーションに対応
Shasta Whole-Genome Amplification Kit
ゴールドスタンダードのPicoPLEX技術を用いたWGAキット。プレートベースのアッセイを大幅に上回る最大1,500 細胞／runのハイスループット解析を実現Shasta Total RNA-Seq Kit
1回の反応で5,000～100,000細胞から全長RNA-Seqライブラリーを調製し、non-coding RNAを含む全長転写産物のシングルセル解析を実現SMART-Seq Pro Application Kit - 2 Chip
単離した単一細胞由来のmRNA転写産物の全長配列情報から全長トランスクリプトームを解析を実施製品仕様
Shasta Single Cell System
Shastaモジュール：シングルセル自動調製システム本体
Chip Cycler：ナノウェルチップ専用サーマルサイクラー
| 制御コンピュータ（内蔵） | Single board computer with Windows 11 |
| 分注ボリューム | 35 nl, 50 nl, or 100 nl per nanowell |
| 分注パターン | 12x12, 24x24, 36x36, 48x48, 60x60, 72x72 |
| サイズ（幅×奥行×高さ） | 820 mm × 560 mm × 610 mm |
| 重量 | 約109 kg |
| 電源 | 100-240 VAC, 50/60 Hz |
Chip Cycler：ナノウェルチップ専用サーマルサイクラー
| 温度制御範囲 | 4～100.0℃ |
| 加熱冷却方式 | ペルチェ素子 |
| サイズ（幅×奥行×高さ） | 260 mm × 470 mm × 230 mm |
| 重量 | 約9 kg |
| 電源 | 100-150 VAC, 50/60 Hz. 220-240VAC, 50/60 Hz |
内容
Shasta Single Cell System（製品コード 640282）
| Shasta Single Cell Crate Component | 一式 |
| Single-Cell Loading Kit（製品コード 640206） | 3 Kit |
| Single-Cell Collection Kit（製品コード 640212） | 3 Kit |
| Nanodispenser 384-Well Source Plate and Seal（製品コード 640018） | 1 Kit |
| Second Diluent 100X | 1 Kit |
| Single-Cell 350v Chip（製品コード 640019） | 3 Chip |
| SMART-Seq Pro Reagent Kit | 1 Kit |
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SMART-Seq® Single Cell Kit
最高感度のシングルセル全長mRNA-Seq解析
- 注意事項
- 本製品は理化学機器またはソフトウェアとなります。
- お客様自身が装置の修理または分解や改造（付属品以外のソフトウェアの使用やコンピューターウィルスの感染等を含む）を行った場合、ならびに、本製品の取扱説明書に記載の内容を無視して装置を使用した場合には、タカラバイオは保証に基づくすべての義務とそれによって生じたいかなる損害についても責任を負いません。
- タカラバイオの承認を得ずに製品の再販・譲渡、再販・譲渡のための改変、商用製品の製造に使用することは禁止されています。
- タカラバイオ製品に関連するライセンス・パテントについては、ライセンスマークをクリックして内容をご確認ください。
また、他メーカーの製品に関するライセンス・パテントについては、各メーカーのウェブサイトまたはメーカー発行のカタログ等でご確認ください。 - ウェブサイトに掲載している会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
